CLIC6

Ідентифікатори

Символи

CLIC6, CLIC1L, chloride intracellular channel 6

Зовнішні ІД

OMIM: 615321 MGI: 2146607 HomoloGene: 43154 GeneCards: CLIC6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• voltage-gated ion channel activity • glutathione transferase activity • chloride channel activity • D2 dopamine receptor binding • D3 dopamine receptor binding • D4 dopamine receptor binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • chloride channel complex • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport • chloride transport • ion transport • glutathione metabolic process • chloride transmembrane transport • GO:0015915 транспорт • ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


54102


209195

Ensembl


ENSG00000159212


ENSMUSG00000022949

UniProt


Q96NY7


Q8BHB9

RefSeq (мРНК)


NM_053277 NM_001317009


NM_172469

RefSeq (білок)


NP_001303938 NP_444507


NP_766057

Локус (UCSC)

Хр. 21: 34.67 – 34.72 Mb

Хр. 16: 92.28 – 92.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLIC6 (англ. Chloride intracellular channel 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 704 амінокислот, а молекулярна маса — 73 012^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEAAEPEGV	APGPQGPPEV	PAPLAERPGE	PGAAGGEAEG	PEGSEGAEEA
PRGAAAVKEA	GGGGPDRGPE	AEARGTRGAH	GETEAEEGAP	EGAEVPQGGE
ETSGAQQVEG	ASPGRGAQGE	PRGEAQREPE	DSAAPERQEE	AEQRPEVPEG
SASGEAGDSV	DAEGPLGDNI	EAEGPAGDSV	EAEGRVGDSV	DAEGPAGDSV
DAEGPLGDNI	QAEGPAGDSV	DAEGRVGDSV	DAEGPAGDSV	DAEGRVGDSV
EAGDPAGDGV	EAGVPAGDSV	EAEGPAGDSM	DAEGPAGRAR	RVSGEPQQSG
DGSLSPQAEA	IEVAAGESAG	RSPGELAWDA	AEEAEVPGVK	GSEEAAPGDA
RADAGEDRVG	DGPQQEPGED	EERRERSPEG	PREEEAAGGE	EESPDSSPHG
EASRGAAEPE	AQLSNHLAEE	GPAEGSGEAA	RVNGRREDGE	ASEPRALGQE
HDITLFVKVK	LTALGCSRIA	IKKYLRAGYD	GESIGNCPFS	QRLFMILWLK
GVIFNVTTVD	LKRKPADLQN	LAPGTNPPFM	TFDGEVKTDV	NKIEEFLEEK
LAPPRYPKLG	TQHPESNSAG	NDVFAKFSAF	IKNTKKDANE	IHEKNLLKAL
RKLDNYLNSP	LPDEIDAYST	EDVTVSGRKF	LDGDELTLAD	CNLLPKLHII
KIVAKKYRDF	EFPSEMTGIW	RYLNNAYARD	EFTNTCPADQ	EIEHAYSDVA
KRMK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2065 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96NY7 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані