SMAD1

SMAD1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1KHU, 2LAW, 2LAX, 2LAY, 2LAZ, 2LB0, 2LB1, 3Q47, 3Q4A

Ідентифікатори
Символи SMAD1, BSP-1, BSP1, JV4-1, JV41, MADH1, MADR1, SMAD family member 1
Зовнішні ІД OMIM: 601595 MGI: 109452 HomoloGene: 21196 GeneCards: SMAD1
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
co-SMAD binding
protein homodimerization activity
I-SMAD binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
protein heterodimerization activity
protein kinase binding
sequence-specific DNA binding
DEAD/H-box RNA helicase binding
primary miRNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
integral component of membrane
SMAD protein complex
гіалоплазма
transcription regulator complex
внутрішньоклітинний
нуклеоплазма
nuclear inner membrane
клітинне ядро
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus
SMAD protein complex assembly
ureteric bud development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
SMAD protein signal transduction
embryonic pattern specification
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
hindbrain development
cellular response to BMP stimulus
cardiac muscle cell proliferation
BMP signaling pathway
transcription, DNA-templated
MAPK cascade
protein phosphorylation
gamete generation
cartilage development
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of osteoblast differentiation
positive regulation of cartilage development
GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing
mesodermal cell fate commitment
inflammatory response
bone development
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
midbrain development
GO:0072468 сигнальна трансдукція
negative regulation of cell population proliferation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
osteoblast fate commitment
homeostatic process
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
protein deubiquitination
positive regulation of sprouting angiogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4086
17125
Ensembl
ENSG00000170365
ENSMUSG00000031681
UniProt
Q15797
P70340
RefSeq (мРНК)
NM_001003688
NM_005900
NM_008539
RefSeq (білок)
NP_001003688
NP_005891
NP_001341740
NP_001341741
NP_001341742
NP_001341743
NP_001341745
NP_001341746
NP_032565
Локус (UCSC) н/д Хр. 8: 80.07 – 80.13 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SMAD1 (англ. SMAD family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 260[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNVTSLFSFTSPAVKRLLGWKQGDEEEKWAEKAVDALVKKLKKKKGAMEE
LEKALSCPGQPSNCVTIPRSLDGRLQVSHRKGLPHVIYCRVWRWPDLQSH
HELKPLECCEFPFGSKQKEVCINPYHYKRVESPVLPPVLVPRHSEYNPQH
SLLAQFRNLGQNEPHMPLNATFPDSFQQPNSHPFPHSPNSSYPNSPGSSS
STYPHSPTSSDPGSPFQMPADTPPPAYLPPEDPMTQDGSQPMDTNMMAPP
LPSEINRGDVQAVAYEEPKHWCSIVYYELNNRVGEAFHASSTSVLVDGFT
DPSNNKNRFCLGLLSNVNRNSTIENTRRHIGKGVHLYYVGGEVYAECLSD
SSIFVQSRNCNYHHGFHPTTVCKIPSGCSLKIFNNQEFAQLLAQSVNHGF
ETVYELTKMCTIRMSFVKGWGAEYHRQDVTSTPCWIEIHLHGPLQWLDKV
LTQMGSPHNPISSVS

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Lechleider R.J., de Caestecker M.P., Dehejia A., Polymeropoulos M.H., Roberts A.B. (1996). Serine phosphorylation, chromosomal localization, and transforming growth factor-beta signal transduction by human bsp-1. J. Biol. Chem. 271: 17617—17620. PMID 8663601 DOI:10.1074/jbc.271.30.17617
  • Zhang Y., Feng X.-H., Wu R.-Y., Derynck R. (1996). Receptor-associated Mad homologues synergize as effectors of the TGF-beta response. Nature. 383: 168—172. PMID 8774881 DOI:10.1038/383168a0
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kretzschmar M., Liu F., Hata A., Doody J., Massague J. (1997). The TGF-beta family mediator Smad1 is phosphorylated directly and activated functionally by the BMP receptor kinase. Genes Dev. 11: 984—995. PMID 9136927 DOI:10.1101/gad.11.8.984
  • Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
  • Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00012-X

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6767 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q15797 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.