TAF4B

TAF4B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1H3O, 2P6V

Ідентифікатори
Символи TAF4B, SPGF13, TAF2C2, TAFII105, TATA-box binding protein associated factor 4b
Зовнішні ІД OMIM: 601689 MGI: 2152345 HomoloGene: 28266 GeneCards: TAF4B
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
• DNA binding
• NF-kappaB binding
• protein heterodimerization activity
• GO:0001105 transcription coactivator activity
• transcription factor binding
• GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• клітинне ядро
• нуклеоплазма
• fibrillar center
• transcription factor TFIID complex

Біологічний процес

• DNA-templated transcription, initiation
• диференціація клітин
• transcription initiation from RNA polymerase II promoter
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• transcription by RNA polymerase II
• Сперматогенез
• transcription, DNA-templated
• Оогенез
• regulation of signal transduction by p53 class mediator
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
• RNA polymerase II preinitiation complex assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6875
72504
Ensembl
ENSG00000141384
ENSMUSG00000054321
UniProt
Q92750
G5E8Z2
RefSeq (мРНК)
NM_001293725
NM_005640
NM_001100449
NM_001369357
NM_001369358
RefSeq (білок)
NP_001280654
NP_005631
NP_001093919
NP_001356286
NP_001356287
Локус (UCSC) Хр. 18: 26.23 – 26.39 Mb Хр. 18: 14.92 – 15.03 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TAF4B (англ. TATA-box binding protein associated factor 4b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 862 амінокислот, а молекулярна маса — 91 091[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPAGLTEPAGAAPPAAVSASGTVTMAPAGALPVRVESTPVALGAVTKAPV
SVCVEPTASQPLRSPVGTLVTKVAPVSAPPKVSSGPRLPAPQIVAVKAPN
TTTIQFPANLQLPPGTVLIKSNSGPLMLVSPQQTVTRAETTSNITSRPAV
PANPQTVKICTVPNSSSQLIKKVAVTPVKKLAQIGTTVVTTVPKPSSVQS
VAVPTSVVTVTPGKPLNTVTTLKPSSLGASSTPSNEPNLKAENSAAVQIN
LSPTMLENVKKCKNFLAMLIKLACSGSQSPEMGQNVKKLVEQLLDAKIEA
EEFTRKLYVELKSSPQPHLVPFLKKSVVALRQLLPNSQSFIQQCVQQTSS
DMVIATCTTTVTTSPVVTTTVSSSQSEKSIIVSGATAPRTVSVQTLNPLA
GPVGAKAGVVTLHSVGPTAATGGTTAGTGLLQTSKPLVTSVANTVTTVSL
QPEKPVVSGTAVTLSLPAVTFGETSGAAICLPSVKPVVSSAGTTSDKPVI
GTPVQIKLAQPGPVLSQPAGIPQAVQVKQLVVQQPSGGNEKQVTTISHSS
TLTIQKCGQKTMPVNTIIPTSQFPPASILKQITLPGNKILSLQASPTQKN
RIKENVTSCFRDEDDINDVTSMAGVNLNEENACILATNSELVGTLIQSCK
DEPFLFIGALQKRILDIGKKHDITELNSDAVNLISQATQERLRGLLEKLT
AIAQHRMTTYKASENYILCSDTRSQLKFLEKLDQLEKQRKDLEEREMLLK
AAKSRSNKEDPEQLRLKQKAKELQQLELAQIQHRDANLTALAAIGPRKKR
PLESGIEGLKDNLLASGTSSLTATKQLHRPRITRICLRDLIFCMEQEREM
KYSRALYLALLK

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Wu Y., Lu Y., Hu Y., Li R. (2005). Cyclic AMP-dependent modification of gonad-selective TAF(II)105 in a human ovarian granulosa cell line. J. Cell. Biochem. 96: 751—759. PMID 16088961 DOI:10.1002/jcb.20577
  • Dikstein R., Zhou S., Tjian R. (1996). Human TAFII 105 is a cell type-specific TFIID subunit related to hTAFII130. Cell. 87: 137—146. PMID 8858156 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81330-6
  • Wolstein O., Silkov A., Revach M., Dikstein R. (2000). Specific interaction of TAFII105 with OCA-B is involved in activation of octamer-dependent transcription. J. Biol. Chem. 275: 16459—16465. PMID 10828057 DOI:10.1074/jbc.275.22.16459
  • Yamit-Hezi A., Nir S., Wolstein O., Dikstein R. (2000). Interaction of TAFII105 with selected p65/RelA dimers is associated with activation of subset of NF-kappa B genes. J. Biol. Chem. 275: 18180—18187. PMID 10849440 DOI:10.1074/jbc.275.24.18180
  • Rashevsky-Finkel A., Silkov A., Dikstein R. (2001). A composite nuclear export signal in the TBP-associated factor TAFII105. J. Biol. Chem. 276: 44963—44969. PMID 11567023 DOI:10.1074/jbc.M106112200

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11538 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q92750 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші