HOXA3

HOXA3
Ідентифікатори
Символи HOXA3, HOX1, HOX1E, homeobox A3
Зовнішні ІД OMIM: 142954 MGI: 96175 HomoloGene: 40725 GeneCards: HOXA3
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
HMG box domain binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

embryonic skeletal system morphogenesis
glossopharyngeal nerve morphogenesis
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
thymus development
transcription, DNA-templated
embryonic skeletal system development
multicellular organism development
animal organ formation
blood vessel remodeling
thyroid gland development
cartilage development
parathyroid gland development
Ангіогенез
positive regulation of cell population proliferation
animal organ morphogenesis
specification of animal organ position
anterior/posterior pattern specification
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
calcium ion transport
експресія генів
magnesium ion homeostasis
bone mineralization
negative regulation of calcium ion transport
phosphate ion homeostasis
calcium ion homeostasis
positive regulation of receptor binding
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3200
15400
Ensembl
ENSG00000105997
ENSMUSG00000079560
UniProt
O43365
P02831
RefSeq (мРНК)
NM_030661
NM_153631
NM_153632
NM_010452
RefSeq (білок)
NP_109377
NP_705895
NP_034582
Локус (UCSC) Хр. 7: 27.11 – 27.15 Mb Хр. 6: 52.15 – 52.19 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HOXA3 (англ. Homeobox A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 46 369[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MQKATYYDSSAIYGGYPYQAANGFAYNANQQPYPASAALGADGEYHRPAC
SLQSPSSAGGHPKAHELSEACLRTLSAPPSQPPSLGEPPLHPPPPQAAPP
APQPPQPAPQPPAPTPAAPPPPSSASPPQNASNNPTPANAAKSPLLNSPT
VAKQIFPWMKESRQNTKQKTSSSSSGESCAGDKSPPGQASSKRARTAYTS
AQLVELEKEFHFNRYLCRPRRVEMANLLNLTERQIKIWFQNRRMKYKKDQ
KGKGMLTSSGGQSPSRSPVPPGAGGYLNSMHSLVNSVPYEPQSPPPFSKP
PQGTYGLPPASYPASLPSCAPPPPPQKRYTAAGAGAGGTPDYDPHAHGLQ
GNGSYGTPHIQGSPVFVGGSYVEPMSNSGPALFGLTHLPHAASGAMDYGG
AGPLGSGHHHGPGPGEPHPTYTDLTGHHPSQGRIQEAPKLTHL

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5104 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, O43365 (англ.) . Архів оригіналу за 7 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші