ARNTL

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4H10

Ідентифікатори

Символи

ARNTL, BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like

Зовнішні ІД

OMIM: 602550 MGI: 1096381 HomoloGene: 910 GeneCards: ARNTL

Пов'язані генетичні захворювання

шизофренія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • Hsp90 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • aryl hydrocarbon receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • core promoter sequence-specific DNA binding • bHLH transcription factor binding • sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • PML body • внутрішньоклітинна мембранна органела • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • ядерні тільця • chromatoid body
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • transcription, DNA-templated • regulation of hair cycle • transcription by RNA polymerase II • Сперматогенез • циркадний ритм • negative regulation of TOR signaling • circadian regulation of gene expression • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • positive regulation of circadian rhythm • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of fat cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of neurogenesis • regulation of insulin secretion • regulation of cell cycle • response to redox state • maternal process involved in parturition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • oxidative stress-induced premature senescence • regulation of type B pancreatic cell development • negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway • regulation of cellular senescence • positive regulation of skeletal muscle cell differentiation • positive regulation of protein acetylation • negative regulation of cold-induced thermogenesis • protein import into nucleus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


406


11865

Ensembl


ENSG00000133794


ENSMUSG00000055116

UniProt


O00327


Q9WTL8

RefSeq (мРНК)

NM_001030272 NM_001030273 NM_001178 NM_001297719 NM_001297722
NM_001297724


NM_001243048 NM_007489 NM_001357070 NM_001368412 NM_001374642

RefSeq (білок)

NP_001025443 NP_001025444 NP_001169 NP_001284648 NP_001284651
NP_001284653 NP_001338733 NP_001338734 NP_001338735 NP_001338736 NP_001338737 NP_001338738 NP_001338739 NP_001338740 NP_001338741 NP_001338742 NP_001338743 NP_001338744 NP_001338745 NP_001338746 NP_001338747 NP_001338748 NP_001338749 NP_001338750 NP_001338751 NP_001338752 NP_001338753


NP_001229977 NP_031515 NP_001343999 NP_001355341 NP_001361571

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 7: 112.81 – 112.91 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARNTL (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 68 762^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MADQRMDISS	TISDFMSPGP	TDLLSSSLGT	SGVDCNRKRK	GSSTDYQESM
DTDKDDPHGR	LEYTEHQGRI	KNAREAHSQI	EKRRRDKMNS	FIDELASLVP
TCNAMSRKLD	KLTVLRMAVQ	HMKTLRGATN	PYTEANYKPT	FLSDDELKHL
ILRAADGFLF	VVGCDRGKIL	FVSESVFKIL	NYSQNDLIGQ	SLFDYLHPKD
IAKVKEQLSS	SDTAPRERLI	DAKTGLPVKT	DITPGPSRLC	SGARRSFFCR
MKCNRPSVKV	EDKDFPSTCS	KKKADRKSFC	TIHSTGYLKS	WPPTKMGLDE
DNEPDNEGCN	LSCLVAIGRL	HSHVVPQPVN	GEIRVKSMEY	VSRHAIDGKF
VFVDQRATAI	LAYLPQELLG	TSCYEYFHQD	DIGHLAECHR	QVLQTREKIT
TNCYKFKIKD	GSFITLRSRW	FSFMNPWTKE	VEYIVSTNTV	VLANVLEGGD
PTFPQLTASP	HSMDSMLPSG	EGGPKRTHPT	VPGIPGGTRA	GAGKIGRMIA
EEIMEIHRIR	GSSPSSCGSS	PLNITSTPPP	DASSPGGKKI	LNGGTPDIPS
SGLLSGQAQE	NPGYPYSDSS	SILGENPHIG	IDMIDNDQGS	SSPSNDEAAM
AVIMSLLEAD	AGLGGPVDFS	DLPWPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Ikeda M., Nomura M. (1997). cDNA cloning and tissue-specific expression of a novel basic helix-loop-helix/PAS protein (BMAL1) and identification of alternatively spliced variants with alternative translation initiation site usage. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 258—264. PMID 9144434 DOI:10.1006/bbrc.1997.6371
Hogenesch J.B., Gu Y.Z., Jain S., Bradfield C.A. (1998). The basic-helix-loop-helix-PAS orphan MOP3 forms transcriptionally active complexes with circadian and hypoxia factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5474—5479. PMID 9576906 DOI:10.1073/pnas.95.10.5474
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 DOI:10.1126/science.1060698
Richards J., Gumz M.L. (2013). Mechanism of the circadian clock in physiology. Am. J. Physiol. 304: R1053—R1064. PMID 23576606 DOI:10.1152/ajpregu.00066.2013
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ARNTL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:701 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O00327 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма