IRF5

IRF5
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

3DSH

Identifiants
AliasesIRF5
IDs externesOMIM: 607218 MGI: 1350924 HomoloGene: 8088 GeneCards: IRF5
Position du gène (Homme)
Chromosome 7 humain
Chr.Chromosome 7 humain[1]
Chromosome 7 humain
Localisation génomique pour IRF5
Localisation génomique pour IRF5
Locus7q32.1Début128,937,457 bp[1]
Fin128,950,038 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 6 (souris)
Chr.Chromosome 6 (souris)[2]
Chromosome 6 (souris)
Localisation génomique pour IRF5
Localisation génomique pour IRF5
Locus6 A3.3|6 12.36 cMDébut29,526,624 bp[2]
Fin29,541,870 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • monocyte

  • rate

  • sang

  • cellule de la moelle osseuse

  • ganglion lymphatique

  • upper lobe of left lung

  • right uterine tube

  • artère coronaire droite

  • appendice iléo-cæcal

  • skin of abdomen
Fortement exprimé dans
  • rate

  • lèvre

  • female urethra

  • proximal tubule

  • œsophage

  • sang

  • thymus

  • subcutaneous adipose tissue

  • morula

  • left lobe of liver
Plus de données d'expression de référence
BioGPS


Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • liaison ADN
  • DNA-binding transcription factor activity
  • liaison protéique
  • DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
  • sequence-specific DNA binding
  • identical protein binding
  • DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • cytosol
  • noyau
Processus biologique
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • positive regulation of interleukin-12 production
  • interferon-gamma-mediated signaling pathway
  • processus du système immunitaire
  • regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of interferon-alpha production
  • response to muramyl dipeptide
  • transcription, DNA-templated
  • defense response to virus
  • type I interferon signaling pathway
  • response to peptidoglycan
  • positive regulation of apoptotic process
  • système immunitaire inné
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of interferon-beta production
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • transcription by RNA polymerase II
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

3663

27056

Ensembl

ENSG00000128604

ENSMUSG00000029771

UniProt

Q13568

P56477

RefSeq (mRNA)
NM_001098627
NM_001098629
NM_001098630
NM_001242452
NM_032643

NM_001347928
NM_001364314

NM_001252382
NM_012057
NM_001311083

RefSeq (protéine)
NP_001092097
NP_001092099
NP_001092100
NP_001229381
NP_116032

NP_001334857
NP_001351243
NP_001092099.1

NP_001239311
NP_001298012
NP_036187

Localisation (UCSC)Chr 7: 128.94 – 128.95 MbChr 6: 29.53 – 29.54 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'IRF (pour « Interferon regulatory factor 5 ») est une protéine de la famille des facteurs de régulation de l'interféron, avec un rôle de facteur de transcription. Son gène est IRF5 situé sur le Chromosome 7 humain.

Rôles

il augmente l'expression des sous-unités es interleukines 12 et 23 et diminue celle de l'interleukine 10[5].

Il favorise la résistance à l'insuline et modifie la répartition des graisses[6].

Son inhibition pourrait améliorer la cicatrisation cardiaque après un infarctus du myocarde[7].

Dans l'athérome, il aurait un rôle pro-inflammatoire et inhiberait l'efférocytose[8].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128604 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000029771 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Krausgruber T, Blazek K, Smallie T et al. IRF5 promotes inflammatory macrophage polarization and TH1-TH17 responses, Nat Immunol, 2011;12:231–238
  6. Dalmas E, Toubal A, Alzaid F et al. Irf5 deficiency in macrophages promotes beneficial adipose tissue expansion and insulin sensitivity during obesity, Nat Med, 2015;21:610–618
  7. Courties G, Heidt T, Sebas M et al. In vivo silencing of the transcription factor IRF5 reprograms the macrophage phenotype and improves infarct healing, J Am Coll Cardiol, 2014;63:1556–1566
  8. Seneviratne AN, Edsfeldt A, Cole JE et al. Interferon Regulatory Factor 5 controls necrotic core formation in atherosclerotic lesions by impairing efferocytosis, Circulation, 2017;136:1140-1154
v · m
Ligand
Récepteurs aux cytokines (en)
  • Type I cytokine receptor (en)
  • Type II cytokine receptor (en)
Janus kinase
Protéines adaptatrices
STAT
PIAS (en)
  • PIAS1 (en)
  • PIAS2 (en)
  • PIAS3 (en)
  • PIAS4 (en)
SOCS
  • 1
  • (en)
  • (en)
  • (en)
  • (en)
  • (en)
  • (en)
  • CISH (en)
IRF
  • IRF1 (en)
  • IRF2 (en)
  • IRF3
  • IRF4
  • IRF5
  • IRF6 (en)
  • IRF7 (en)
  • IRF8
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