CDH11

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2A4C, 2A4E

Ідентифікатори

Символи

CDH11, CAD11, CDHOB, OB, OSF-4, cadherin 11, ESWS, TBHS2

Зовнішні ІД

OMIM: 600023 MGI: 99217 HomoloGene: 1361 GeneCards: CDH11

Пов'язані генетичні захворювання

branchioskeletogenital syndrome^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • мембрана • цитоплазма • integral component of membrane • екзосома • cell surface • catenin complex • синапс • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • skeletal system development • adherens junction organization • осифікація • corticospinal tract morphogenesis • адгезія клітин • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • modulation of chemical synaptic transmission • cell-cell adhesion
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1009


12552

Ensembl


ENSG00000140937


ENSMUSG00000031673

UniProt


P55287


P55288

RefSeq (мРНК)


NM_001308392 NM_001797 NM_001330576 NM_033664


NM_009866

RefSeq (білок)


NP_001295321 NP_001317505 NP_001788


NP_033996

Локус (UCSC)

Хр. 16: 64.94 – 65.13 Mb

Хр. 8: 103.36 – 103.51 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH11 (англ. Cadherin 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 796 амінокислот, а молекулярна маса — 87 965^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKENYCLQAA	LVCLGMLCHS	HAFAPERRGH	LRPSFHGHHE	KGKEGQVLQR
SKRGWVWNQF	FVIEEYTGPD	PVLVGRLHSD	IDSGDGNIKY	ILSGEGAGTI
FVIDDKSGNI	HATKTLDREE	RAQYTLMAQA	VDRDTNRPLE	PPSEFIVKVQ
DINDNPPEFL	HETYHANVPE	RSNVGTSVIQ	VTASDADDPT	YGNSAKLVYS
ILEGQPYFSV	EAQTGIIRTA	LPNMDREAKE	EYHVVIQAKD	MGGHMGGLSG
TTKVTITLTD	VNDNPPKFPQ	SVYQMSVSEA	AVPGEEVGRV	KAKDPDIGEN
GLVTYNIVDG	DGMESFEITT	DYETQEGVIK	LKKPVDFETK	RAYSLKVEAA
NVHIDPKFIS	NGPFKDTVTV	KISVEDADEP	PMFLAPSYIH	EVQENAAAGT
VVGRVHAKDP	DAANSPIRYS	IDRHTDLDRF	FTINPEDGFI	KTTKPLDREE
TAWLNITVFA	AEIHNRHQEA	KVPVAIRVLD	VNDNAPKFAA	PYEGFICESD
QTKPLSNQPI	VTISADDKDD	TANGPRFIFS	LPPEIIHNPN	FTVRDNRDNT
AGVYARRGGF	SRQKQDLYLL	PIVISDGGIP	PMSSTNTLTI	KVCGCDVNGA
LLSCNAEAYI	LNAGLSTGAL	IAILACIVIL	LVIVVLFVTL	RRQKKEPLIV
FEEEDVRENI	ITYDDEGGGE	EDTEAFDIAT	LQNPDGINGF	IPRKDIKPEY
QYMPRPGLRP	APNSVDVDDF	INTRIQEADN	DPTAPPYDSI	QIYGYEGRGS
VAGSLSSLES	ATTDSDLDYD	YLQNWGPRFK	KLADLYGSKD	TFDDDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1750 (англ.) . Архів оригіналу за 6 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P55287 (англ.) . Архів оригіналу за 3 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.