KCNIP1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1S1E, 2I2R, 2NZ0

Ідентифікатори

Символи

KCNIP1, KCHIP1, VABP, potassium voltage-gated channel interacting protein 1

Зовнішні ІД

OMIM: 604660 MGI: 1917607 HomoloGene: 22824 GeneCards: KCNIP1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • potassium channel regulator activity • potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • cell projection • дендрит (нейробіологія) • мембрана
Біологічний процес	• potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


30820


70357

Ensembl


ENSG00000182132


ENSMUSG00000053519

UniProt


Q9NZI2


Q9JJ57

RefSeq (мРНК)


NM_001034837 NM_001034838 NM_001278339 NM_001278340 NM_014592


NM_001190885 NM_001190886 NM_001290690 NM_027398 NM_001363115

RefSeq (білок)


NP_001030009 NP_001030010 NP_001265268 NP_001265269 NP_055407


NP_001177814 NP_001177815 NP_001277619 NP_081674 NP_001350044

Локус (UCSC)

Хр. 5: 170.35 – 170.74 Mb

Хр. 11: 33.58 – 33.94 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNIP1 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 26 817^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAVMGTFSS	LQTKQRRPSK	DIAWWYYQYQ	RDKIEDELEM	TMVCHRPEGL
EQLEAQTNFT	KRELQVLYRG	FKNECPSGVV	NEDTFKQIYA	QFFPHGDAST
YAHYLFNAFD	TTQTGSVKFE	DFVTALSILL	RGTVHEKLRW	TFNLYDINKD
GYINKEEMMD	IVKAIYDMMG	KYTYPVLKED	TPRQHVDVFF	QKMDKNKDGI
VTLDEFLESC	QEDDNIMRSL	QLFQNVM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Van Hoorick D., Raes A., Keysers W., Mayeur E., Snyders D.J. (2003). Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants. Mol. Cell. Neurosci. 24: 357—366. PMID 14572458 DOI:10.1016/S1044-7431(03)00174-X
Lin Y.-L., Lin S.-R., Wu T.T., Chang L.-S. (2004). Evidence showing an intermolecular interaction between KChIP proteins and Taiwan cobra cardiotoxins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 720—724. PMID 15184042 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.05.064
Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
Pioletti M., Findeisen F., Hura G.L., Minor D.L. Jr. (2006). Three-dimensional structure of the KChIP1-Kv4.3 T1 complex reveals a cross-shaped octamer. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 987—995. PMID 17057713 DOI:10.1038/nsmb1164

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15521 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NZI2 (англ.) . Архів оригіналу за 1 травня 2018. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані