CDC42EP1

Ідентифікатори

Символи

CDC42EP1, BORG5, CEP1, MSE55, CDC42 effector protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 606084 MGI: 1929763 HomoloGene: 5128 GeneCards: CDC42EP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • cadherin binding involved in cell-cell adhesion
Клітинна компонента	• цитоскелет • мембрана • система ендомембран • focal adhesion • цитоплазма • клітинна мембрана
Біологічний процес	• positive regulation of pseudopodium assembly • positive regulation of actin filament polymerization • Rho protein signal transduction • regulation of cell shape • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cell-cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


11135


104445

Ensembl


ENSG00000128283


ENSMUSG00000049521

UniProt


Q00587


Q91W92

RefSeq (мРНК)


NM_152243


NM_027219

RefSeq (білок)


NP_689449


NP_081495

Локус (UCSC)

Хр. 22: 37.56 – 37.57 Mb

Хр. 15: 78.73 – 78.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDC42EP1 (англ. CDC42 effector protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 40 295^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGPQGGRGA	ATMSLGKLSP	VGWVSSSQGK	RRLTADMISH	PLGDFRHTMH
VGRGGDVFGD	TSFLSNHGGS	SGSTHRSPRS	FLAKKLQLVR	RVGAPPRRMA
SPPAPSPAPP	AISPIIKNAI	SLPQLNQAAY	DSLVVGKLSF	DSSPTSSTDG
HSSYGLDSGF	CTISRLPRSE	KPHDRDRDGS	FPSEPGLRRS	DSLLSFRLDL
DLGPSLLSEL	LGVMSLPEAP	AAETPAPAAN	PPAPTANPTG	PAANPPATTA
NPPAPAANPS	APAATPTGPA	ANPPAPAASS	TPHGHCPNGV	TAGLGPVAEV
KSSPVGGGPR	GPAGPALGRH	WGAGWDGGHH	YPEMDARQER	VEVLPQARAS
WESLDEEWRA	PQAGSRTPVP	STVQANTFEF	ADAEEDDEVK	V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Joberty G., Perlungher R.R., Macara I.G. (1999). The Borgs, a new family of Cdc42 and TC10 GTPase-interacting proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 6585—6597. PMID 10490598 DOI:10.1128/MCB.19.10.6585
Burbelo P.D., Snow D.M., Bahou W., Spiegel S. (1999). MSE55, a Cdc42 effector protein, induces long cellular extensions in fibroblasts. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 9083—9088. PMID 10430899 DOI:10.1073/pnas.96.16.9083
Bahou W.F., Campbell A.D., Wicha M.S. (1992). cDNA cloning and molecular characterization of MSE55, a novel human serum constituent protein that displays bone marrow stromal/endothelial cell-specific expression. J. Biol. Chem. 267: 13986—13992. PMID 1629197

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17014 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00587 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.