ITGB2

ITGB2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1L3Y, 1YUK, 2JF1, 2P26, 2P28, 3K6S, 3K71, 3K72, 2V7D, 4NEH, 4NEN, 5E6X, 5E6V, 5E6S, 5E6R, 5E6W, 5ES4, 5E6U

Ідентифікатори
Символи ITGB2, CD18, LAD, LCAMB, LFA-1, MAC-1, MF17, MFI7, integrin subunit beta 2
Зовнішні ІД OMIM: 600065 MGI: 96611 HomoloGene: 20092 GeneCards: ITGB2
Пов'язані генетичні захворювання
leukocyte adhesion deficiency-1[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• GO:0032403 protein-containing complex binding
• зв'язування з іоном металу
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• protein heterodimerization activity
• ICAM-3 receptor activity
• protein kinase binding
• cell adhesion molecule binding
• heat shock protein binding
• amyloid-beta binding
• complement component C3b binding
• integrin binding
• signaling receptor activity
• cargo receptor activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• extracellular vesicle
• integrin alphaL-beta2 complex
• мембрана
• клітинна мембрана
• receptor complex
• cell surface
• integrin complex
• екзосома
• specific granule membrane
• tertiary granule membrane
• ficolin-1-rich granule membrane
• focal adhesion
• external side of plasma membrane
• integrin alphaM-beta2 complex
• plasma membrane raft
• membrane raft
• cytoplasmic region
• GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

• leukocyte cell-cell adhesion
• endodermal cell differentiation
• toll-like receptor 4 signaling pathway
• positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
• heterotypic cell-cell adhesion
• cell-cell signaling
• GO:0010260 старіння людини
• receptor internalization
• leukocyte migration involved in inflammatory response
• natural killer cell activation
• cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus
• extracellular matrix organization
• receptor clustering
• positive regulation of angiogenesis
• neutrophil chemotaxis
• адгезія клітин
• positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
• regulation of cell shape
• regulation of immune response
• cellular extravasation
• integrin-mediated signaling pathway
• cell-matrix adhesion
• inflammatory response
• endothelial cell migration
• leukocyte migration
• regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
• GO:0097285 апоптоз
• Фагоцитоз
• neutrophil degranulation
• microglial cell activation
• рецептор-опосередкований ендоцитоз
• phagocytosis, engulfment
• cell migration
• cytokine-mediated signaling pathway
• positive regulation of superoxide anion generation
• cell adhesion mediated by integrin
• positive regulation of neutrophil degranulation
• negative regulation of dopamine metabolic process
• positive regulation of protein targeting to membrane
• amyloid-beta clearance
• cell-cell adhesion
• cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules
• positive regulation of neuron death
• positive regulation of microglial cell activation
• neutrophil migration
• positive regulation of prostaglandin-E synthase activity
• positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3689
16414
Ensembl
ENSG00000160255
ENSMUSG00000000290
UniProt
P05107
P11835
RefSeq (мРНК)
NM_000211
NM_001127491
NM_001303238
NM_008404
RefSeq (білок)
NP_000202
NP_001120963
NP_001290167
NP_032430
Локус (UCSC) Хр. 21: 44.89 – 44.93 Mb Хр. 10: 77.37 – 77.4 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGB2 (англ. Integrin subunit beta 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 84 782[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLGLRPPLLALVGLLSLGCVLSQECTKFKVSSCRECIESGPGCTWCQKLN
FTGPGDPDSIRCDTRPQLLMRGCAADDIMDPTSLAETQEDHNGGQKQLSP
QKVTLYLRPGQAAAFNVTFRRAKGYPIDLYYLMDLSYSMLDDLRNVKKLG
GDLLRALNEITESGRIGFGSFVDKTVLPFVNTHPDKLRNPCPNKEKECQP
PFAFRHVLKLTNNSNQFQTEVGKQLISGNLDAPEGGLDAMMQVAACPEEI
GWRNVTRLLVFATDDGFHFAGDGKLGAILTPNDGRCHLEDNLYKRSNEFD
YPSVGQLAHKLAENNIQPIFAVTSRMVKTYEKLTEIIPKSAVGELSEDSS
NVVQLIKNAYNKLSSRVFLDHNALPDTLKVTYDSFCSNGVTHRNQPRGDC
DGVQINVPITFQVKVTATECIQEQSFVIRALGFTDIVTVQVLPQCECRCR
DQSRDRSLCHGKGFLECGICRCDTGYIGKNCECQTQGRSSQELEGSCRKD
NNSIICSGLGDCVCGQCLCHTSDVPGKLIYGQYCECDTINCERYNGQVCG
GPGRGLCFCGKCRCHPGFEGSACQCERTTEGCLNPRRVECSGRGRCRCNV
CECHSGYQLPLCQECPGCPSPCGKYISCAECLKFEKGPFGKNCSAACPGL
QLSNNPVKGRTCKERDSEGCWVAYTLEQQDGMDRYLIYVDESRECVAGPN
IAAIVGGTVAGIVLIGILLLVIWKALIHLSDLREYRRFEKEKLKSQWNND
NPLFKSATTTVMNPKFAES

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у мембрані.

Література

  • Kishimoto T.K., O'Connor K., Lee A., Roberts T.M., Springer T.A. (1987). Cloning of the beta subunit of the leukocyte adhesion proteins: homology to an extracellular matrix receptor defines a novel supergene family. Cell. 48: 681—690. PMID 3028646 DOI:10.1016/0092-8674(87)90246-7
  • Weitzman J.B., Wells C.E., Wright A.H., Clark P.A., Law S.K.A. (1991). The gene organisation of the human beta 2 integrin subunit (CD18). FEBS Lett. 294: 97—103. PMID 1683838 DOI:10.1016/0014-5793(91)81351-8
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ohashi Y., Yambe T., Tsuchiya S., Kikuchi H., Konno T. (1993). Familial genetic defect in a case of leukocyte adhesion deficiency. Hum. Mutat. 2: 458—467. PMID 7509236 DOI:10.1002/humu.1380020606
  • Fagerholm S., Morrice N., Gahmberg C.G., Cohen P. (2002). Phosphorylation of the cytoplasmic domain of the integrin CD18 chain by protein kinase C isoforms in leukocytes. J. Biol. Chem. 277: 1728—1738. PMID 11700305 DOI:10.1074/jbc.M106856200
  • Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes. Nat. Immunol. 3: 151—158. PMID 11812992 DOI:10.1038/ni755

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6155 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P05107 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350