Hibecovirus
Hibecovirus
| Domaine | Riboviria |
|---|---|
| Règne | Orthornavirae |
| Embranchement | Pisuviricota |
| Classe | Pisoniviricetes |
| Ordre | Nidovirales |
| Sous-ordre | Cornidovirineae |
| Famille | Coronaviridae |
| Sous-famille | Orthocoronavirinae |
| Genre | Betacoronavirus |
Sous-genre
Hibecovirus est un sous-genre de bétacoronavirus constituant une branche du cladogramme des bétacoronavirus représentée par une seule espèce connue :
- Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013[1],[2], un coronavirus collecté sur la chauve-souris frugivore Hipposideros pratti.
Ce virus se distingue par sa structure génomique qui contient un cadre de lecture ouvert ORF2 entre les séquences ORF1ab et le gène S.
Position phylogénétique
| β-CoV[3] |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Notes et références
- ↑ a b et c (en) « Virus Taxonomy: 2019 Release », ICTV, (consulté le ).
- ↑ Wu Zhiqiang et al., Deciphering the bat virome catalog to better understand the ecological diversity of bat viruses and the bat origin of emerging infectious diseases, 2016. DOI 10.1038/ismej.2015.138
- ↑ DOI 10.1186/s44149-021-00005-9
- ↑ DOI 10.1128/JVI.01600-13
- ↑ DOI 10.1073/pnas.0506735102
- ↑ Shin Murakami, Tomoya Kitamura, Jin Suzuki, Ryouta Sato, Toshiki Aoi, Marina Fujii, Hiromichi Matsugo, Haruhiko Kamiki, Hiroho Ishida, Akiko Takenaka-Uema, Masayuki Shimojima et Taisuke Horimoto, « Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan », Emerging Infectious Diseases, vol. 26, no 12, , p. 3025–3029 (DOI 10.3201/eid2612.203386)
- ↑ Tommy Tsan-Yuk Lam, Na Jia, Ya-Wei Zhang, Marcus Ho-Hin Shum, Jia-Fu Jiang, Hua-Chen Zhu, Yi-Gang Tong, Yong-Xia Shi, Xue-Bing Ni, Yun-Shi Liao, Wen-Juan Li, Bao-Gui Jiang, Wei Wei, Ting-Ting Yuan, Kui Zheng, Xiao-Ming Cui, Jie Li, Guang-Qian Pei, Xin Qiang, William Yiu-Man Cheung, Lian-Feng Li, Fang-Fang Sun, Si Qin, Ji-Cheng Huang, Gabriel M. Leung, Edward C. Holmes, Yan-Ling Hu, Yi Guan et Wu-Chun Cao, « Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins », Nature, vol. 583, no 7815, , p. 282–285 (DOI 10.1038/s41586-020-2169-0)
- ↑ Ping Liu, Jing-Zhe Jiang, Xiu-Feng Wan, Yan Hua, Linmiao Li, Jiabin Zhou, Xiaohu Wang, Fanghui Hou, Jing Chen, Jiejian Zou et Jinping Chen, « Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)? », PLOS Pathogens, vol. 16, no 5, , e1008421 (DOI 10.1371/journal.ppat.1008421)
- ↑ a et b (en) Vibol Hul, Deborah Delaune, Erik A. Karlsson, Alexandre Hassanin, Putita Ou Tey, Artem Baidaliuk, Fabiana Gámbaro, Vuong Tan Tu, Lucy Keatts, Jonna Mazet, Christine Johnson, Philippe Buchy, Philippe Dussart, Tracey Goldstein, Etienne Simon-Lorière et Veasna Duong, « A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia », sur bioRxiv, (DOI 10.1101/2021.01.26.428212), p. 2021.01.26.428212
- ↑ S Wacharapluesadee, CW Tan, P Maneeorn, P Duengkae, F Zhu, Y Joyjinda, T Kaewpom, WN Chia, W Ampoot, BL Lim, K Worachotsueptrakun, VC Chen, N Sirichan, C Ruchisrisarod, A Rodpan, K Noradechanon, T Phaichana, N Jantarat, B Thongnumchaima, C Tu, G Crameri, MM Stokes, T Hemachudha et LF Wang, « Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia. », Nature Communications, vol. 12, no 1, , p. 972 (PMID 33563978, PMCID 7873279, DOI 10.1038/s41467-021-21240-1)
- ↑ H Zhou, X Chen, T Hu, J Li, H Song, Y Liu, P Wang, D Liu, J Yang, EC Holmes, AC Hughes, Y Bi et W Shi, « A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein. », Current biology : CB, vol. 30, no 11, , p. 2196-2203.e3 (PMID 32416074, DOI 10.1016/j.cub.2020.05.023)
- ↑ « Addendum: A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin », Nature, vol. 588, no 7836, , E6 (PMID 33199918, DOI 10.1038/s41586-020-2951-z, lire en ligne)
v · m Coronaviridae (famille des coronavirus) | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ordre : Nidovirales | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Alphaletovirus (en) |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| Alphacoronavirus |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| Betacoronavirus |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| Deltacoronavirus |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| Gammacoronavirus |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| Alphapironavirus |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
Portail de la virologie
