アグマチナーゼ

アグマチナーゼ
識別子
EC番号 3.5.3.11
CAS登録番号 37289-16-0
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MetaCyc metabolic pathway
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アグマチナーゼ(Agmatinase, EC 3.5.3.11)は、以下の化学反応触媒する酵素である。

アグマチン + {\displaystyle \rightleftharpoons } プトレシン + 尿素

従って、この酵素の基質はアグマチンと水の2つ、生成物はアグマチンと尿素の2つである。

この酵素は、特にペプチド結合以外の炭素-窒素結合、特に鎖状アミジンに作用する加水分解酵素に分類される。系統名は、アグマチン アミジノヒドロラーゼ(Agmatine amidinohydrolase)である。アグマチンウレオヒドロラーゼ(agmatine ureohydrolase)やSpeBと呼ばれることもある。尿素回路の一部を構成している。

遺伝子

ヒトでは、この酵素はAGMAT遺伝子でコードされている[1][2][3][4]

構造

2007年5月時点で、5つの三次構造が解明されている。蛋白質構造データバンクのアクセッションコードは、1GQ6、1GQ7、1WOG、1WOH及び1WOIである。

阻害剤

  • ピペラジン-1-カルボキシアミジン

出典

  1. ^ “Cloning of human agmatinase. An alternate path for polyamine synthesis induced in liver by hepatitis B virus”. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 282 (2): G375–81. (Jan 2002). doi:10.1152/ajpgi.00386.2001. PMID 11804860. 
  2. ^ “Human agmatinase is diminished in the clear cell type of renal cell carcinoma”. Int J Cancer 108 (3): 342–7. (Dec 2003). doi:10.1002/ijc.11459. PMID 14648699. 
  3. ^ “Cloning and characterization of human agmatinase”. Mol Genet Metab 75 (3): 209–18. (Mar 2002). doi:10.1006/mgme.2001.3277. PMID 11914032. 
  4. ^ “Entrez Gene: AGMAT agmatine ureohydrolase (agmatinase)”. 2023年11月23日閲覧。
  • Morris SM (2004). “Vertebrate agmatinases: what role do they play in agmatine catabolism?”. Ann. N. Y. Acad. Sci. 1009: 30–3. doi:10.1196/annals.1304.003. PMID 15028567. 
  • “Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides.”. Gene 138 (1–2): 171–4. (1994). doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. 
  • “Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library”. Gene 200 (1–2): 149–56. (1997). doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. 
  • “Differential gene expression in apoptosis: identification of ribosomal protein 23K, a cell proliferation inhibitor”. Mol. Genet. Metab. 64 (4): 271–82. (1998). doi:10.1006/mgme.1998.2718. PMID 9758718. 
  • “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. (2003). Bibcode: 2002PNAS...9916899M. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC139241/. 
  • “Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs”. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. (2004). doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039. 
  • “The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. (2004). doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC528928/. 
  • “Expression, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of human agmatinase”. Acta Crystallographica Section F 61 (Pt 10): 889–91. (2006). doi:10.1107/S1744309105027193. PMC 1991308. PMID 16511187. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1991308/. 
  • “The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1”. Nature 441 (7091): 315–21. (2006). Bibcode: 2006Natur.441..315G. doi:10.1038/nature04727. PMID 16710414. 
  • “Isolation and Characterization of a Mutant of Escherichia coli Blocked in the Synthesis of Putrescine”. J. Bacteriol. 101 (3): 725–30. (1970). doi:10.1128/JB.101.3.725-730.1970. PMC 250384. PMID 4908780. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC250384/. 
  • “Preparation and properties of agmatine amidinohydrolase of Evernia prunastri”. Physiol. Plant. 55: 335–339. (1982). doi:10.1111/j.1399-3054.1982.tb00301.x. 
  • agmatinase - MeSHアメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス(英語)

外部リンク

  • Human AGMAT genome location and AGMAT gene details page in the UCSC Genome Browser.