LHX2

LHX2
識別號
别名LHX2;, LH2, hLhx2, LIM homeobox 2
外部IDOMIM:603759 MGI:96785 HomoloGene:55848 GeneCards:LHX2
基因位置(人类
9號染色體
染色体9號染色體[1]
9號染色體
LHX2的基因位置
LHX2的基因位置
基因座9q33.3起始124,001,670 bp[1]
终止124,033,301 bp[1]
基因位置(小鼠
小鼠2号染色体
染色体小鼠2号染色体[2]
小鼠2号染色体
LHX2的基因位置
LHX2的基因位置
基因座2|2 B起始38,229,293 bp[2]
终止38,259,745 bp[2]
RNA表达模式


查阅更多表达数据
基因本體
分子功能 金屬離子結合
sequence-specific DNA binding
chromatin binding
DNA结合
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
转录因子结合
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
細胞組分 细胞核
胞內
生物學過程 negative regulation of transcription regulatory region DNA binding
mesoderm development
telencephalon development
neural tube closure
retina development in camera-type eye
大脑皮质的组织发生
transcription, DNA-templated
轴突导向
axon extension
hair follicle development
maintenance of epithelial cell apical/basal polarity
神经发生
brain development
olfactory bulb development
神經系統的發育
dorsal/ventral pattern formation
positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
neuron differentiation
anatomical structure formation involved in morphogenesis
telencephalon regionalization
transcription by RNA polymerase II
negative regulation of gene expression, epigenetic
negative regulation of neurogenesis
positive regulation of neural precursor cell proliferation
Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種人類小鼠
Entrez

9355

16870

Ensembl

ENSG00000106689

ENSMUSG00000000247

UniProt

P50458

Q9Z0S2

mRNA​序列

NM_004789

NM_001290646
​NM_010710

蛋白序列

NP_004780

NP_001277575
​NP_034840

基因位置​(UCSC)Chr 9: 124 – 124.03 MbChr 2: 38.23 – 38.26 Mb
PubMed​查找[3][4]
維基數據
檢視/編輯人類檢視/編輯小鼠

LIM同源框蛋白質 LHX2蛋白質的一種,在人類內由「LHX2」基因所編碼。[5][6][7]

LHX2包含LIM結構域,这是一種帶有許多半胱氨酸,具鋅指結構的結構域。該蛋白質的作用為轉錄調控。該蛋白質在果蠅體內,可用來回復由其他蛋白質引起的表型,推測是在演化時留下的功能[7]

交互作用

LHX2已證實會與CITED2交互作用[8]

參考資料

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106689 - Ensembl, May 2017
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000247 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  4. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. 
  5. ^ Wu HK, Heng HH, Siderovski DP, Dong WF, Okuno Y, Shi XM, Tsui LC, Minden MD. Identification of a human LIM-Hox gene, hLH-2, aberrantly expressed in chronic myelogenous leukaemia and located on 9q33-34.1. Oncogene. Jul 1996, 12 (6): 1205–12. PMID 8649822. 
  6. ^ Rincon-Limas DE, Lu CH, Canal I, Calleja M, Rodriguez-Esteban C, Izpisua-Belmonte JC, Botas J. Conservation of the expression and function of apterous orthologs in Drosophila and mammals. Proc Natl Acad Sci U S A. Apr 1999, 96 (5): 2165–70. PMC 26754可免费查阅. PMID 10051612. doi:10.1073/pnas.96.5.2165. 
  7. ^ 7.0 7.1 Entrez Gene: LHX2 LIM homeobox 2. 
  8. ^ Glenn, D J; Maurer R A. MRG1 binds to the LIM domain of Lhx2 and may function as a coactivator to stimulate glycoprotein hormone alpha-subunit gene expression. J. Biol. Chem. (UNITED STATES). Dec 1999, 274 (51): 36159–67. ISSN 0021-9258. PMID 10593900. doi:10.1074/jbc.274.51.36159. 

延伸閱讀

  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 2004, 14 (10B): 2121–7. PMC 528928可免费查阅. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504.  引文格式1维护:显式使用等标签 (link)
  • Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat. Genet. 2004, 36 (1): 40–5. PMID 14702039. doi:10.1038/ng1285.  引文格式1维护:显式使用等标签 (link)
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 99 (26): 16899–903. PMC 139241可免费查阅. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899.  引文格式1维护:显式使用等标签 (link)
  • Glenn DJ, Maurer RA. MRG1 binds to the LIM domain of Lhx2 and may function as a coactivator to stimulate glycoprotein hormone alpha-subunit gene expression. J. Biol. Chem. 2000, 274 (51): 36159–67. PMID 10593900. doi:10.1074/jbc.274.51.36159. 
  • Bach I, Rodriguez-Esteban C, Carrière C et al. RLIM inhibits functional activity of LIM homeodomain transcription factors via recruitment of the histone deacetylase complex. Nat. Genet. 1999, 22 (4): 394–9. PMID 10431247. doi:10.1038/11970.  引文格式1维护:显式使用等标签 (link)
  • Bendall AJ, Rincón-Limas DE, Botas J, Abate-Shen C. Protein complex formation between Msx1 and Lhx2 homeoproteins is incompatible with DNA binding activity. Differentiation. 1998, 63 (3): 151–7. PMID 9697309. doi:10.1046/j.1432-0436.1998.6330151.x. 



 
(1) 碱性结构域
(1.1)碱性亮氨酸拉链
bZIP英语bZIP domain
转录激活因子英语Activating transcription factorAATF英语Apoptosis-antagonizing transcription factor1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 ·
C/EBPαβγδ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) ·
NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1
(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
bHLH
ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) ·
HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 ·
肌形成调节因子英语Myogenic regulatory factors(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD(1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 ·
Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1
(1.3)bHLH-ZIP英语Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factors
AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2)
(1.4) NF-1
NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4)
(1.5) RF-X
RFX(1、2、3、4、5、ANK)
(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋英语Basic helix-span-helix
(bHSH)
AP-2(α、β、γ、δ、ε)
 
(2) 锌指结构DNA作用区域
(2.1) 核受体Cys4
第一亚族:甲状腺激素受体αβ)、CAR、FXRLXR(α、β)、PPARα英语Peroxisome proliferator-activated receptor alpha、β/δ、γ)、PXR、RAR(α、β、γ)、ROR(α、β、γ)、
Rev-ErbA(α、β)、VDR
第二亚族(COUP-TF(I、II)、Ear-2英语V-erbA-related geneHNF4英语Hepatocyte nuclear factor 4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX)
第三亚族(甾类激素英语Steroid hormone receptor雄激素、雌激素(α、β)、糖皮质激素、盐皮质激素、孕酮)、雌激素相关英语Estrogen related receptor(α、β、γ))
第四亚族NUR英语Nur (biology)(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF英语Germ cell nuclear factor · 第零亚族DAX1、SHP英语Small heterodimer partner
(2.2) 其他的Cys4结构
GATA英语GATA transcription factor(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1英语Tricho-rhino-phalangeal syndrome Type 1
(2.3) Cys2His2
通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2))
ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、234 · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) ·
HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族KLF:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17,SP:1、2、4、7、8 · MTF1 · MYT1 ·
OSR1 ·  · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、
34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、
423、451、452、471、593、638、649、655)
(2.4) Cys6
HIVEP1
(2.5)交替composition
AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B
(2.6)WRKY结构
WRKY转录因子家族英语WRKY transcription factor family
 
(3)螺旋-转角-螺旋结构域
ARX英语Aristaless related homeobox · CDX1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2)  · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、
D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、八聚体转录因子:1、2、3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB1、2)
(3.2)配对框
PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9)
(3.3)叉头状/翼状螺旋
E2F1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2P3
(3.4)热休克因子英语Heat Shock Factor
HSF(1、2、4)
(3.5)色氨酸簇英语Tryptophan clusters
ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2
(3.6)TEA结构域
transcriptional enhancer factor(1、2、3、4)
 
(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子
(4.1) Rel homology region英语Rel homology domain
NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5)
(4.2) STAT
STAT1234、5、6
(4.3) p53样转录因子
p53 p63 p73家族p53 · p63 · p73 · TBX(1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1)
(4.4) MADS盒
Mef2(A、B、C、D) · SRF
(4.7) 高迁移率族
BBX英语BBX (gene) · HMGB1英语HMGB12英语HMGB23英语HMGB34英语HMGB4 · HMGN英语HMGN、(1英语HMGN12英语HMGN23英语HMGN34英语HMGN4 · HNF(1A、1B) · SOX(1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21、SRY · SSRP1 ·
TCF/LEF家族TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4)
(4.9) Grainyhead英语Grainyhead
TFCP2
(4.10) 冷休克域英语Cold-shock domain
CSDA、YBX1
(4.11) Runt
CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1)
 
(0) 其他转录因子
(0.2) HMGI(Y)
HMGA(1、2) · HBP1
(0.3) 袋状结构域
Rb · RBL1英语Retinoblastoma-like protein 1 · RBL2英语Retinoblastoma-like protein 2
(0.5) AP-2/EREBP-related factors
Apetala 2 · EREBP英语Ethylene-responsive element binding protein · B3(ARF · ABI3 · RAV)
(0.6) Miscellaneous
ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/σ因子
参见 转录因子/共调节因子缺陷英语Template:Transcription factor/coregulator deficiencies
Category:蛋白质生物合成模板