RAF1

RAF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1C1Y, 1FAQ, 1FAR, 1GUA, 1RFA, 3CU8, 3IQJ, 3IQU, 3IQV, 3KUC, 3KUD, 3NKX, 3O8I, 3OMV, 4FJ3, 4G0N, 4G3X, 4IEA, 4IHL

Ідентифікатори
Символи RAF1, Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase, CMD1NN, CRAF, NS5, Raf-1, c-Raf
Зовнішні ІД OMIM: 164760 MGI: 97847 HomoloGene: 48145 GeneCards: RAF1
Пов'язані генетичні захворювання
гіпертрофічна кардіоміопатія, Noonan syndrome 5, dilated cardiomyopathy 1NN, дилатаційна кардіоміопатія[1]
Реагує на сполуку
сорафеніб, вемурафеніб[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• transferase activity
• protein kinase activity
• nucleotide binding
• зв'язування з іоном металу
• protein serine/threonine kinase activity
• small GTPase binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• identical protein binding
• ATP binding
• kinase activity
• MAP kinase kinase kinase activity
• enzyme binding
• mitogen-activated protein kinase kinase binding
• adenylate cyclase binding
• adenylate cyclase activator activity
• protein heterodimerization activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• комплекс Ґольджі
• Псевдоподія
• мембрана
• клітинна мембрана
• мітохондріальна зовнішня мембрана
• мітохондрія
• клітинне ядро
• nuclear speck
• внутрішньоклітинний

Біологічний процес

• response to muscle stretch
• regulation of apoptotic process
• диференціація клітин
• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
• positive regulation of protein phosphorylation
• GO:0007243 intracellular signal transduction
• response to hypoxia
• somatic stem cell population maintenance
• фосфорилювання
• thymus development
• cellular glucose homeostasis
• GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly
• Загоєння ран
• stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
• negative regulation of apoptotic process
• MAPK cascade
• positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation
• regulation of cell motility
• platelet activation
• protein phosphorylation
• heart development
• thyroid gland development
• ion transmembrane transport
• face development
• death-inducing signaling complex assembly
• negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors
• intermediate filament cytoskeleton organization
• регуляція диференціювання клітин
• проліферація
• regulation of Rho protein signal transduction
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• negative regulation of cell population proliferation
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus
• GO:0097285 апоптоз
• neurotrophin TRK receptor signaling pathway
• multicellular organism development
• negative regulation of signal transduction
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• activation of adenylate cyclase activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5894
110157
Ensembl
ENSG00000132155
ENSMUSG00000000441
UniProt
P04049
Q99N57
RefSeq (мРНК)
NM_002880
NM_029780
NM_001356333
NM_001356334
RefSeq (білок)
NP_002871
NP_001341618
NP_001341619
NP_001341620
NP_001341621
NP_001341622
NP_001341624
NP_001341623
NP_084056
NP_001343262
NP_001343263
Локус (UCSC) н/д Хр. 6: 115.6 – 115.65 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RAF1 (англ. Raf-1 proto-oncogene, serine/threonine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот, а молекулярна маса — 73 052[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEHIQGAWKTISNGFGFKDAVFDGSSCISPTIVQQFGYQRRASDDGKLTD
PSKTSNTIRVFLPNKQRTVVNVRNGMSLHDCLMKALKVRGLQPECCAVFR
LLHEHKGKKARLDWNTDAASLIGEELQVDFLDHVPLTTHNFARKTFLKLA
FCDICQKFLLNGFRCQTCGYKFHEHCSTKVPTMCVDWSNIRQLLLFPNST
IGDSGVPALPSLTMRRMRESVSRMPVSSQHRYSTPHAFTFNTSSPSSEGS
LSQRQRSTSTPNVHMVSTTLPVDSRMIEDAIRSHSESASPSALSSSPNNL
SPTGWSQPKTPVPAQRERAPVSGTQEKNKIRPRGQRDSSYYWEIEASEVM
LSTRIGSGSFGTVYKGKWHGDVAVKILKVVDPTPEQFQAFRNEVAVLRKT
RHVNILLFMGYMTKDNLAIVTQWCEGSSLYKHLHVQETKFQMFQLIDIAR
QTAQGMDYLHAKNIIHRDMKSNNIFLHEGLTVKIGDFGLATVKSRWSGSQ
QVEQPTGSVLWMAPEVIRMQDNNPFSFQSDVYSYGIVLYELMTGELPYSH
INNRDQIIFMVGRGYASPDLSKLYKNCPKAMKRLVADCVKKVKEERPLFP
QILSSIELLQHSLPKINRSASEPSLHRAAHTEDINACTLTTSPRLPVF

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zimmermann S., Moelling K. (1999). Phosphorylation and regulation of Raf by Akt (protein kinase B). Science. 286: 1741—1744. PMID 10576742 DOI:10.1126/science.286.5445.1741
  • Chong H., Lee J., Guan K.L. (2001). Positive and negative regulation of Raf kinase activity and function by phosphorylation. EMBO J. 20: 3716—3727. PMID 11447113 DOI:10.1093/emboj/20.14.3716
  • Chen J., Fujii K., Zhang L., Roberts T., Fu H. (2001). Raf-1 promotes cell survival by antagonizing apoptosis signal-regulating kinase 1 through a MEK-ERK independent mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 7783—7788. PMID 11427728 DOI:10.1073/pnas.141224398
  • Zang M., Hayne C., Luo Z. (2002). Interaction between active Pak1 and Raf-1 is necessary for phosphorylation and activation of Raf-1. J. Biol. Chem. 277: 4395—4405. PMID 11733498 DOI:10.1074/jbc.M110000200
  • Kunapuli P., Kasyapa C.S., Hawthorn L., Cowell J.K. (2004). LGI1, a putative tumor metastasis suppressor gene, controls in vitro invasiveness and expression of matrix metalloproteinases in glioma cells through the ERK1/2 pathway. J. Biol. Chem. 279: 23151—23157. PMID 15047712 DOI:10.1074/jbc.M314192200

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з RAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з RAF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9829 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  6. ↑ UniProt, P04049 (англ.) . Архів оригіналу за 16 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»