NR2E1

NR2E1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4XAJ

Ідентифікатори
Символи NR2E1, TLL, TLX, XTLL, nuclear receptor subfamily 2 group E member 1
Зовнішні ІД OMIM: 603849 MGI: 1100526 HomoloGene: 37750 GeneCards: NR2E1
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
zinc ion binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
histone deacetylase binding
зв'язування з іоном металу
steroid hormone receptor activity
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
enzyme binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001948, GO:0016582 protein binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

glial cell migration
cell fate commitment
negative regulation of astrocyte differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of neuron differentiation
somatic stem cell population maintenance
dentate gyrus development
negative regulation of neural precursor cell proliferation
regulation of cellular component organization
extracellular matrix organization
negative regulation of apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
behavioral fear response
regulation of timing of neuron differentiation
transcription, DNA-templated
нейробіологія розвитку
positive regulation of angiogenesis
anterior commissure morphogenesis
regulation of dendrite morphogenesis
positive regulation of neural precursor cell proliferation
multicellular organism development
brain development
positive regulation of cell cycle
amygdala development
retina development in camera-type eye
forebrain generation of neurons
layer formation in cerebral cortex
positive regulation of cell population proliferation
cerebral cortex development
соціальна поведінка
cerebral cortex neuron differentiation
regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
camera-type eye development
olfactory bulb development
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
positive regulation of stem cell proliferation
aggressive behavior
зір
steroid hormone mediated signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
довготривала потенціація

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7101
21907
Ensembl
ENSG00000112333
ENSMUSG00000019803
UniProt
Q9Y466
Q64104
RefSeq (мРНК)
NM_001286102
NM_003269
NM_152229
RefSeq (білок)
NP_001273031
NP_003260
NP_689415
Локус (UCSC) Хр. 6: 108.17 – 108.19 Mb Хр. 10: 42.44 – 42.46 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NR2E1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 385 амінокислот, а молекулярна маса — 42 589[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSKPAGSTSRILDIPCKVCGDRSSGKHYGVYACDGCSGFFKRSIRRNRTY
VCKSGNQGGCPVDKTHRNQCRACRLKKCLEVNMNKDAVQHERGPRTSTIR
KQVALYFRGHKEENGAAAHFPSAALPAPAFFTAVTQLEPHGLELAAVSTT
PERQTLVSLAQPTPKYPHEVNGTPMYLYEVATESVCESAARLLFMSIKWA
KSVPAFSTLSLQDQLMLLEDAWRELFVLGIAQWAIPVDANTLLAVSGMNG
DNTDSQKLNKIISEIQALQEVVARFRQLRLDATEFACLKCIVTFKAVPTH
SGSELRSFRNAAAIAALQDEAQLTLNSYIHTRYPTQPCRFGKLLLLLPAL
RSISPSTIEEVFFKKTIGNVPITRLLSDMYKSSDI

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Jackson A., Panayiotidis P., Foroni L. (1998). The human homologue of the Drosophila tailless gene (TLX): characterization and mapping to a region of common deletion in human lymphoid leukemia on chromosome 6q21. Genomics. 50: 34—43. PMID 9628820 DOI:10.1006/geno.1998.5270
  • Kobayashi M., Yu R.T., Yasuda K., Umesono K. (2000). Cell-type-specific regulation of the retinoic acid receptor mediated by the orphan nuclear receptor TLX. Mol. Cell. Biol. 20: 8731—8739. PMID 11073974 DOI:10.1128/MCB.20.23.8731-8739.2000
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7973 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9Y466 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші