SOX10

SOX10
Ідентифікатори
Символи SOX10, DOM, PCWH, WS2E, WS4, WS4C, SRY-box 10, SRY-box transcription factor 10, SOX-10
Зовнішні ІД OMIM: 602229 MGI: 98358 HomoloGene: 5055 GeneCards: SOX10
Пов'язані генетичні захворювання
Waardenburg syndrome type 2E, Waardenburg syndrome type 4C, PCWH syndrome, Waardenburg-Shah syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001105 transcription coactivator activity
transcription factor binding
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
identical protein binding
promoter-specific chromatin binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding

Клітинна компонента

цитоплазма
нуклеоплазма
клітинне ядро
Хроматин
мітохондрія
мітохондріальна зовнішня мембрана
мембрана
extrinsic component of mitochondrial outer membrane

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
anatomical structure morphogenesis
transcription, DNA-templated
stem cell differentiation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
transcription elongation from RNA polymerase II promoter
negative regulation of Schwann cell proliferation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
positive regulation of myelination
cellular response to progesterone stimulus
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
oligodendrocyte development
central nervous system myelination
oligodendrocyte differentiation
in utero embryonic development
neural crest cell migration
morphogenesis of an epithelium
positive regulation of neuroblast proliferation
central nervous system development
peripheral nervous system development
positive regulation of gliogenesis
диференціація клітин
melanocyte differentiation
lacrimal gland development
negative regulation of apoptotic process
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
cell maturation
enteric nervous system development
digestive tract morphogenesis
developmental growth
morphogenesis of a branching epithelium
negative regulation of canonical Wnt signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6663
20665
Ensembl
ENSG00000100146
ENSMUSG00000033006
UniProt
P56693
Q04888
RefSeq (мРНК)
NM_006941
NM_011437
RefSeq (білок)
NP_008872
NP_035567
Локус (UCSC) Хр. 22: 37.97 – 37.99 Mb Хр. 15: 79.04 – 79.05 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SOX10 (англ. SRY-box 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 49 911[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAEEQDLSEVELSPVGSEEPRCLSPGSAPSLGPDGGGGGSGLRASPGPGE
LGKVKKEQQDGEADDDKFPVCIREAVSQVLSGYDWTLVPMPVRVNGASKS
KPHVKRPMNAFMVWAQAARRKLADQYPHLHNAELSKTLGKLWRLLNESDK
RPFIEEAERLRMQHKKDHPDYKYQPRRRKNGKAAQGEAECPGGEAEQGGT
AAIQAHYKSAHLDHRHPGEGSPMSDGNPEHPSGQSHGPPTPPTTPKTELQ
SGKADPKRDGRSMGEGGKPHIDFGNVDIGEISHEVMSNMETFDVAELDQY
LPPNGHPGHVSSYSAAGYGLGSALAVASGHSAWISKPPGVALPTVSPPGV
DAKAQVKTETAGPQGPPHYTDQPSTSQIAYTSLSLPHYGSAFPSISRPQF
DYSDHQPSGPYYGHSGQASGLYSAFSYMGPSQRPLYTAISDPSPSGPQSH
SPTHWEQPVYTTLSRP

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з SOX10 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11190 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, P56693 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 22
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші