EIF4A

真核起始因子4A-1
識別
符號 eIF4A-1
Entrez 1973
OMIM 602641
RefSeq NP_001407
UniProt P60842
其他資料
EC編號 3.6.1.-
基因座 17 [1]
真核起始因子4A-2
識別
符號 eIF4A-2
Entrez 1974
OMIM 601102
RefSeq NP_001958
UniProt Q14240
其他資料
EC編號 3.6.1.-
基因座 3 [2]
真核起始因子4A-3
人类eIF4A-3的晶体结构
識別
符號 eIF4A-3
Entrez 9775
OMIM 608546
PDB 2hxy
RefSeq NP_055555
UniProt P38919
其他資料
EC編號 3.6.1.-
基因座 17 [3]

真核起始因子4A(英語:eukaryotic translation Initiation Factor 4A,简称为eIF4A)是一种ATP依赖性RNA结合蛋白,一种RNA依赖性ATP酶,和一种RNA解旋酶,它在真核翻译起始进程中发挥重要作用。它被认为可以解开mRNA5'端非翻译区的二级和三级结构,以使核糖体的附着更容易,同时允许核糖体进行起始密码子扫描。[1]

eIF4A在人体中有三个亚型:eIF4A-1、eIF4A-2和eIF4A-3。

结构

eIF4A是DEAD盒RNA解旋酶超家族成员,其氨基酸序列中具有8个保守区,保守区内含有一致的特殊序列。已知的解旋酶结构具有两个结构域:RNA结合结构域和ATP酶结构域;保守区,包括ATP结合位点,线性排列在两个结构域之间的裂缝中。酵母的eIF4A(缺少RNA结合结构域)的N端ATP酶结构域包含一个七个β链组成的扭曲的β折叠片,其两侧分别有4个和5个α螺旋[2] 而最近对人类eIF4A的结构研究发现,eIF4A的两个结构域都为α/β型折叠,且在结合RNA前后发生了构象变化。[3]

功能

eIF4A的解旋功能可能是因为ATP结合和水解引起蛋白质结构变化和RNA亲合性的变化。虽然如此,单独存在的eIF4A只是一种低效的解旋酶,因为它从单链RNA上脱离的速率远大于水解ATP的速率。而eIF4A的解旋酶活性可被eIF4B,eIF4H和eIF4F增强。现在还不清楚这些因子是否或如何通过与eIF4A的相互作用改变了酶的动力学参数,例如通过增强它与RNA的亲合性从而带来活性的提高。

在真核生物中,eIF4A可以以自由形式存在或者作为eIF4F的一部分。在哺乳动物中eIF4A是结合eIF4G的两个位点上,在酵母中结合在eIF4G的一个单独位点上。[4] 它同样可结合翻译调控因子p97和PABP作用蛋白(PABP-interacting protein,PAIP)。

参考文献

  1. ^ (英文)Hernández G, Vazquez-Pianzola P. Functional diversity of the eukaryotic translation initiation factors belonging to eIF4 families. Mech Dev. 2005, 122: 865–76. PMID 15922571. 
  2. ^ (英文)Benz J, Trachsel H, Baumann U. Crystal structure of the ATPase domain of translation initiation factor 4A from Saccharomyces cerevisiae--the prototype of the DEAD box protein family. Structure. 1999, 15: 671–9. PMID 10404596. 
  3. ^ (英文)Andersen CB, Ballut L, Johansen JS, Chamieh H, Nielsen KH, Oliveira CL, Pedersen JS, Séraphin B, Le Hir H, Andersen GR. Structure of the exon junction core complex with a trapped DEAD-box ATPase bound to RNA. Science. 2006, 313: 1968–72. PMID 16931718. 
  4. ^ (英文)Imataka H, Sonenberg N. Human eukaryotic translation initiation factor 4G (eIF4G) possesses two separate and independent binding sites for eIF4A. Mol Cell Biol. 1997, 17: 6940–7. PMID 9372926. 

参见

蛋白质生物合成:翻译(原核翻译 · 古菌翻译 · 真核翻译
基本概念
核糖体蛋白质

PIF1 · PIF2 · PIF3

古菌起始因子

aIF1 · aIF2 · aIF5 · aIF6

真核起始因子
43S
起始前複合物
eIF1(AX · AY · 1B)

eIF2(S1 · S2 · S3) · B1 · B2 · B3 · B4 · B5 · eIF2激酶

eIF3(A · B · C · D · F · G · H · I · J · K · M · S6)

eIF4(eIF4A(A1 · A2 · A3) · B · E1 · E2 · G1 · G2 · G3 · H)

eIF5(A · A2 · B)

eIF6

EF-Tu · EF-Ts · EF-G

古菌延伸因子

aEF1 · aEF2

eEF1(A1 · A2 · A3 · B1 · B2 · B3 · B4 · D · E1 · G) · eEF2

原核释放因子 · 古菌释放因子 · 真核释放因子英语Eukaryotic release factors

其他

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  • 翻译
    • 核糖体亚基
    • 翻译后修饰
    • 分拣蛋白英语Template:Sorting nexin
  • DNA结合蛋白英语Template:DNA-binding proteins/RNA结合蛋白英语Template:RNA-binding proteins
    • 核糖核蛋白)
  • 蛋白质
    • 结构域
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  • Replication and repair英语Template:DNA replication and repair-deficiency disorder
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