ERG

ERG
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1SXE, 4IRG, 4IRH, 4IRI

Ідентифікатори
Символи ERG, erg-3, p55, ETS-related gene, v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene homolog, ETS transcription factor, ETS transcription factor ERG
Зовнішні ІД OMIM: 165080 MGI: 95415 HomoloGene: 15848 GeneCards: ERG
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
chromatin binding
signal transducer activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
Рибонуклеопротеїни

Біологічний процес

диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
endocardial cushion development
endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation
transcription, DNA-templated
multicellular organism development
positive regulation of blood vessel remodeling
protein phosphorylation
проліферація
cell migration
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2078
13876
Ensembl
ENSG00000157554
ENSMUSG00000040732
UniProt
P11308
P81270
RefSeq (мРНК)
NM_001136154
NM_001136155
NM_001243428
NM_001243429
NM_001243432
NM_001243433
NM_001291391
NM_004449
NM_182918
NM_001331025
NM_133659
NM_001302152
NM_001302153
NM_001302154
NM_001302179
NM_001302183
RefSeq (білок)
NP_001129626
NP_001129627
NP_001230357
NP_001230358
NP_001230361
NP_001278320
NP_001317954
NP_004440
NP_891548
NP_001289081
NP_001289082
NP_001289083
NP_001289108
NP_001289112
NP_598420
Локус (UCSC) Хр. 21: 38.38 – 38.66 Mb Хр. 16: 95.16 – 95.39 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ERG (англ. ERG, ETS transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 486 амінокислот, а молекулярна маса — 54 608[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MIQTVPDPAAHIKEALSVVSEDQSLFECAYGTPHLAKTEMTASSSSDYGQ
TSKMSPRVPQQDWLSQPPARVTIKMECNPSQVNGSRNSPDECSVAKGGKM
VGSPDTVGMNYGSYMEEKHMPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWL
EWAVKEYGLPDVNILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLH
YLRETPLPHLTSDDVDKALQNSPRLMHARNTGGAAFIFPNTSVYPEATQR
ITTRPDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPY
QILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSSCITWEGTNGEFKMTD
PDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFH
GIAQALQPHPPESSLYKYPSDLPYMGSYHAHPQKMNFVAPHPPALPVTSS
SFFAAPNPYWNSPTGGIYPNTRLPTSHMPSHLGTYY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Rao V.N., Papas T.S., Shyam E., Reddy P. (1987). erg, a human ets-related gene on chromosome 21: alternative splicing, polyadenylation, and translation. Science. 237: 635—639. PMID 3299708 DOI:10.1126/science.3299708
  • Reddy E.S.P., Rao V.N., Papas T.S. (1987). The erg gene: a human gene related to the ets oncogene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 6131—6135. PMID 3476934 DOI:10.1073/pnas.84.17.6131
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Dunn T., Praissman L., Hagag N., Viola M.V. (1994). ERG gene is translocated in an Ewing's sarcoma cell line. Cancer Genet. Cytogenet. 76: 19—22. PMID 8076344 DOI:10.1016/0165-4608(94)90063-9
  • Prasad D.D., Rao V.N., Lee L., Reddy E.S. (1994). Differentially spliced erg-3 product functions as a transcriptional activator. Oncogene. 9: 669—673. PMID 8290279
  • Ichikawa H., Shimizu K., Hayashi Y., Ohki M. (1994). An RNA-binding protein gene, TLS/FUS, is fused to ERG in human myeloid leukemia with t(16;21) chromosomal translocation. Cancer Res. 54: 2865—2868. PMID 8187069

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3446 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, P11308 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 21
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші