APG III sistemi

Kapalı tohumluların basitleştirilmiş filogenetik haritası (İspanyolca)

APG III sistemi, uzun adıyla "bitkilerde (Evrimsel Kapalı Tohumlu Gelişimi Topluluğu III sistemi)" bu topluluğun APG II sistemi sonrası bulunan yenilikler neticesi 2009'da ortaya çıkardığı, bu sistemin modifiye edilmiş üçüncü ve halen günümüz için geçerli bir versiyonudur. Bu sistem bu sefer modern teknik ve çoğunlukla moleküler filogenetik moleküler biyolojiden yararlanılarak ortaya çıkarılmış bir sınıflandırmadır. APG II siteminden 6,5 ve hepsinin atası APG Sistemi'nden 11 yıl sonra yapılan güncellemelerle sistem bugün geçerli 3. halini almıştır.[1][2][3]

Bu yeni sistemi açıklayan bu yayından hemen ardından 2 tane Botanical Journal of the Linnean Society dergisinin aynı sayısında takip eden makaleye yer verilmiştir. Bunlardan ilki Chase & Reveal adlı iki yazarca yayınlanan bütün kara bitkilerinin APG III sistemine göre resmi filogenetik sınıflandırılmasıdır. Linnaneas'ın mevcut sınıflandırması ile APG sistemi arasında bir uyum sağlama peşinde bir makaledir. Bütün kara bitkileri Equisitopsida sınıfına alınıp 16 alt sınıfa bölünmüştür. (İçinde bütün çiçekli bitkiler (Magnoliidae'de dahil) bulunmaktadır.[4] İkincisi Haston adlı bir botanist tarafından yazılan et al. adlı makaledir, APG III sistemine (LAPG III)göre ailelerin doğrusal sıralamalarını vermektedir. 413 kabul edilmiş aile ile ilgili olarak çeşitli bitki müzesi katılımcıları ve gönüllü flora çalışmalarının kullanılmasına onay veren kişilerin çalışmaları bir araya getirilip düzenlenilerek APG III sistemi dahilinde bu sıralamalar yapılmıştır.[5]

APG III sistemi hakkında genel bilgiler

The APG III sistemi eski APG II sistemindeki 45 takım yanında 14 tanede yeni takım öngörmüştür. Yanlışlıkla diğer eski APG sistemlerinde yer alan Ceratophyllales yeni bir takımmış gibi lanse edilmiştir. Bu hata haricinde sınıflandırmada geçen yeni takım adları şunlardır:

Amborellales, Nymphaeales, Chloranthales, Petrosaviales, Trochodendrales, Buxales, Vitales, Zygophyllales, Picramniales, Huerteales, Berberidopsidales, Escalloniales, Bruniales ve Paracryphiales.

Alternatif opsiyonel parantez familya uygulaması APG III sisteminde terk edilmiştir zira önceki sistemde bu alternatif familyalar pek ilgi görmemiştir. APG III 413 familyayı tanır ve bu önceki sistemden 44 adet eksiktir, 55 parantez familya uygulamasına son verildiği gibi 18 familya adı da artık kullanılmamak üzere kaldırılmıştır.

Artık devam etmeyen parantez familyalar:

Illiciaceae, Alliaceae, Agapanthaceae, Agavaceae, Aphyllanthaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Laxmanniaceae, Ruscaceae, Themidaceae, Asphodelaceae, Hemerocallidaceae, Kingdoniaceae, Fumariaceae, Pteridophyllaceae, Didymelaceae, Tetracentraceae, Pterostemonaceae, Hypseocharitaceae, Francoaceae, Memecylaceae, Lepuropetalaceae, Rhoipteleaceae, Medusagynaceae, Quiinaceae, Malesherbiaceae, Turneraceae, Bretschneideraceae, Diegodendraceae, Cochlospermaceae, Peganaceae, Tetradiclidaceae, Nyssaceae, Ternstroemiaceae, Pellicieraceae, Aucubaceae, Donatiaceae, Lobeliaceae, Desfontainiaceae, Diervillaceae, Dipsacaceae, Linnaeaceae, Morinaceae ve Valerianaceae.

Artık sistemde yer verilmeyen sınıflandırmadan tamamen çıkarılan 18 familya :

Limnocharitaceae, Luzuriagaceae, Sparganiaceae, Ledocarpaceae, Heteropyxidaceae, Psiloxylaceae, Oliniaceae, Rhynchocalycaceae, Parnassiaceae, Maesaceae, Myrsinaceae, Theophrastaceae, Eremosynaceae, Polyosmaceae, Tribelaceae, Aralidiaceae, Mackinlayaceae ve Melanophyllaceae.

Eski 2 sistemde de bulunmayan 19 yeni familyaya ise APG III sistemi yer vermiştir az miktardaki familyalar ise farklı yerlere alınarak yeri değiştirilmiştir. sitemdeki yeni familyalar:Petermanniaceae, Schoepfiaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae, Talinaceae, Anacampserotaceae, Centroplacaceae, Calophyllaceae, Guamatelaceae, Gerrardinaceae, Dipentodontaceae, Capparidaceae, Cleomaceae, Cytinaceae, Mitrastemonaceae, Metteniusaceae, Linderniaceae ve Thomandersiaceae.

Hiçbir takımda bulunmayan familya sayısı 39'dan 10'a düşürülmüştür ve Kapalı tohumlular ile incertae sedis(Latince kelimedir.Türkçesi: Emin olunamayan yerleştirme-sıralama), arasına Apodanthaceae ve Cynomoriaceae adlı kapalı tohumlularda yeri belirsiz 2 ayrı familya konulmuştur. Kalan 8 tane familya ise incertae sedis olarak çeşitli kapalı tohumlular takım gruplarına dağıtılmıştır. Yeri belirsiz familyalar:

Apodanthaceae, Cynomoriaceae, Dasypogonaceae, Sabiaceae, Dilleniaceae, Icacinaceae, Metteniusaceae, Oncothecaceae, Vahliaceae ve Boraginaceae dir.

Icacinaceae familyasının taksonomik sınırlaması hala belirsizliğini korumaktadır; Apodytes, Emmotum, Cassinopsis ve az miktarda bir kısım cins bundan sonraki bilimsel çalışmalar nereye ait olduğunu tespit edene kadar geçici olarak bu familya içine konmuştur.

3 cins (Gumillea (APG siteminde vardı;APG II sisteminde kaldırılmıştı şimdi tekrar konuldu) ve Nicobariodendron ile Petenaea) (bunlar ise yeni eklendi) incertae sedis olarak kapalı tohumlularda yer verildi. Ancak bu yayınlardan sonra Petenaea için Petenaeaceae adlı kendi familyası oluşturularak uzaktan yakınlığı saptanan Huerteales takımına alındı.[6][7]

2 model halinde bu sınıflandırma gösterilmiştir. Özet modellemede sadece dal (klad) ve takımlar gösterilmiştir. Detaylı modelde ise alfabetik sıralama ile takımlar ve familyalar detaylı gösterilmiştir. Kalan detaylar için aşağıda gösterilen filogenetik ağaca bakın.

Özet Model

  • Angiosperms (kapalı tohumlular) dalı (klad)
    Amborellales takımı
    Nymphaeales takımı
    Austrobaileyales takımı
    Chloranthales takımı
    magnoliids dalı (klad)
    Canellales takımı
    Laurales takımı
    Magnoliales takımı
    Piperales takımı
    Monocots (bir çenekliler) dalı (klad)
    Acorales takımı
    Alismatales takımı
    Asparagales takımı
    Dioscoreales takımı
    Liliales takımı
    Pandanales takımı
    Petrosaviales takımı
    commelinids dalı
    Dasypogonaceae familyası—bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Arecales takımı
    Commelinales takımı
    Poales takımı
    Zingiberales takımı
    iki çeneklilerin muhtemelen kardeşi
    Ceratophyllales takımı
    Eudicots (iki çenekliler) dalı (klad)
    Sabiaceae familyası – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Buxales takımı
    Proteales takımı
    Ranunculales takımı
    Trochodendrales takımı
    core eudicots (Gerçek iki çenekliler) dalı
    Dilleniaceae familyası – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Gunnerales takımı
    Saxifragales takımı
    dalı rosids
    Vitales takımı
    fabids dalı (eurosids I)
    Celastrales takımı
    Cucurbitales takımı
    Fabales takımı
    Fagales takımı
    Malpighiales takımı
    Oxalidales takımı
    Rosales takımı
    Zygophyllales takımı
    malvids dalı (eurosids II)
    Brassicales takımı
    Crossosomatales takımı
    Geraniales takımı
    Huerteales takımı
    Malvales takımı
    Myrtales takımı
    Picramniales takımı
    Sapindales takımı
    (core eudicots lara geri dönüş)
    Berberidopsidales takımı
    Caryophyllales takımı
    Santalales takımı
    asterids dalı
    Cornales takımı
    Ericales takımı
    lamiids dalı (euasterids I)
    Boraginaceae familyası (Hodangiller) – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Vahliaceae familyası – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Icacinaceae familyası – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Metteniusaceae familyası – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Oncothecaceae familyası – bir takım içinde yer verilmemiştir.
    Garryales takımı
    Gentianales takımı
    Lamiales takımı
    Solanales takımı
    campanulids dalı (euasterids II)
    Apiales takımı
    Aquifoliales takımı
    Asterales takımı
    Bruniales takımı
    Dipsacales takımı
    Escalloniales takımı
    Paracryphiales takımı

Ayrıntılı Model (bütün familyalar ile birlikte)

Lale çiçeği, Monocots (Bir çenekliler) dalı,Liliales takımı, Liliaceae (Zambakgiller) familyası, Tulipa cinsindendir.
Magnolia watsoni çiçeği,Magnoliids dalı içinde,Magnoliales takımı üyesi.
Lilium henryi çiçeği, Bir çenekliler dalında,Liliales takımı üyesi .
Oxalis regnellii çiçeği,fabids dalı içinde oxalidales takımı üyesi.
Büyük ebegümeci çiçeği,malvids dalı içinde malvales takımı üyesi.
Lavanta çiçeği, lámiids dalı lamiales takımı üyesi.
Yıldızpatı çiçekleri,asterids dalından campanulids dalı asterales takımı Asteraceae familyası üyesidir.

İşaretler: * = Yeni familya yerleştirmeleri
† = APG sisteminde yeni tanınan takım;
§ = metinde belirtilen yeni familyalarr;
$ = APG II sistemi içinde daha geniş kapsamlı kullanılabilirlik seçeneği mevcut aileler tercih edilmiştir;
$$ = kare parantez içinde APG II sistemi içindeki familyaların yakınındaki derecelendirmeler tercih edilmiştir.

Angiosperms (Kapalı tohumlular)

  • †Amborellales Melikyan, A.V.Bobrov & Zaytzeva
  • †Nymphaeales Salisb. ex Bercht. & J.Presl
  • Austrobaileyales Takht. ex Reveal
    • Austrobaileyaceae Croizat
    • $Schisandraceae Blume (Illiciaceae A.C.Sm.'yi içine alır.)
    • Trimeniaceae L.S.Gibbs
  • †Chloranthales R.Br.
    • Chloranthaceae R.Br. ex Sims

Magnoliids

Monocots (Tek çenekliler)

Commelinids

  • Dasypogonaceae Dumort.
  • Arecales Bromhead
  • Commelinales Mirb. ex Bercht. & J.Presl
    • Commelinaceae Mirb.
    • Haemodoraceae R.Br.
    • Hanguanaceae Airy Shaw
    • Philydraceae Link
    • Pontederiaceae Kunth
  • Poales Small
    • Anarthriaceae D.F.Cutler & Airy Shaw
    • Bromeliaceae Juss. (Ananasgiller)
    • Centrolepidaceae Endl.
    • Cyperaceae Juss. (Papirüsgiller)
    • Ecdeiocoleaceae D.F.Cutler & Airy Shaw
    • Eriocaulaceae Martinov
    • Flagellariaceae Dumort.
    • Joinvilleaceae Toml. & A.C.Sm.
    • Juncaceae Juss.
    • Mayacaceae Kunth
    • Poaceae Barnhart (Buğdaygiller)
    • Rapateaceae Dumort.
    • Restionaceae R.Br.
    • Thurniaceae Engl.
    • §Typhaceae Juss. (Sparganiaceae Hanin'yi içine alır.)
    • Xyridaceae C.Agardh
  • Zingiberales Griseb.
    • Cannaceae Juss.
    • Costaceae Nakai
    • Heliconiaceae Vines
    • Lowiaceae Ridl.
    • Marantaceae R.Br.
    • Musaceae Juss. (Muzgiller)
    • Strelitziaceae Hutch.
    • Zingiberaceae Martinov (Zencefilgiller)

iki çeneklilerin muhtemelen kardeşi (probable sister of Eudicots)

  • Ceratophyllales Link
    • Ceratophyllaceae Gray

Eudicots (İki çenekliler)

Core eudicots (Gerçek iki çenekliler)

Rosids

Eurosids I

Eurosids II

Asterids

Euasterids I

Euasterids II

Durumu Belirsiz Sıralamalar

  • Apodanthaceae Takht. (3 cins)
  • Cynomoriaceae Endl. ex Lindl.
  • Gumillea Ruiz & Pav.
  • Petenaea Lundell (Malvales takımı içinde olduğu iddia edilmektedir.)
  • Nicobariodendron (bkz. Simmons, 2004; Celastraceae takımı içinde olduğu iddia edilmektedir).

Filojen

The APG III sistemi kapalı tohumlular için 59 takım ve 4 yer verilmemiş aileden oluşan finogenetik bir ağacı baz alır. Diğer 6 yeri belirsiz yerleştirme yapılmış aileye ise bu belirsiz konumdan ötürü ağacın polytomlerinde yer verilmez. Ayrıntılı modelleme üsttedir.

Aşağıdaki filogenetik ağaç APG III sistemine göre hazırlanıp yayınlanmıştır.[1] fakat bir kısım etiketlemeler buraya eklenmemiştir.

Angiosperms 
 

Amborellales

 
 
 

Nymphaeales

 
 
 

Austrobaileyales

 
mesangiosperms 
 
 

Chloranthales

 
magnoliids 
 
 

Canellales

 
 

Piperales

 
 
 
 

Magnoliales

 
 

Laurales

 
 
 
 
 
Monocots 
 

Acorales

 
 
 

Alismatales

 
 
 

Petrosaviales

 
 
 
 

Dioscoreales

 
 

Pandanales

 
 
 
 

Liliales

 
 
 

Asparagales

 
commelinids 
 

Dasypogonaceae

 
 

Arecales

 
 

Poales

 
 
 

Commelinales

 
 

Zingiberales

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Ceratophyllales

 
Eudicots 
 

Ranunculales

 
 
 

Sabiaceae

 
 

Proteales

 
 
 

Trochodendrales

 
 

Buxales

 
core eudicots 
 

Gunnerales

 
 
 

Dilleniaceae

 
 
 

Saxifragales

 
rosids 
 

Vitales

 
eurosids 
fabids 
 

Zygophyllales

 
 
 
 

Celastrales

 
 
 

Oxalidales

 
 

Malpighiales

 
 
 
 
 

Fabales

 
 
 

Rosales

 
 
 

Fagales

 
 

Cucurbitales

 
 
 
 
 
 
malvids 
 
 

Geraniales

 
 

Myrtales

 
 
 
 

Crossosomatales

 
 
 

Picramniales

 
 
 

Sapindales

 
 
 

Huerteales

 
 
 

Brassicales

 
 

Malvales

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Berberidopsidales

 
 
 

Santalales

 
 
 

Caryophyllales

 
asterids 
 

Cornales

 
 
 

Ericales

 
euasterids 
lamiids 
 

Garryales

 
 
 

Boraginaceae

 
 

Gentianales

 
 
 

Solanales

 
 

Lamiales

 
 
 
 
 

campanulids*

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Campanulids (devamı)

*campanulids 
 

Aquifoliales

 
 
 

Asterales

 
 

Escalloniales

 
 
 

Bruniales

 
 
 

Apiales

 
 
 

Paracryphiales

 
 

Dipsacales

 
 
 
 
 
 

APG III'de kaldırılan parantez familyalar ve bunların alt familya olarak kullanılması

Bir kısım APG II sisteminde belirtilen parantez familyalara APG III sisteminde yer verilmemiştir ancak alt familya olarak bu familyalar istenirse gösterilebilir..[8] Bunlar aşağıda gösterilmiştir.

APG III içinde bir familya içindeki alt familyalarr; APG II parantez familyaların yerini almıştır.
APG II parantez familyaları APG III familyaları: alt familyalar
Agapanthaceae Amaryllidaceae: Agapanthoideae
Agavaceae Asparagaceae: Agavoideae
Alliaceae Amaryllidaceae: Allioideae
Amaryllidaceae Amaryllidaceae: Amaryllidoideae
Aphyllanthaceae Asparagaceae: Aphyllanthoideae
Asparagaceae Asparagaceae: Asparagoideae
Asphodelaceae Xanthorrhoeaceae: Asphodeloideae
Hemerocallidaceae Xanthorrhoeaceae: Hemerocallidoideae
Hesperocallidaceae Asparagaceae: Agavoideae
Hyacinthaceae Asparagaceae: Scilloideae
Laxmanniaceae Asparagaceae: Lomandroideae
Rusçaceae Asparagaceae: Nolinoideae
Themidaceae Asparagaceae: Brodiaeoideae
Xanthorrhoeaceae Xanthorrhoeaceae: Xanthorrhoeoideae

Kaynakça

  1. ^ a b Angiosperm Phylogeny Group (2009), "An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III", Botanical Journal of the Linnean Society, 161 (2), s. 105–121, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.00996.x, 25 Mayıs 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi, erişim tarihi: 10 Aralık 2010 
  2. ^ As easy as APG III - Scientists revise the system of classifying flowering plants, The Linnean Society of London, 8 Ekim 2009, 26 Kasım 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi, erişim tarihi: 29 Ekim 2009 
  3. ^ APG III tidies up plant family tree, Horticulture Week, 8 Ekim 2009, erişim tarihi: 29 Ekim 2009 
  4. ^ Mark W.Chase-James L.Reveal (2009), "A phylogenetic classification of the land plants to accompany APG III", Botanical Journal of the Linnean Society, 161 (2), s. 122–127, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.01002.x 
  5. ^ Haston, E., Richardson, J.E., Stevens, P.F., Chase, M.W., Harris, D.J. (2009) The Linear Angiosperm Phylogeny Group (LAPG) III: a linear sequence of the families in APG III. Botanical Journal of the Linnean Society 161, 128–131.
  6. ^ Christenhusz, M. J. M., M. F. Fay, J. J. Clarkson, P. Gasson, J. Morales Can, J. B. Jimenez Barrios & M. W. Chase (2010). Petenaeaceae, a new angiosperm family in Huerteales with a distant relationship to Gerrardina (Gerrardinaceae), Botanical Journal of the Linnean Society 164: 16-25. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1095-8339.2010.01074.x/abstract 2 Kasım 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  7. ^ Christenhusz, M. J. M., M. W. Chase, & M.F.Fay (2011). Preface to "Linear sequence, classification, synonymy, and bibliography of vascular plants: Lycophytes, ferns, gymnosperms and angiosperms", Phytotaxa 19: 4–6. http://www.mapress.com/phytotaxa/content/2011/f/pt00019p006.pdf 13 Ocak 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  8. ^ Chase, M.W.; Reveal, J.L.; Fay, M.F. (2009), "A subfamilial classification for the expanded asparagalean families Amaryllidaceae, Asparagaceae and Xanthorrhoeaceae", Botanical Journal of the Linnean Society, 161 (2), ss. 132-136, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.00999.x 

Ayrıca bakınız

Dış bağlantılar

  • The APG III paper: An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG III
  • The LAPG III paper: The Linear Angiosperm Phylogeny Group (LAPG) III: a linear sequence of the families in APG III 7 Haziran 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • The phylogenetic classification of land plants paper: A phylogenetic classification of the land plants to accompany APG III 7 Haziran 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
  • Angiosperm Phylogeny Website3 Haziran 2011 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. at the Missouri Botanical Garden 15 Ocak 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. website