VCAM-1

VCAM-1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1IJ9, 1VCA, 1VSC

Идентификаторы
ПсевдонимыVCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1
Внешние IDOMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме VCAM1
Расположение в геноме VCAM1
Локус1p21.2Начало100,719,742 bp[1]
Конец100,739,045 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме VCAM1
Расположение в геноме VCAM1
Локус3 G1|3 50.17 cMНачало115,903,598 bp[2]
Конец115,923,337 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • parietal pleura

  • metanephric glomerulus
Наибольшая экспрессия в
  • left lung lobe

  • ankle joint

  • body of femur
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • primary amine oxidase activity
  • integrin binding
  • cell adhesion molecule binding
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • аппарат Гольджи
  • alpha9-beta1 integrin-vascular cell adhesion molecule-1 complex
  • мембрана
  • filopodium
  • клеточная мембрана
  • apical part of cell
  • Микроворсинка
  • поверхность клетки
  • early endosome
  • эндоплазматический ретикулум
  • podosome
  • Сарколемма
  • экзосома
  • наружная сторона клеточной мембраны
  • внеклеточное пространство
  • часть клеточной мембраны
Биологический процесс
  • leukocyte cell-cell adhesion
  • response to ionizing radiation
  • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
  • response to hypoxia
  • response to nutrient
  • interferon-gamma-mediated signaling pathway
  • cellular response to tumor necrosis factor
  • response to nicotine
  • старение человека
  • response to zinc ion
  • extracellular matrix organization
  • amine metabolic process
  • response to lipopolysaccharide
  • агрегация клеток
  • acute inflammatory response
  • positive regulation of T cell proliferation
  • membrane to membrane docking
  • regulation of immune response
  • leukocyte tethering or rolling
  • cell chemotaxis
  • B cell differentiation
  • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
  • cell-matrix adhesion
  • вирусный процесс
  • response to ethanol
  • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
  • chronic inflammatory response
  • cell-cell adhesion
  • cytokine-mediated signaling pathway
  • heterotypic cell-cell adhesion
  • иннервация
  • cardiac neuron differentiation
  • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus
  • cellular response to amyloid-beta
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

7412

22329

Ensembl

ENSG00000162692

ENSMUSG00000027962

UniProt

P19320

P29533

RefSeq (мРНК)

NM_080682
NM_001078
NM_001199834

NM_011693

RefSeq (белок)

NP_001069
NP_001186763
NP_542413

NP_035823

Локус (UCSC)Chr 1: 100.72 – 100.74 MbChr 3: 115.9 – 115.92 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

VCAM-1 (CD106, англ. Vascular cell adhesion molecule 1, «васкулярная молекула клеточной адгезии 1») — белок, входящий в суперсемейство иммуноглобулинов, играющий значительную роль в иммунной системе человека. VCAM-1 участвует в адгезии лейкоцитов и эндотелиальных клеток, передаче сигналов, может иметь отношение к развитию атеросклероза и ревматоидного артрита. Описаны два транскрипта гена, порождаемые альтернативным сплайсингом и производящие две изоформы белка[5].

Ингибирование взаимодействия между VCAM-1 и интегрином α4β1 используется в качестве терапевтической стратегии при рассеянном склерозе и является одним из механизмов действия натализумаба[6].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162692 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027962 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Entrez Gene: VCAM1 vascular cell adhesion molecule 1  (неопр.).
  6. Rey K., Rivera-Nieves J., Sandborn W.J., Shattil S. Integrin-based therapeutics:biological basis, clinical use and new drugs (англ.) // Nat. Rev. Drug Discov. — 2016. — Vol. 15, no. 3. — P. 173-183. — doi:10.1038/nrd.2015.10.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400