Tip I topoizomeraza

Tip I topoizomeraze presecaju jedan lanac dvolančane DNK, relaksiraju molekul, i ponovno spajaju lance.[1][2] One se dalje dele u dve strukturno i mehanistički distinktne topoizomeraze: tip IA i tip IB.

  • Tip IA topoizomeraze menjaju koeficijent povezivanja cirkularnog DNK lanca za jednu jedinicu.
  • Tip IB topoizomeraze menjaju koeficijent povezivanja za više jedinica .

Istorijski, tip IA topoizomeraze se nazivaju prokariotiske topoizomeraze I, dok se tip IB topoizomeraze nazivaju eukariotske topoizomeraze. Ova distinkcija, međutim nije više primenljiva jer tip IA i tip IB topoizomeraze postoje u svim domenima života.

Funkcionalno, te podklase izvode veoma specijalizovane funkcije. Prokariotska topoizomeraza I (topo IA) može jedino da relaksira negativno supernamotavanje DNK, dok eukariotska topoizomeraza I (topo IB) može da uvede pozitivno supernamotavanje jednolančane DNK, i njenu relaksaciju.

Reference

  1. Champoux JJ (2001). „DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism”. Annu. Rev. Biochem. 70: 369–413. DOI:10.1146/annurev.biochem.70.1.369. PMID 11395412. 
  2. „National Academy of Sciences: NAS Award in Molecular Biology”. National Academy of Science. Pristupljeno 07. 01. 2009. 

Literatura

  • Nicholas C. Price, Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third izd.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 izd.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C, Tooze J.. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN: 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 izd.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • Robert A. Copeland (2013). Evaluation of Enzyme Inhibitors in Drug Discovery: A Guide for Medicinal Chemists and Pharmacologists (2nd izd.). Wiley-Interscience. ISBN 111848813X. 
  • Gerhard Michal, Dietmar Schomburg (2012). Biochemical Pathways: An Atlas of Biochemistry and Molecular Biology (2nd izd.). Wiley. ISBN 0470146842. 

Spoljašnje veze

  • MeSH DNA+Topoisomerases,+Type+I
  • p
  • r
  • u
Izomeraze: Topoizomeraze (EC 5.99)
5.99.1
Tip I topoizomeraza - Tip II topoizomeraza (giraza, topoizomeraza IV)
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Proteini: enzimi
Teme
Aktivno mesto  • Alosterna regulacija  • Mesto vezivanja  • Katalitički perfektan enzim  • Koenzim  • Kofaktor  • Kooperativnost  • EC broj  • Enzimska kataliza  • Inhibicija enzima  • Enzimska kinetika  • Lajnviver–Burk dijagram  • Mihaelis–Mentenova kinetika  • Spisak enzima
Tipovi
EC1 Oksidoreduktaze/spisak  • EC2 Transferaze/spisak  • EC3 Hidrolaze/spisak  • EC4 Lijaze/spisak  • EC5 Izomeraze/spisak  • EC6 Ligaze/spisak
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6