KLF11

KLF11
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1PO4

Ідентифікатори
Символи KLF11, FKLF, FKLF1, MODY7, TIEG2, Tieg3, Kruppel-like factor 11, Kruppel like factor 11
Зовнішні ІД OMIM: 603301 MGI: 2653368 HomoloGene: 2668 GeneCards: KLF11
Пов'язані генетичні захворювання
maturity-onset diabetes of the young type 7[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
гіалоплазма
focal adhesion
ядерні тільця

Біологічний процес

positive regulation of apoptotic process
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle
transcription, DNA-templated
negative regulation of cell population proliferation
GO:0097285 апоптоз
cellular response to peptide
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8462
194655
Ensembl
ENSG00000172059
ENSMUSG00000020653
UniProt
O14901
Q8K1S5
RefSeq (мРНК)
NM_001177716
NM_001177718
NM_003597
NM_178357
RefSeq (білок)
NP_001171187
NP_001171189
NP_003588
NP_848134
Локус (UCSC) Хр. 2: 10.04 – 10.05 Mb Хр. 12: 24.7 – 24.71 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KLF11 (англ. Kruppel like factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 512 амінокислот, а молекулярна маса — 55 139[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MHTPDFAGPDDARAVDIMDICESILERKRHDSERSTCSILEQTDMEAVEA
LVCMSSWGQRSQKGDLLRIRPLTPVSDSGDVTTTVHMDAATPELPKDFHS
LSTLCITPPQSPDLVEPSTRTPVSPQVTDSKACTATDVLQSSAVVARALS
GGAERGLLGLEPVPSSPCRAKGTSVIRHTGESPAACFPTIQTPDCRLSDS
REGEEQLLGHFETLQDTHLTDSLLSTNLVSCQPCLHKSGGLLLTDKGQQA
GWPGAVQTCSPKNYENDLPRKTTPLISVSVPAPPVLCQMIPVTGQSSMLP
AFLKPPPQLSVGTVRPILAQAAPAPQPVFVGPAVPQGAVMLVLPQGALPP
PAPCAANVMAAGNTKLLPLAPAPVFITSSQNCVPQVDFSRRRNYVCSFPG
CRKTYFKSSHLKAHLRTHTGEKPFNCSWDGCDKKFARSDELSRHRRTHTG
EKKFVCPVCDRRFMRSDHLTKHARRHMTTKKIPGWQAEVGKLNRIASAES
PGSPLVSMPASA

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Cook T., Gebelein B., Mesa K., Mladek A., Urrutia R. (1998). Molecular cloning and characterization of TIEG2 reveals a new subfamily of transforming growth factor-beta-inducible Sp1-like zinc finger-encoding genes involved in the regulation of cell growth. J. Biol. Chem. 273: 25929—25936. PMID 9748269 DOI:10.1074/jbc.273.40.25929
  • Asano H., Li X.S., Stamatoyannopoulos G. (1999). FKLF, a novel Kruppel-like factor that activates human embryonic and fetal beta-like globin genes. Mol. Cell. Biol. 19: 3571—3579. PMID 10207080 DOI:10.1128/MCB.19.5.3571
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з KLF11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11811 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, O14901 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші