TNFSF13B

TNFSF13B
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1JH5, 1KD7, 1KXG, 1OQD, 1OQE, 1OSG, 3V56, 4V46, 4ZCH

Ідентифікатори
Символи TNFSF13B, BAFF, BLYS, CD257, DTL, TALL-1, TALL1, THANK, TNFSF20, ZTNF4, TNLG7A, tumor necrosis factor superfamily member 13b, TNF superfamily member 13b
Зовнішні ІД OMIM: 603969 MGI: 1344376 HomoloGene: 48443 GeneCards: TNFSF13B
Реагує на сполуку
belimumab[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• tumor necrosis factor receptor binding
• cytokine activity
• signaling receptor binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding

Клітинна компонента

• цитоплазма
• integral component of membrane
• perinuclear region of cytoplasm
• extracellular region
• клітинна мембрана
• мембрана
• міжклітинний простір

Біологічний процес

• проліферація
• tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
• GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• positive regulation of cell population proliferation
• процес імунної системи
• regulation of immune response
• T cell costimulation
• B cell homeostasis
• B cell costimulation
• positive regulation of T cell proliferation
• positive regulation of B cell proliferation
• positive regulation of germinal center formation
• regulation of signaling receptor activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10673
24099
Ensembl
ENSG00000102524
ENSMUSG00000031497
UniProt
Q9Y275
Q9WU72
RefSeq (мРНК)
NM_001145645
NM_006573
NM_033622
NM_001347309
RefSeq (білок)
NP_001139117
NP_006564
NP_001334238
NP_296371
Локус (UCSC) Хр. 13: 108.25 – 108.31 Mb Хр. 8: 10.06 – 10.09 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TNFSF13B (англ. TNF superfamily member 13b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 285 амінокислот, а молекулярна маса — 31 223[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDDSTEREQSRLTSCLKKREEMKLKECVSILPRKESPSVRSSKDGKLLAA
TLLLALLSCCLTVVSFYQVAALQGDLASLRAELQGHHAEKLPAGAGAPKA
GLEEAPAVTAGLKIFEPPAPGEGNSSQNSRNKRAVQGPEETVTQDCLQLI
ADSETPTIQKGSYTFVPWLLSFKRGSALEEKENKILVKETGYFFIYGQVL
YTDKTYAMGHLIQRKKVHVFGDELSLVTLFRCIQNMPETLPNNSCYSAGI
AKLEEGDELQLAIPRENAQISLDGDVTFFGALKLL

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • Gavin A.L., Ait-Azzouzene D., Ware C.F., Nemazee D. (2003). DeltaBAFF, an alternate splice isoform that regulates receptor binding and biopresentation of the B cell survival cytokine, BAFF. J. Biol. Chem. 278: 38220—38228. PMID 12867412 DOI:10.1074/jbc.M306852200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Shu H.-B., Hu W.-H., Johnson H. (1999). TALL-1 is a novel member of the TNF family that is down-regulated by mitogens. J. Leukoc. Biol. 65: 680—683. PMID 10331498

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з TNFSF13B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11929 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q9Y275 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 13
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350