ZFY

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KLR, 1KLS, 1XRZ, 5ZNF

Ідентифікатори

Символи

ZFY, ZNF911, zinc finger protein, Y-linked, zinc finger protein Y-linked

Зовнішні ІД

OMIM: 490000 HomoloGene: 88465 GeneCards: ZFY

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце
Біологічний процес	• multicellular organism development • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7544


н/д

Ensembl


ENSG00000067646


н/д

UniProt


P08048


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_001145275 NM_001145276 NM_003411


н/д

RefSeq (білок)

NP_001138747 NP_001138748 NP_003402 NP_001356631 NP_001356632
NP_001356633 NP_001356634 NP_001356635 NP_001356636 NP_001356637 NP_001356638 NP_001356639


н/д

Локус (UCSC)

Хр. Y: 2.94 – 2.98 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

ZFY (англ. Zinc finger protein, Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 801 амінокислот, а молекулярна маса — 90 505^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEDEFELQP	QEPNSFFDGI	GADATHMDGD	QIVVEIQEAV	FVSNIVDSDI
TVHNFVPDDP	DSVVIQDVVE	DVVIEEDVQC	SDILEEADVS	ENVIIPEQVL
DSDVTEEVSL	PHCTVPDDVL	ASDITSTSMS	MPEHVLTSES	MHVCDIGHVE
HMVHDSVVEA	EIITDPLTSD	IVSEEVLVAD	CAPEAVIDAS	GISVDQQDND
KASCEDYLMI	SLDDAGKIEH	DGSTGVTIDA	ESEMDPCKVD	STCPEVIKVY
IFKADPGEDD	LGGTVDIVES	EPENDHGVEL	LDQNSSIRVP	REKMVYMTVN
DSQQEDEDLN	VAEIADEVYM	EVIVGEEDAA	VAAAAAAVHE	QQIDEDEMKT
FVPIAWAAAY	GNNSDGIENR	NGTASALLHI	DESAGLGRLA	KQKPKKKRRP
DSRQYQTAII	IGPDGHPLTV	YPCMICGKKF	KSRGFLKRHM	KNHPEHLAKK
KYHCTDCDYT	TNKKISLHNH	LESHKLTSKA	EKAIECDECG	KHFSHAGALF
THKMVHKEKG	ANKMHKCKFC	EYETAEQGLL	NRHLLAVHSK	NFPHICVECG
KGFRHPSELR	KHMRIHTGEK	PYQCQYCEYR	SADSSNLKTH	IKTKHSKEMP
FKCDICLLTF	SDTKEVQQHT	LVHQESKTHQ	CLHCDHKSSN	SSDLKRHVIS
VHTKDYPHKC	EMCEKGFHRP	SELKKHVAVH	KGKKMHQCRH	CDFKIADPFV
LSRHILSVHT	KDLPFRCKRC	RKGFRQQNEL	KKHMKTHSGR	KVYQCEYCEY
STTDASGFKR	HVISIHTKDY	PHRCEYCKKG	FRRPSEKNQH	IMRHHKEVGL
P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Palmer M.S., Berta P., Sinclair A.H., Pym B., Goodfellow P.N. (1990). Comparison of human ZFY and ZFX transcripts. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 1681—1685. PMID 2308929 DOI:10.1073/pnas.87.5.1681
Erlandsson R., Wilson J.F., Paabo S. (2000). Sex chromosomal transposable element accumulation and male-driven substitutional evolution in humans. Mol. Biol. Evol. 17: 804—812. PMID 10779541 DOI:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026359
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Grants J., Flanagan E., Yee A., Romaniuk P.J. (2010). Characterization of the DNA binding activity of the ZFY zinc finger domain. Biochemistry. 49: 679—686. PMID 20028140 DOI:10.1021/bi9018626
Kochoyan M., Keutmann H.T., Weiss M.A. (1991). Alternating zinc fingers in the human male associated protein ZFY: refinement of the NMR structure of an even finger by selective deuterium labeling and implications for DNA recognition. Biochemistry. 30: 7063—7072. PMID 1854720 DOI:10.1021/bi00243a005
Lau Y.-F.C., Chan K. (1989). The putative testis-determining factor and related genes are expressed as discrete-sized transcripts in adult gonadal and somatic tissues. Am. J. Hum. Genet. 45: 942—952. PMID 2511751

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12870 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
↑ UniProt, P08048 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2017. Процитовано 13 вересня 2017.