PRIM2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3L9Q, 3Q36, 4BPU, 4BPW, 4BPX, 4RR2, 5F0Q, 5EXR, 5F0S

Ідентифікатори

Символи

PRIM2, PRIM2A, p58, primase (DNA) subunit 2, DNA primase subunit 2

Зовнішні ІД

OMIM: 176636 MGI: 97758 HomoloGene: 731 GeneCards: PRIM2

Реагує на сполуку

Viroporin 3a, цитарабін, Флударабін, gemcitabine hydrochloride^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • transferase activity • DNA binding • 4 iron, 4 sulfur cluster binding • iron-sulfur cluster binding • nucleotidyltransferase activity • зв'язування з іоном металу • single-stranded DNA binding • DNA-directed DNA polymerase activity • DNA primase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • alpha DNA polymerase:primase complex
Біологічний процес	• реплікація ДНК • DNA replication, synthesis of RNA primer • DNA biosynthetic process • telomere maintenance via semi-conservative replication • G1/S transition of mitotic cell cycle • DNA replication initiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5558


19076

Ensembl


ENSG00000146143


ENSMUSG00000026134

UniProt


P49643


P33610

RefSeq (мРНК)


NM_000947 NM_001282487 NM_001282488


NM_008922

RefSeq (білок)


NP_000938 NP_001269416 NP_001269417


NP_032948

Локус (UCSC)

Хр. 6: 57.31 – 57.65 Mb

Хр. 1: 33.49 – 33.71 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PRIM2 (англ. Primase (DNA) subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 806^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEFSGRKWRK	LRLAGDQRNA	SYPHCLQFYL	QPPSENISLI	EFENLAIDRV
KLLKSVENLG	VSYVKGTEQY	QSKLESELRK	LKFSYRENLE	DEYEPRRRDH
ISHFILRLAY	CQSEELRRWF	IQQEMDLLRF	RFSILPKDKI	QDFLKDSQLQ
FEAISDEEKT	LREQEIVASS	PSLSGLKLGF	ESIYKIPFAD	ALDLFRGRKV
YLEDGFAYVP	LKDIVAIILN	EFRAKLSKAL	ALTARSLPAV	QSDERLQPLL
NHLSHSYTGQ	DYSTQGNVGK	ISLDQIDLLS	TKSFPPCMRQ	LHKALRENHH
LRHGGRMQYG	LFLKGIGLTL	EQALQFWKQE	FIKGKMDPDK	FDKGYSYNIR
HSFGKEGKRT	DYTPFSCLKI	ILSNPPSQGD	YHGCPFRHSD	PELLKQKLQS
YKISPGGISQ	ILDLVKGTHY	QVACQKYFEM	IHNVDDCGFS	LNHPNQFFCE
SQRILNGGKD	IKKEPIQPET	PQPKPSVQKT	KDASSALASL	NSSLEMDMEG
LEDYFSEDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, ДНК, групою 4Fe-4S, залізо-сірчаною групою.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA primase subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9370 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, P49643 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.