CD47

CD47
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2JJS, 2JJT, 2VSC, 4CMM, 4KJY, 5IWL

Identifiants
AliasesCD47
IDs externesOMIM: 601028 MGI: 96617 HomoloGene: 1346 GeneCards: CD47
Position du gène (Homme)
Chromosome 3 humain
Chr.Chromosome 3 humain[1]
Chromosome 3 humain
Localisation génomique pour CD47
Localisation génomique pour CD47
Locus3q13.12Début108,043,091 bp[1]
Fin108,091,862 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 16 (souris)
Chr.Chromosome 16 (souris)[2]
Chromosome 16 (souris)
Localisation génomique pour CD47
Localisation génomique pour CD47
Locus16|16 B5Début49,620,896 bp[2]
Fin49,735,373 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • palpebral conjunctiva

  • germinal epithelium

  • pleura viscéral

  • right uterine tube

  • pancreatic epithelial cell

  • Brodmann area 23

  • tibia

  • pancreatic ductal cell

  • gyrus postcentral

  • pont
Fortement exprimé dans
  • sang

  • medial dorsal nucleus

  • gyrus cingulaire

  • Corps géniculé latéral

  • nerf ischiatique

  • Vermis du cervelet

  • rate

  • poumon droit

  • corps ciliaire

  • poumon gauche
Plus de données d'expression de référence
BioGPS




Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • thrombospondin receptor activity
  • liaison protéique
  • protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion
  • cell-cell adhesion mediator activity
Composant cellulaire
  • integral component of membrane
  • membrane plasmique
  • integral component of plasma membrane
  • membrane
  • specific granule membrane
  • tertiary granule membrane
  • exosome
  • surface cellulaire
Processus biologique
  • integrin-mediated signaling pathway
  • positive regulation of phagocytosis
  • adhésion cellulaire
  • extracellular matrix organization
  • positive regulation of inflammatory response
  • positive regulation of T cell activation
  • response to bacterium
  • leukocyte migration
  • positive regulation of cell population proliferation
  • opsonisation
  • positive regulation of cell-cell adhesion
  • neutrophil degranulation
  • migration cellulaire
  • regulation of interferon-gamma production
  • regulation of interleukin-10 production
  • regulation of interleukin-12 production
  • regulation of interleukin-6 production
  • regulation of tumor necrosis factor production
  • heterotypic cell-cell adhesion
  • monocyte extravasation
  • regulation of nitric oxide biosynthetic process
  • positive regulation of stress fiber assembly
  • cellular response to interferon-gamma
  • cellular response to interleukin-1
  • cellular response to interleukin-12
  • cell-cell adhesion
  • negative regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

961

16423

Ensembl

ENSG00000196776

ENSMUSG00000055447

UniProt

Q08722

Q61735

RefSeq (mRNA)

NM_001025079
NM_001025080
NM_001777
NM_198793
NM_001382306

NM_010581
NM_001368415
NM_001368416
NM_001368417
NM_001368418

RefSeq (protéine)

NP_001768
NP_942088
NP_001369235

NP_034711
NP_001355344
NP_001355345
NP_001355346
NP_001355347

Localisation (UCSC)Chr 3: 108.04 – 108.09 MbChr 16: 49.62 – 49.74 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le CD47 est une protéine de type cluster de différenciation. Son gène, CD47 est situé sur le chromosome 3 humain.

Rôle

Il interagit avec le SIRPα situé sur la membrane des macrophages et inhibe la phagocytose[5].

En médecine

Il est exprimé sur certaines cellules des leucémies myéloïdes[5] ainsi que sur celles des lymphomes non hodgkiniens[6]. Cette expression est corrélé avec un plus mauvais pronostic[7], ce qui en constitue une cible thérapeutique.

Un anticorps monoclonal dirigé contre le CD47 a été utilisé en combinaison avec le rituximab dans certaines lymphomes résistants, donnant des résultats prometteurs quant au taux de réponse[8].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196776 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000055447 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. a et b Jaiswal S, Jamieson CH, Pang WW et al. CD47 is upregulated on circulating hematopoietic stem cells and leukemia cells to avoid phagocytosis, Cell, 2009;138:271-285
  6. Chao MP, Alizadeh AA, Tang C et al. Anti-CD47 antibody synergizes with rituximab to promote phagocytosis and eradicate non-Hodgkin lymphoma, Cell, 2010;142:699-713
  7. Majeti R, Chao MP, Alizadeh AA et al. CD47 is an adverse prognostic factor and therapeutic antibody target on human acute myeloid leukemia stem cells, Cell, 2009;138:286-299
  8. Advani R, Flinn I, Popplewell L et al. CD47 blockade by Hu5F9-G4 and rituximab in non-Hodgkin’s lymphoma, N Engl J Med, 2018;379:1711-1721
  • icône décorative Portail de la biologie cellulaire et moléculaire
  • icône décorative Portail de la médecine