RELA

RELA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4KV4, 1NFI, 2LSP, 2O61, 3GUT, 3QXY, 3RC0, 4KV1, 2N22

Ідентифікатори
Символи RELA, NFKB3, p65, RELA proto-oncogene, NF-kB subunit, CMCU
Зовнішні ІД OMIM: 164014 MGI: 103290 HomoloGene: 32064 GeneCards: RELA
Онтологія гена
Молекулярна функція

protein N-terminus binding
ankyrin repeat binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
histone deacetylase binding
enzyme binding
phosphate ion binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
protein homodimerization activity
chromatin binding
NF-kappaB binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein kinase binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
actinin binding
protein heterodimerization activity
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
chromatin DNA binding
ubiquitin protein ligase binding
GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
identical protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0032403 protein-containing complex binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
I-kappaB/NF-kappaB complex
transcription regulator complex
NF-kappaB complex
нуклеоплазма
клітинне ядро
ядерце
NF-kappaB p50/p65 complex
GO:0009327 protein-containing complex
синапс
glutamatergic synapse

Біологічний процес

response to amino acid
response to interleukin-1
cellular response to interleukin-6
response to progesterone
response to organic substance
Fc-epsilon receptor signaling pathway
GO:1903105 negative regulation of insulin receptor signaling pathway
defense response to virus
positive regulation of chondrocyte differentiation
animal organ morphogenesis
response to muscle stretch
response to cytokine
GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process
cytokine-mediated signaling pathway
negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway
response to mechanical stimulus
response to muramyl dipeptide
stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway
transcription, DNA-templated
response to insulin
negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling
nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway
membrane protein intracellular domain proteolysis
inflammatory response
GO:0022415 viral process
response to cobalamin
hair follicle development
positive regulation of miRNA metabolic process
acetaldehyde metabolic process
cellular response to hepatocyte growth factor stimulus
cellular response to nicotine
negative regulation of apoptotic process
cellular defense response
response to morphine
response to lipopolysaccharide
cellular response to interleukin-1
response to inorganic substance
regulation of inflammatory response
response to cAMP
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
response to hydrogen peroxide
positive regulation of Schwann cell differentiation
defense response
response to bacterium
GO:1904578 response to organic cyclic compound
GO:0010260 старіння людини
positive regulation of cell population proliferation
positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
liver development
response to UV-B
T cell receptor signaling pathway
cellular response to lipopolysaccharide
positive regulation of type I interferon production
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to hydrogen peroxide
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of T cell receptor signaling pathway
positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity
cellular response to peptidoglycan
cellular response to tumor necrosis factor
regulation of NIK/NF-kappaB signaling
positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling
GO:0007329 positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in cellular response to chemical stimulus
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
regulation of DNA-templated transcription in response to stress
cellular response to lipoteichoic acid
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of protein sumoylation
pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
cellular response to angiotensin
interleukin-1-mediated signaling pathway
cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
postsynapse to nucleus signaling pathway
GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
NIK/NF-kappaB signaling
positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5970
19697
Ensembl
ENSG00000173039
ENSMUSG00000024927
UniProt
Q04206
Q04207
RefSeq (мРНК)
NM_001145138
NM_001243984
NM_001243985
NM_021975
NM_009045
NM_001365067
RefSeq (білок)
NP_001138610
NP_001230913
NP_001230914
NP_068810
NP_033071
NP_001351996
Локус (UCSC) Хр. 11: 65.65 – 65.66 Mb Хр. 19: 5.69 – 5.7 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RELA (англ. RELA proto-oncogene, NF-kB subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 551 амінокислот, а молекулярна маса — 60 219[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDELFPLIFPAEPAQASGPYVEIIEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGER
STDTTKTHPTIKINGYTGPGTVRISLVTKDPPHRPHPHELVGKDCRDGFY
EAELCPDRCIHSFQNLGIQCVKKRDLEQAISQRIQTNNNPFQVPIEEQRG
DYDLNAVRLCFQVTVRDPSGRPLRLPPVLSHPIFDNRAPNTAELKICRVN
RNSGSCLGGDEIFLLCDKVQKEDIEVYFTGPGWEARGSFSQADVHRQVAI
VFRTPPYADPSLQAPVRVSMQLRRPSDRELSEPMEFQYLPDTDDRHRIEE
KRKRTYETFKSIMKKSPFSGPTDPRPPPRRIAVPSRSSASVPKPAPQPYP
FTSSLSTINYDEFPTMVFPSGQISQASALAPAPPQVLPQAPAPAPAPAMV
SALAQAPAPVPVLAPGPPQAVAPPAPKPTQAGEGTLSEALLQLQFDDEDL
GALLGNSTDPAVFTDLASVDNSEFQQLLNQGIPVAPHTTEPMLMEYPEAI
TRLVTGAQRPPDPAPAPLGAPGLPNGLLSGDEDFSSIADMDFSALLSQIS
S

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Deloukas P., van Loon A.P.G.M. (1993). Genomic organization of the gene encoding the p65 subunit of NF-kappa B: multiple variants of the p65 protein may be generated by alternative splicing. Hum. Mol. Genet. 2: 1895—1900. PMID 8281153 DOI:10.1093/hmg/2.11.1895
  • Lyle R., Valleley E.M., Sharpe P.T., Hewitt J.E. (1994). An alternatively spliced transcript, p65 delta 2, of the gene encoding the p65 subunit of the transcription factor NF-kappa B. Gene. 138: 265—266. PMID 7907305 DOI:10.1016/0378-1119(94)90823-0
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ruben S.M., Narayanan R., Klement J.F., Chen C.-H., Rosen C.A. (1992). Functional characterization of the NF-kappa B p65 transcriptional activator and an alternatively spliced derivative. Mol. Cell. Biol. 12: 444—454. PMID 1732726 DOI:10.1128/MCB.12.2.444
  • Ganchi P.A., Sun S.C., Greene W.C., Ballard D.W. (1992). I kappa B/MAD-3 masks the nuclear localization signal of NF-kappa B p65 and requires the transactivation domain to inhibit NF-kappa B p65 DNA binding. Mol. Biol. Cell. 3: 1339—1352. PMID 1493333 DOI:10.1091/mbc.3.12.1339
  • Li Z., Nabel G.J. (1997). A new member of the IkappaB protein family, IkappaB epsilon, inhibits RelA (p65)-mediated NF-kappaB transcription. Mol. Cell. Biol. 17: 6184—6190. PMID 9315679 DOI:10.1128/MCB.17.10.6184

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9955 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q04206 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші