EPHB1

EPHB1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2DJS, 2EAO, 3ZFX

Ідентифікатори
Символи EPHB1, Ephb1, 9330129L11, AW488255, C130099E04Rik, Cek6, ENSMUSG00000074119, Elk, Elkh, Hek6, Net, EPHT2, EPH receptor B1, ELK, NET
Зовнішні ІД OMIM: 600600 MGI: 1096337 HomoloGene: 20936 GeneCards: EPHB1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transferase activity
• nucleotide binding
• protein kinase activity
• kinase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
• protein tyrosine kinase activity
• ATP binding
• ephrin receptor activity
• axon guidance receptor activity
• transmembrane-ephrin receptor activity
• GO:0032403 protein-containing complex binding

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• ендосома
• cell projection
• early endosome membrane
• мембрана
• integral component of plasma membrane
• extracellular region
• дендрит (нейробіологія)
• екзосома
• ендоплазматичний ретикулум
• гіалоплазма
• клітинна мембрана
• аксон
• цитоплазма
• filopodium tip
• membrane raft
• neuron projection
• receptor complex
• glutamatergic synapse

Біологічний процес

• фосфорилювання
• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
• нейробіологія розвитку
• dendritic spine development
• cell-substrate adhesion
• regulation of JNK cascade
• protein phosphorylation
• адгезія клітин
• regulation of neuron death
• regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• protein autophosphorylation
• peptidyl-tyrosine phosphorylation
• immunological synapse formation
• axon guidance
• optic nerve morphogenesis
• central nervous system projection neuron axonogenesis
• retinal ganglion cell axon guidance
• ephrin receptor signaling pathway
• camera-type eye morphogenesis
• positive regulation of synapse assembly
• dendritic spine morphogenesis
• Ангіогенез
• skeletal muscle satellite cell activation
• cranial nerve development
• Нейрогенез
• establishment of cell polarity
• detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain
• cell chemotaxis
• neural precursor cell proliferation
• negative regulation of skeletal muscle satellite cell proliferation
• negative regulation of satellite cell differentiation
• modulation of chemical synaptic transmission

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2047
270190
Ensembl
ENSG00000154928
ENSMUSG00000032537
UniProt
P54762
Q8CBF3
RefSeq (мРНК)
NM_004441
NM_001168296
NM_173447
RefSeq (білок)
NP_004432
NP_001161768
NP_775623
Локус (UCSC) Хр. 3: 134.8 – 135.26 Mb Хр. 9: 101.8 – 102.23 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EPHB1 (англ. EPH receptor B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 984 амінокислот, а молекулярна маса — 109 885[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MALDYLLLLLLASAVAAMEETLMDTRTATAELGWTANPASGWEEVSGYDE
NLNTIRTYQVCNVFEPNQNNWLLTTFINRRGAHRIYTEMRFTVRDCSSLP
NVPGSCKETFNLYYYETDSVIATKKSAFWSEAPYLKVDTIAADESFSQVD
FGGRLMKVNTEVRSFGPLTRNGFYLAFQDYGACMSLLSVRVFFKKCPSIV
QNFAVFPETMTGAESTSLVIARGTCIPNAEEVDVPIKLYCNGDGEWMVPI
GRCTCKPGYEPENSVACKACPAGTFKASQEAEGCSHCPSNSRSPAEASPI
CTCRTGYYRADFDPPEVACTSVPSGPRNVISIVNETSIILEWHPPRETGG
RDDVTYNIICKKCRADRRSCSRCDDNVEFVPRQLGLTECRVSISSLWAHT
PYTFDIQAINGVSSKSPFPPQHVSVNITTNQAAPSTVPIMHQVSATMRSI
TLSWPQPEQPNGIILDYEIRYYEKEHNEFNSSMARSQTNTARIDGLRPGM
VYVVQVRARTVAGYGKFSGKMCFQTLTDDDYKSELREQLPLIAGSAAAGV
VFVVSLVAISIVCSRKRAYSKEAVYSDKLQHYSTGRGSPGMKIYIDPFTY
EDPNEAVREFAKEIDVSFVKIEEVIGAGEFGEVYKGRLKLPGKREIYVAI
KTLKAGYSEKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSRPVMIITEFM
ENGALDSFLRQNDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMKYLAEMNYVHRDLAARNI
LVNSNLVCKVSDFGLSRYLQDDTSDPTYTSSLGGKIPVRWTAPEAIAYRK
FTSASDVWSYGIVMWEVMSFGERPYWDMSNQDVINAIEQDYRLPPPMDCP
AALHQLMLDCWQKDRNSRPRFAEIVNTLDKMIRNPASLKTVATITAVPSQ
PLLDRSIPDFTAFTTVDDWLSAIKMVQYRDSFLTAGFTSLQLVTQMTSED
LLRIGITLAGHQKKILNSIHSMRVQISQSPTAMA

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках, ендосомах.

Література

  • Stein E., Huynh-Do U., Lane A.A., Cerretti D.P., Daniel T.O. (1998). Nck recruitment to Eph receptor, EphB1/ELK, couples ligand activation to c-Jun kinase. J. Biol. Chem. 273: 1303—1308. PMID 9430661 DOI:10.1074/jbc.273.3.1303
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Stein E., Cerretti D.P., Daniel T.O. (1996). Ligand activation of ELK receptor tyrosine kinase promotes its association with Grb10 and Grb2 in vascular endothelial cells. J. Biol. Chem. 271: 23588—23593. PMID 8798570 DOI:10.1074/jbc.271.38.23588
  • Freywald A., Sharfe N., Roifman C.M. (2002). The kinase-null EphB6 receptor undergoes transphosphorylation in a complex with EphB1. J. Biol. Chem. 277: 3823—3828. PMID 11713248 DOI:10.1074/jbc.M108011200
  • Han D.C., Shen T.L., Miao H., Wang B., Guan J.L. (2002). EphB1 associates with Grb7 and regulates cell migration. J. Biol. Chem. 277: 45655—45661. PMID 12223469 DOI:10.1074/jbc.M203165200

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3392 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, P54762 (англ.) . Архів оригіналу за 5 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.