HIF1A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1H2K, 1H2L, 1H2M, 1L3E, 1L8C, 1LM8, 1LQB, 2ILM, 3HQR, 3HQU, 4AJY, 4H6J

Ідентифікатори

Символи

HIF1A, HIF-1-alpha, HIF-1A, HIF-1alpha, HIF1, HIF1-ALPHA, MOP1, PASD8, bHLHe78, hypoxia inducible factor 1 alpha subunit, hypoxia inducible factor 1 subunit alpha, HIF-1α

Зовнішні ІД

OMIM: 603348 MGI: 106918 HomoloGene: 1171 GeneCards: HIF1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding • transcription factor binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • protein kinase binding • Hsp90 protein binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • ubiquitin protein ligase binding • protein heterodimerization activity • E-box binding • p53 binding • protein domain specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • motile cilium • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex • axon cytoplasm • нуклеоплазма • ядерні тільця • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • B-1 B cell homeostasis • regulation of transforming growth factor beta2 production • muscle cell cellular homeostasis • outflow tract morphogenesis • negative regulation of ossification • heart looping • negative regulation of TOR signaling • blood vessel development • hemoglobin biosynthetic process • Ангіогенез • positive regulation of chemokine-mediated signaling pathway • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • positive regulation of hormone biosynthetic process • negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process • regulation of aerobic respiration • positive regulation of neuroblast proliferation • dopaminergic neuron differentiation • lactate metabolic process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • positive regulation of erythrocyte differentiation • glucose homeostasis • vascular endothelial growth factor production • regulation of thymocyte apoptotic process • positive regulation of epithelial cell migration • negative regulation of thymocyte apoptotic process • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • axonal transport of mitochondrion • positive regulation of macroautophagy • cartilage development • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • лактація • negative regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • digestive tract morphogenesis • диференціація клітин • neural fold elevation formation • positive regulation of autophagy • retina vasculature development in camera-type eye • collagen metabolic process • embryonic placenta development • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of angiogenesis • regulation of glycolytic process • Епітеліально-мезенхімальний перехід • cerebral cortex development • регуляція експресії генів • positive regulation of chemokine production • intestinal epithelial cell maturation • GO:0048552 regulation of catalytic activity • positive regulation of autophagy of mitochondrion • cardiac ventricle morphogenesis • response to muscle activity • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development • visual learning • positive regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of bone mineralization • negative regulation of growth • response to hypoxia • positive regulation of endothelial cell proliferation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • iris morphogenesis • mRNA transcription by RNA polymerase II • hypoxia-inducible factor-1alpha signaling pathway • vasculature development • regulation of cell population proliferation • neural crest cell migration • embryonic hemopoiesis • connective tissue replacement involved in inflammatory response wound healing • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • negative regulation of reactive oxygen species metabolic process • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • elastin metabolic process • positive regulation of glycolytic process • oxygen homeostasis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular iron ion homeostasis • camera-type eye morphogenesis • cellular response to hypoxia • cellular response to interleukin-1 • transcription by RNA polymerase II • protein deubiquitination • посттрансляційна модифікація • response to iron ion • negative regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • GO:1901313 positive regulation of gene expression • cytokine-mediated signaling pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • Убіквітин-залежний протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3091


15251

Ensembl


ENSG00000100644


ENSMUSG00000021109

UniProt


Q16665


Q61221

RefSeq (мРНК)


NM_181054 NM_001243084 NM_001530


NM_010431 NM_001313919 NM_001313920

RefSeq (білок)


NP_001230013 NP_001521 NP_851397 NP_001521.1


NP_001300848 NP_001300849 NP_034561

Локус (UCSC)

Хр. 14: 61.7 – 61.75 Mb

Хр. 12: 73.95 – 73.99 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HIF1A (англ. Hypoxia inducible factor 1 alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 826 амінокислот, а молекулярна маса — 92 670^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGAGGANDK	KKISSERRKE	KSRDAARSRR	SKESEVFYEL	AHQLPLPHNV
SSHLDKASVM	RLTISYLRVR	KLLDAGDLDI	EDDMKAQMNC	FYLKALDGFV
MVLTDDGDMI	YISDNVNKYM	GLTQFELTGH	SVFDFTHPCD	HEEMREMLTH
RNGLVKKGKE	QNTQRSFFLR	MKCTLTSRGR	TMNIKSATWK	VLHCTGHIHV
YDTNSNQPQC	GYKKPPMTCL	VLICEPIPHP	SNIEIPLDSK	TFLSRHSLDM
KFSYCDERIT	ELMGYEPEEL	LGRSIYEYYH	ALDSDHLTKT	HHDMFTKGQV
TTGQYRMLAK	RGGYVWVETQ	ATVIYNTKNS	QPQCIVCVNY	VVSGIIQHDL
IFSLQQTECV	LKPVESSDMK	MTQLFTKVES	EDTSSLFDKL	KKEPDALTLL
APAAGDTIIS	LDFGSNDTET	DDQQLEEVPL	YNDVMLPSPN	EKLQNINLAM
SPLPTAETPK	PLRSSADPAL	NQEVALKLEP	NPESLELSFT	MPQIQDQTPS
PSDGSTRQSS	PEPNSPSEYC	FYVDSDMVNE	FKLELVEKLF	AEDTEAKNPF
STQDTDLDLE	MLAPYIPMDD	DFQLRSFDQL	SPLESSSASP	ESASPQSTVT
VFQQTQIQEP	TANATTTTAT	TDELKTVTKD	RMEDIKILIA	SPSPTHIHKE
TTSATSSPYR	DTQSRTASPN	RAGKGVIEQT	EKSHPRSPNV	LSVALSQRTT
VPEEELNPKI	LALQNAQRKR	KMEHDGSLFQ	AVGIGTLLQQ	PDDHAATTSL
SWKRVKGCKS	SEQNGMEQKT	IILIPSDLAC	RLLGQSMDES	GLPQLTSYDC
EVNAPIQGSR	NLLQGEELLR	ALDQVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Є основним фактором, індукованим гіпоксією.

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wang G.L., Jiang B.-H., Rue E.A., Semenza G.L. (1995). Hypoxia-inducible factor 1 is a basic-helix-loop-helix-PAS heterodimer regulated by cellular O2 tension. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 5510—5514. PMID 7539918 DOI:10.1073/pnas.92.12.5510
Iyer N.V., Leung S.W., Semenza G.L. (1998). The human hypoxia-inducible factor 1alpha gene: HIF1A structure and evolutionary conservation. Genomics. 52: 159—165. PMID 9782081 DOI:10.1006/geno.1998.5416
Lukashev D., Sitkovsky M. (2008). Preferential expression of the novel alternative isoform I.3 of hypoxia-inducible factor 1alpha in activated human T lymphocytes. Hum. Immunol. 69: 421—425. PMID 18638657 DOI:10.1016/j.humimm.2008.05.004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jiang B.H., Zheng J.Z., Leung S.W., Roe R., Semenza G.L. (1997). Transactivation and inhibitory domains of hypoxia-inducible factor 1alpha. Modulation of transcriptional activity by oxygen tension. J. Biol. Chem. 272: 19253—19260. PMID 9235919 DOI:10.1074/jbc.272.31.19253
Huang L.E., Gu J., Schau M., Bunn H.F. (1998). Regulation of hypoxia-inducible factor 1alpha is mediated by an O2-dependent degradation domain via the ubiquitin-proteasome pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 7987—7992. PMID 9653127 DOI:10.1073/pnas.95.14.7987

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4910 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q16665 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма