RORA

RORA
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1N83, 1S0X, 4S15

Ідентифікатори
Символи RORA, NR1F1, ROR1, ROR2, ROR3, RZR-ALPHA, RZRA, RAR related orphan receptor A, IDDECA
Зовнішні ІД OMIM: 600825 MGI: 104661 HomoloGene: 56594 GeneCards: RORA
Пов'язані генетичні захворювання
шизофренія, бронхіальна астма, депресія клінічна[1]
Реагує на сполуку
холестерол[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
beta-catenin binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
ligand-activated transcription factor activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
zinc ion binding
transcription factor binding
зв'язування з іоном металу
steroid hormone receptor activity
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
transcription coactivator binding
transcription corepressor binding
oxysterol binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро

Біологічний процес

negative regulation of fat cell differentiation
nitric oxide biosynthetic process
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cGMP metabolic process
ритмічний процес
cellular response to sterol
cellular response to tumor necrosis factor
cerebellar Purkinje cell differentiation
negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
circadian regulation of gene expression
transcription, DNA-templated
cerebellar granule cell precursor proliferation
regulation of steroid metabolic process
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of smoothened signaling pathway
muscle cell differentiation
intracellular receptor signaling pathway
regulation of glucose metabolic process
regulation of circadian rhythm
Ангіогенез
cellular response to interleukin-1
xenobiotic metabolic process
positive regulation of circadian rhythm
positive regulation of vascular endothelial growth factor production
T-helper 17 cell differentiation
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
negative regulation of inflammatory response
cellular response to hypoxia
triglyceride homeostasis
regulation of macrophage activation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
steroid hormone mediated signaling pathway
циркадний ритм
cytokine-mediated signaling pathway
cholesterol homeostasis
multicellular organism development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6095
19883
Ensembl
ENSG00000069667
ENSMUSG00000032238
UniProt
P35398
P51448
RefSeq (мРНК)
NM_002943
NM_134260
NM_134261
NM_134262
NM_013646
NM_001289916
NM_001289917
RefSeq (білок)
NP_002934
NP_599022
NP_599023
NP_599024
NP_001276845
NP_001276846
NP_038674
Локус (UCSC) Хр. 15: 60.49 – 61.23 Mb Хр. 9: 68.56 – 69.3 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RORA (англ. RAR related orphan receptor A) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 523 амінокислот, а молекулярна маса — 58 975[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MESAPAAPDPAASEPGSSGADAAAGSRETPLNQESARKSEPPAPVRRQSY
SSTSRGISVTKKTHTSQIEIIPCKICGDKSSGIHYGVITCEGCKGFFRRS
QQSNATYSCPRQKNCLIDRTSRNRCQHCRLQKCLAVGMSRDAVKFGRMSK
KQRDSLYAEVQKHRMQQQQRDHQQQPGEAEPLTPTYNISANGLTELHDDL
SNYIDGHTPEGSKADSAVSSFYLDIQPSPDQSGLDINGIKPEPICDYTPA
SGFFPYCSFTNGETSPTVSMAELEHLAQNISKSHLETCQYLREELQQITW
QTFLQEEIENYQNKQREVMWQLCAIKITEAIQYVVEFAKRIDGFMELCQN
DQIVLLKAGSLEVVFIRMCRAFDSQNNTVYFDGKYASPDVFKSLGCEDFI
SFVFEFGKSLCSMHLTEDEIALFSAFVLMSADRSWLQEKVKIEKLQQKIQ
LALQHVLQKNHREDGILTKLICKVSTLRALCGRHTEKLMAFKAIYPDIVR
LHFPPLYKELFTSEFEPAMQIDG

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має вузол для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Валері Ху відкрила, що ген RORA, який може перебувати під позитивною регуляцією андрогенів, призводить до накопичення додаткового тестостерону, який може спричиняти більшу частоту проявів аутизму у чоловіків.[7][8][9][10]


Література

  • Becker-Andre M., Andre E., Delamarter J.F. (1993). Identification of nuclear receptor mRNAs by RT-PCR amplification of conserved zinc-finger motif sequences. Biochem. Biophys. Res. Commun. 194: 1371—1379. PMID 7916608 DOI:10.1006/bbrc.1993.1976
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development. Mol. Endocrinol. 11: 1737—1746. PMID 9328355 DOI:10.1210/mend.11.11.0002
  • Lau P., Bailey P., Dowhan D.H., Muscat G.E. (1999). Exogenous expression of a dominant negative RORalpha1 vector in muscle cells impairs differentiation: RORalpha1 directly interacts with p300 and myoD. Nucleic Acids Res. 27: 411—420. PMID 9862959 DOI:10.1093/nar/27.2.411
  • Sundvold H., Lien S. (2001). Identification of a novel peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) gamma promoter in man and transactivation by the nuclear receptor RORalpha1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287: 383—390. PMID 11554739 DOI:10.1006/bbrc.2001.5602
  • Moraitis A.N., Giguere V. (2003). The co-repressor hairless protects RORalpha orphan nuclear receptor from proteasome-mediated degradation. J. Biol. Chem. 278: 52511—52518. PMID 14570920 DOI:10.1074/jbc.M308152200

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з RORA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з RAR related orphan receptor A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10258 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  6. UniProt, P35398 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
  7. Anderson, Lisa (2013). Researcher Discovers New Regulatory Autism Gene. Neuroscience Research. BTNRC. Архів оригіналу за 4 березня 2016. Процитовано 30 жовтня 2013.
  8. Jabr, Ferris (17 лютого 2011). Faulty testosterone cycle may explain male autism bias. New Scientist. Архів оригіналу за 23 квітня 2015. Процитовано 2 листопада 2013.
  9. Weaver, Janelle (19 липня 2011). Why Autism Strikes More Boys Than Girls. Scientific American. Архів оригіналу за 10 листопада 2013. Процитовано 6 листопада 2013.
  10. Rowan, Karen (18 лютого 2011). Testosterone may bump autism rates in males. NBC News. Архів оригіналу за 2 грудня 2016. Процитовано 5 лютого 2014.

Див. також

  • Хромосома 15
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші