HLA-DPB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3LQZ, 4P4K, 4P4R, 4P57, 4P5K, 4P5M

Ідентифікатори

Символи

HLA-DPB1, DPB1, HLA-DP, HLA-DP1B, HLA-DPB, major histocompatibility complex, class II, DP beta 1

Зовнішні ІД

OMIM: 142858 HomoloGene: 129927 GeneCards: HLA-DPB1

Пов'язані генетичні захворювання

гепатит B^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptide antigen binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • cell surface • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane
Біологічний процес	• antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • T cell costimulation • positive regulation of interferon-gamma production • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • positive regulation of T cell activation • positive regulation of T cell proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3115


368615

Ensembl

ENSG00000236693 ENSG00000230708 ENSG00000229295 ENSG00000226826 ENSG00000215048
ENSG00000223865 ENSG00000230763 ENSG00000237710


ENSDARG00000104635

UniProt


P04440


Q32Q47

RefSeq (мРНК)


NM_002121


NM_001007206

RefSeq (білок)


NP_002112


NP_001007207

Локус (UCSC)

Хр. 6: 33.08 – 33.09 Mb

н/д

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HLA-DPB1 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DP beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 29 159^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMVLQVSAAP	RTVALTALLM	VLLTSVVQGR	ATPENYLFQG	RQECYAFNGT
QRFLERYIYN	REEFARFDSD	VGEFRAVTEL	GRPAAEYWNS	QKDILEEKRA
VPDRMCRHNY	ELGGPMTLQR	RVQPRVNVSP	SKKGPLQHHN	LLVCHVTDFY
PGSIQVRWFL	NGQEETAGVV	STNLIRNGDW	TFQILVMLEM	TPQQGDVYTC
QVEHTSLDSP	VTVEWKAQSD	SARSKTLTGA	GGFVLGLIIC	GVGIFMHRRS
KKVQRGSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Kelly A., Trowsdale J. (1985). Complete nucleotide sequence of a functional HLA-DP beta gene and the region between the DP beta 1 and DP alpha 1 genes: comparison of the 5' ends of HLA class II genes. Nucleic Acids Res. 13: 1607—1621. PMID 2987832 DOI:10.1093/nar/13.5.1607
Compagnone-Post P., Turco E., Robinson C., Trucco M. (1988). The beta-chains of DP4 molecules from different haplotypes are encoded by the same gene. Genomics. 2: 8—13. PMID 2838415 DOI:10.1016/0888-7543(88)90103-6
Korioth F., Hartung K., Deicher H., Frey J. (1992). A new HLA-DPB1 allele from a patient with systemic lupus erythematosus. Tissue Antigens. 39: 216—219. PMID 1529429 DOI:10.1111/j.1399-0039.1992.tb01938.x
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rani R., Fernandez-Vina M.A., Zhang S., Stastny P. (1995). HLA-DPB1 alleles in a population from north India and description of a new variant (DPB1*5601). Tissue Antigens. 45: 264—269. PMID 7638863 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02450.x
Hessner M.J., Baxter-Lowe L.A. (1992). Characterization of novel HLA-DPB1 alleles by oligotyping and nucleotide sequencing. Tissue Antigens. 40: 261—263. PMID 1481203 DOI:10.1111/j.1399-0039.1992.tb02055.x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з HLA-DPB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4940 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P04440 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.