KLF2

KLF2
Ідентифікатори
Символи KLF2, LKLF, Kruppel-like factor 2, Kruppel like factor 2
Зовнішні ІД OMIM: 602016 MGI: 1342772 HomoloGene: 133978 GeneCards: KLF2
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
nucleic acid binding
DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

cellular response to peptide
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
Епігенетичне успадкування
multicellular organism growth
cellular response to laminar fluid shear stress
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress
positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
negative regulation of interleukin-6 production
cellular response to tumor necrosis factor
GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound
response to laminar fluid shear stress
in utero embryonic development
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
erythrocyte homeostasis
type I pneumocyte differentiation
cellular response to interleukin-1
GO:0000767 cell morphogenesis
cellular response to cycloheximide
cellular response to hydrogen peroxide
erythrocyte maturation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular response to fluid shear stress
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
cellular stress response to acid chemical
negative regulation of sprouting angiogenesis
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10365
16598
Ensembl
ENSG00000127528
ENSMUSG00000055148
UniProt
Q9Y5W3
Q60843
RefSeq (мРНК)
NM_016270
NM_006075
NM_016198
NM_008452
RefSeq (білок)
NP_057354
NP_032478
Локус (UCSC) Хр. 19: 16.32 – 16.33 Mb Хр. 8: 73.07 – 73.08 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KLF2 (англ. Kruppel like factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 355 амінокислот, а молекулярна маса — 37 420[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MALSEPILPSFSTFASPCRERGLQERWPRAEPESGGTDDDLNSVLDFILS
MGLDGLGAEAAPEPPPPPPPPAFYYPEPGAPPPYSAPAGGLVSELLRPEL
DAPLGPALHGRFLLAPPGRLVKAEPPEADGGGGYGCAPGLTRGPRGLKRE
GAPGPAASCMRGPGGRPPPPPDTPPLSPDGPARLPAPGPRASFPPPFGGP
GFGAPGPGLHYAPPAPPAFGLFDDAAAAAAALGLAPPAARGLLTPPASPL
ELLEAKPKRGRRSWPRKRTATHTCSYAGCGKTYTKSSHLKAHLRTHTGEK
PYHCNWDGCGWKFARSDELTRHYRKHTGHRPFQCHLCDRAFSRSDHLALH
MKRHM

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Kozyrev S.V., Hansen L.L., Poltaraus A.B., Domninsky D.A., Kisselev L.L. (1999). Structure of the human CpG-island-containing lung Kruppel-like factor (LKLF) gene and its location in chromosome 19p13.11-13 locus. FEBS Lett. 448: 149—152. PMID 10217429 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00348-8
  • Wani M.A., Conkright M.D., Jeffries S., Hughes M.J., Lingrel J.B. (1999). cDNA isolation, genomic structure, regulation, and chromosomal localization of human lung kruppel-like factor. Genomics. 60: 78—86. PMID 10458913 DOI:10.1006/geno.1999.5888
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Conkright M.D., Wani M.A., Lingrel J.B. (2001). Lung Krueppel-like factor contains an autoinhibitory domain that regulates its transcriptional activation by binding WWP1, an E3 ubiquitin ligase. J. Biol. Chem. 276: 29299—29306. PMID 11375995 DOI:10.1074/jbc.M103670200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6347 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9Y5W3 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші