TRPM6

Ідентифікатори

Символи

TRPM6, CHAK2, HMGX, HOMG, HOMG1, HSH, transient receptor potential cation channel subfamily M member 6

Зовнішні ІД

OMIM: 607009 MGI: 2675603 HomoloGene: 9767 GeneCards: TRPM6

Пов'язані генетичні захворювання

intestinal hypomagnesemia 1^[1]

Реагує на сполуку

2-aminoethoxydiphenylborate, гідрон^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cation channel activity • ATP binding • calcium channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • brush border membrane • apical plasma membrane
Біологічний процес	• фосфорилювання • GO:0070839 metal ion transport • cation transport • ion transport • protein tetramerization • protein phosphorylation • calcium ion transmembrane transport • response to toxic substance • calcium ion transport • трансмембранний транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


140803


225997

Ensembl


ENSG00000119121


ENSMUSG00000024727

UniProt


Q9BX84


Q8CIR4

RefSeq (мРНК)


NM_001177310 NM_001177311 NM_017662


NM_153417

RefSeq (білок)


NP_001170781 NP_001170782 NP_060132


NP_700466

Локус (UCSC)

Хр. 9: 74.72 – 74.89 Mb

Хр. 19: 18.73 – 18.87 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPM6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 022 амінокислот, а молекулярна маса — 231 708^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKEQPVLERL	QSQKSWIKGV	FDKRECSTII	PSSKNPHRCT	PVCQVCQNLI
RCYCGRLIGD	HAGIDYSWTI	SAAKGKESEQ	WSVEKHTTKS	PTDTFGTINF
QDGEHTHHAK	YIRTSYDTKL	DHLLHLMLKE	WKMELPKLVI	SVHGGIQNFT
MPSKFKEIFS	QGLVKAAETT	GAWIITEGIN	TGVSKHVGDA	LKSHSSHSLR
KIWTVGIPPW	GVIENQRDLI	GKDVVCLYQT	LDNPLSKLTT	LNSMHSHFIL
SDDGTVGKYG	NEMKLRRNLE	KYLSLQKIHC	RSRQGVPVVG	LVVEGGPNVI
LSVWETVKDK	DPVVVCEGTG	RAADLLAFTH	KHLADEGMLR	PQVKEEIICM
IQNTFNFSLK	QSKHLFQILM	ECMVHRDCIT	IFDADSEEQQ	DLDLAILTAL
LKGTNLSASE	QLNLAMAWDR	VDIAKKHILI	YEQHWKPDAL	EQAMSDALVM
DRVDFVKLLI	EYGVNLHRFL	TIPRLEELYN	TKQGPTNTLL	HHLVQDVKQH
TLLSGYRITL	IDIGLVVEYL	IGRAYRSNYT	RKHFRALYNN	LYRKYKHQRH
SSGNRNESAE	STLHSQFIRT	AQPYKFKEKS	IVLHKSRKKS	KEQNVSDDPE
STGFLYPYND	LLVWAVLMKR	QKMAMFFWQH	GEEATVKAVI	ACILYRAMAH
EAKESHMVDD	ASEELKNYSK	QFGQLALDLL	EKAFKQNERM	AMTLLTYELR
NWSNSTCLKL	AVSGGLRPFV	SHTCTQMLLT	DMWMGRLKMR	KNSWLKIIIS
IILPPTILTL	EFKSKAEMSH	VPQSQDFQFM	WYYSDQNASS	SKESASVKEY
DLERGHDEKL	DENQHFGLES	GHQHLPWTRK	VYEFYSAPIV	KFWFYTMAYL
AFLMLFTYTV	LVEMQPQPSV	QEWLVSIYIF	TNAIEVVREI	CISEPGKFTQ
KVKVWISEYW	NLTETVAIGL	FSAGFVLRWG	DPPFHTAGRL	IYCIDIIFWF
SRLLDFFAVN	QHAGPYVTMI	AKMTANMFYI	VIIMAIVLLS	FGVARKAILS
PKEPPSWSLA	RDIVFEPYWM	IYGEVYAGEI	DVCSSQPSCP	PGSFLTPFLQ
AVYLFVQYII	MVNLLIAFFN	NVYLDMESIS	NNLWKYNRYR	YIMTYHEKPW
LPPPLILLSH	VGLLLRRLCC	HRAPHDQEEG	DVGLKLYLSK	EDLKKLHDFE
EQCVEKYFHE	KMEDVNCSCE	ERIRVTSERV	TEMYFQLKEM	NEKVSFIKDS
LLSLDSQVGH	LQDLSALTVD	TLKVLSAVDT	LQEDEALLAK	RKHSTCKKLP
HSWSNVICAE	VLGSMEIAGE	KKYQYYSMPS	SLLRSLAGGR	HPPRVQRGAL
LEITNSKREA	TNVRNDQERQ	ETQSSIVVSG	VSPNRQAHSK	YGQFLLVPSN
LKRVPFSAET	VLPLSRPSVP	DVLATEQDIQ	TEVLVHLTGQ	TPVVSDWASV
DEPKEKHEPI	AHLLDGQDKA	EQVLPTLSCT	PEPMTMSSPL	SQAKIMQTGG
GYVNWAFSEG	DETGVFSIKK	KWQTCLPSTC	DSDSSRSEQH	QKQAQDSSLS
DNSTRSAQSS	ECSEVGPWLQ	PNTSFWINPL	RRYRPFARSH	SFRFHKEEKL
MKICKIKNLS	GSSEIGQGAW	VKAKMLTKDR	RLSKKKKNTQ	GLQVPIITVN
ACSQSDQLNP	EPGENSISEE	EYSKNWFTVS	KFSHTGVEPY	IHQKMKTKEI
GQCAIQISDY	LKQSQEDLSK	NSLWNSRSTN	LNRNSLLKSS	IGVDKISASL
KSPQEPHHHY	SAIERNNLMR	LSQTIPFTPV	QLFAGEEITV	YRLEESSPLN
LDKSMSSWSQ	RGRAAMIQVL	SREEMDGGLR	KAMRVVSTWS	EDDILKPGQV
FIVKSFLPEV	VRTWHKIFQE	STVLHLCLRE	IQQQRAAQKL	IYTFNQVKPQ
TIPYTPRFLE	VFLIYCHSAN	QWLTIEKYMT	GEFRKYNNNN	GDEITPTNTL
EELMLAFSHW	TYEYTRGELL	VLDLQGVGEN	LTDPSVIKPE	VKQSRGMVFG
PANLGEDAIR	NFIAKHHCNS	CCRKLKLPDL	KRNDYSPERI	NSTFGLEIKI
ESAEEPPARE	TGRNSPEDDM	QL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Riazanova L.V., Pavur K.S., Petrov A.N., Dorovkov M.V., Riazanov A.G. (2001). Novel type of signaling molecules: protein kinases covalently linked to ion channels. Mol. Biol. (Mosk.). 35: 321—332. PMID 11357414

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPM6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17995 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9BX84 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані