PAX8

PAX8
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2K27

Ідентифікатори
Символи PAX8, paired box 8, PAX-8
Зовнішні ІД OMIM: 167415 MGI: 97492 HomoloGene: 2589 GeneCards: PAX8
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
thyroid-stimulating hormone receptor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

regulation of apoptotic process
pronephros development
regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation
диференціація клітин
mesonephric tubule development
positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
kidney epithelium development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of metanephric DCT cell differentiation
negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephric nephron morphogenesis
negative regulation of apoptotic process involved in metanephric collecting duct development
розвиток нирки
pronephric field specification
positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis
anatomical structure morphogenesis
metanephric epithelium development
mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis
transcription by RNA polymerase II
regulation of thyroid-stimulating hormone secretion
transcription, DNA-templated
otic vesicle development
metanephric distal convoluted tubule development
negative regulation of mesenchymal cell apoptotic process involved in metanephros development
mesonephros development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
metanephric nephron tubule formation
multicellular organism development
central nervous system development
metanephric comma-shaped body morphogenesis
branching involved in ureteric bud morphogenesis
thyroid gland development
positive regulation of thyroid hormone generation
negative regulation of apoptotic process involved in metanephric nephron tubule development
S-shaped body morphogenesis
inner ear morphogenesis
urogenital system development
sulfur compound metabolic process
metanephric S-shaped body morphogenesis
metanephros development
cellular response to gonadotropin stimulus
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
thyroid-stimulating hormone signaling pathway
negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
ventricular septum development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7849
18510
Ensembl
ENSG00000125618
ENSMUSG00000026976
UniProt
Q06710
Q00288
RefSeq (мРНК)
NM_003466
NM_013951
NM_013952
NM_013953
NM_013992
NM_011040
RefSeq (білок)
NP_003457
NP_039246
NP_039247
NP_054698
NP_035170
Локус (UCSC) Хр. 2: 113.22 – 113.28 Mb Хр. 2: 24.31 – 24.37 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

PAX8 (англ. Paired box 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 48 218[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPHNSIRSGHGGLNQLGGAFVNGRPLPEVVRQRIVDLAHQGVRPCDISRQ
LRVSHGCVSKILGRYYETGSIRPGVIGGSKPKVATPKVVEKIGDYKRQNP
TMFAWEIRDRLLAEGVCDNDTVPSVSSINRIIRTKVQQPFNLPMDSCVAT
KSLSPGHTLIPSSAVTPPESPQSDSLGSTYSINGLLGIAQPGSDKRKMDD
SDQDSCRLSIDSQSSSSGPRKHLRTDAFSQHHLEPLECPFERQHYPEAYA
SPSHTKGEQGLYPLPLLNSTLDDGKATLTPSNTPLGRNLSTHQTYPVVAD
PHSPFAIKQETPEVSSSSSTPSSLSSSAFLDLQQVGSGVPPFNAFPHAAS
VYGQFTGQALLSGREMVGPTLPGYPPHIPTSGQGSYASSAIAGMVAGSEY
SGNAYGHTPYSSYSEAWRFPNSSLLSSPYYYSSTSRPSAPPTTATAFDHL

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kozmik Z., Kurzbauer R., Doerfler P., Busslinger M. (1993). Alternative splicing of Pax-8 gene transcripts is developmentally regulated and generates isoforms with different transactivation properties. Mol. Cell. Biol. 13: 6024—6035. PMID 8413205 DOI:10.1128/MCB.13.10.6024
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8622 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q06710 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші