ARVCF

Ідентифікатори

Символи

ARVCF, armadillo repeat gene deleted in velocardiofacial syndrome, delta catenin family member, ARVCF delta catenin family member

Зовнішні ІД

OMIM: 602269 MGI: 109620 HomoloGene: 31046 GeneCards: ARVCF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cadherin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • cell-cell junction
Біологічний процес	• multicellular organism development • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • адгезія клітин • cell-cell adhesion • cell-cell junction assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


421


11877

Ensembl


ENSG00000099889


ENSMUSG00000000325

UniProt


O00192


P98203

RefSeq (мРНК)


NM_001670

NM_001272028 NM_001272029 NM_001272030 NM_001272031 NM_001272032
NM_033474

RefSeq (білок)


NP_001661

NP_001258957 NP_001258958 NP_001258959 NP_001258960 NP_001258961
NP_258435

Локус (UCSC)

Хр. 22: 19.97 – 20.02 Mb

Хр. 16: 18.35 – 18.41 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARVCF (англ. ARVCF, delta catenin family member) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 962 амінокислот, а молекулярна маса — 104 642^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEDCNVHSAA	SILASVKEQE	ARFERLTRAL	EQERRHVALQ	LERAQQPGMV
SGGMGSGQPL	PMAWQQLVLQ	EQSPGSQASL	ATMPEAPDVL	EETVTVEEDP
GTPTSHVSIV	TSEDGTTRRT	ETKVTKTVKT	VTTRTVRQVP	VGPDGLPLLD
GGPPLGPFAD	GALDRHFLLR	GGGPVATLSR	AYLSSGGGFP	EGPEPRDSPS
YGSLSRGLGM	RPPRAGPLGP	GPGDGCFTLP	GHREAFPVGP	EPGPPGGRSL
PERFQAEPYG	LEDDTRSLAA	DDEGGPELEP	DYGTATRRRP	ECGRGLHTRA
YEDTADDGGE	LADERPAFPM	VTAPLAQPER	GSMGSLDRLV	RRSPSVDSAR
KEPRWRDPEL	PEVLAMLRHP	VDPVKANAAA	YLQHLCFENE	GVKRRVRQLR
GLPLLVALLD	HPRAEVRRRA	CGALRNLSYG	RDTDNKAAIR	DCGGVPALVR
LLRAARDNEV	RELVTGTLWN	LSSYEPLKMV	IIDHGLQTLT	HEVIVPHSGW
EREPNEDSKP	RDAEWTTVFK	NTSGCLRNVS	SDGAEARRRL	RECEGLVDAL
LHALQSAVGR	KDTDNKSVEN	CVCIMRNLSY	HVHKEVPGAD	RYQEAEPGPL
GSAVGSQRRR	RDDASCFGGK	KAKEEWFHQG	KKDGEMDRNF	DTLDLPKRTE
AAKGFELLYQ	PEVVRLYLSL	LTESRNFNTL	EAAAGALQNL	SAGNWMWATY
IRATVRKERG	LPVLVELLQS	ETDKVVRAVA	IALRNLSLDR	RNKDLIGSYA
MAELVRNVRN	AQAPPRPGAC	LEEDTVVAVL	NTIHEIVSDS	LDNARSLLQA
RGVPALVALV	ASSQSVREAK	AASHVLQTVW	SYKELRGTLQ	KDGWTKARFQ
SAAATAKGPK	GALSPGGFDD	STLPLVDKSL	EGEKTGSRDV	IPMDALGPDG
YSTVDRRERR	PRGASSAGEA	SEKEPLKLDP	SRKAPPPGPS	RPAVRLVDAV
GDAKPQPVDS	WV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг.

Література

Stenzel N., Fetzer C.P., Heumann R., Erdmann K.S. (2009). PDZ-domain-directed basolateral targeting of the peripheral membrane protein FRMPD2 in epithelial cells. J. Cell Sci. 122: 3374—3384. PMID 19706687 DOI:10.1242/jcs.046854

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:728 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, O00192 (англ.) . Архів оригіналу за 26 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.