CD47

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2JJS, 2JJT, 2VSC, 4CMM, 4KJY, 5IWL

Ідентифікатори

Символи

CD47, IAP, MER6, OA3, CD47 molecule

Зовнішні ІД

OMIM: 601028 MGI: 96617 HomoloGene: 1346 GeneCards: CD47

Онтологія гена
Молекулярна функція	• thrombospondin receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion • cell-cell adhesion mediator activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • specific granule membrane • tertiary granule membrane • екзосома • cell surface
Біологічний процес	• integrin-mediated signaling pathway • positive regulation of phagocytosis • адгезія клітин • extracellular matrix organization • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of T cell activation • response to bacterium • leukocyte migration • positive regulation of cell population proliferation • Опсонізація • positive regulation of cell-cell adhesion • neutrophil degranulation • cell migration • regulation of interferon-gamma production • regulation of interleukin-10 production • regulation of interleukin-12 production • regulation of interleukin-6 production • regulation of tumor necrosis factor production • heterotypic cell-cell adhesion • monocyte extravasation • regulation of nitric oxide biosynthetic process • positive regulation of stress fiber assembly • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to interleukin-12 • cell-cell adhesion • negative regulation of Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


961


16423

Ensembl


ENSG00000196776


ENSMUSG00000055447

UniProt


Q08722


Q61735

RefSeq (мРНК)


NM_001025079 NM_001025080 NM_001777 NM_198793 NM_001382306


NM_010581 NM_001368415 NM_001368416 NM_001368417 NM_001368418

RefSeq (білок)


NP_001768 NP_942088 NP_001369235


NP_034711 NP_001355344 NP_001355345 NP_001355346 NP_001355347

Локус (UCSC)

Хр. 3: 108.04 – 108.09 Mb

Хр. 16: 49.62 – 49.74 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CD47 (англ. CD47 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 323 амінокислот, а молекулярна маса — 35 214^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWPLVAALLL	GSACCGSAQL	LFNKTKSVEF	TFCNDTVVIP	CFVTNMEAQN
TTEVYVKWKF	KGRDIYTFDG	ALNKSTVPTD	FSSAKIEVSQ	LLKGDASLKM
DKSDAVSHTG	NYTCEVTELT	REGETIIELK	YRVVSWFSPN	ENILIVIFPI
FAILLFWGQF	GIKTLKYRSG	GMDEKTIALL	VAGLVITVIV	IVGAILFVPG
EYSLKNATGL	GLIVTSTGIL	ILLHYYVFST	AIGLTSFVIA	ILVIQVIAYI
LAVVGLSLCI	AACIPMHGPL	LISGLSILAL	AQLLGLVYMK	FVASNQKTIQ
PPRKAVEEPL	NAFKESKGMM	NDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Lindberg F.P., Gresham H.D., Schwarz E., Brown E.J. (1993). Molecular cloning of integrin-associated protein: an immunoglobulin family member with multiple membrane spanning domains implicated in alpha-v beta-3-dependent ligand binding. J. Cell Biol. 123: 485—496. PMID 7691831 DOI:10.1083/jcb.123.2.485
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mawby W.J., Holmes C.H., Anstee D.J., Spring F.A., Tanner M.J.A. (1994). Isolation and characterization of CD47 glycoprotein: a multispanning membrane protein which is the same as integrin-associated protein (IAP) and the ovarian tumour marker OA3. Biochem. J. 304: 525—530. PMID 7998989 DOI:10.1042/bj3040525
Wu A.-L., Wang J., Zheleznyak A., Brown E.J. (1999). Ubiquitin-related proteins regulate interaction of vimentin intermediate filaments with the plasma membrane. Mol. Cell. 4: 619—625. PMID 10549293 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80212-9
Rebres R.A., Vaz L.E., Green J.M., Brown E.J. (2001). Normal ligand binding and signaling by CD47 (integrin-associated protein) requires a long range disulfide bond between the extracellular and membrane-spanning domains. J. Biol. Chem. 276: 34607—34616. PMID 11454874 DOI:10.1074/jbc.M106107200
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1682 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q08722 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

п о р Білки: кластери диференціації

1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50

51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100

101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150

151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200

201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249

251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299

301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350