ZNF35

ZNF35
Ідентифікатори
Символи ZNF35, HF.10, HF10, Zfp105, zinc finger protein 35
Зовнішні ІД OMIM: 194533 MGI: 1277119 HomoloGene: 2568 GeneCards: ZNF35
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

perinuclear region of cytoplasm
клітинне ядро

Біологічний процес

cellular response to retinoic acid
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
Сперматогенез
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7584
22646
Ensembl
ENSG00000281306
ENSG00000169981
ENSMUSG00000057895
UniProt
P13682
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_003420
NM_009544
RefSeq (білок)
NP_003411
н/д
Локус (UCSC) Хр. 3: 44.65 – 44.66 Mb Хр. 9: 122.75 – 122.76 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZNF35 (англ. Zinc finger protein 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 527 амінокислот, а молекулярна маса — 59 089[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTAELREAMALAPWGPVKVKKEEEEEENFPGQASSQQVHSENIKVWAPVQ
GLQTGLDGSEEEEKGQNISWDMAVVLKATQEAPAASTLGSYSLPGTLAKS
EILETHGTMNFLGAETKNLQLLVPKTEICEEAEKPLIISERIQKADPQGP
ELGEACEKGNMLKRQRIKREKKDFRQVIVNDCHLPESFKEEENQKCKKSG
GKYSLNSGAVKNPKTQLGQKPFTCSVCGKGFSQSANLVVHQRIHTGEKPF
ECHECGKAFIQSANLVVHQRIHTGQKPYVCSKCGKAFTQSSNLTVHQKIH
SLEKTFKCNECEKAFSYSSQLARHQKVHITEKCYECNECGKTFTRSSNLI
VHQRIHTGEKPFACNDCGKAFTQSANLIVHQRSHTGEKPYECKECGKAFS
CFSHLIVHQRIHTAEKPYDCSECGKAFSQLSCLIVHQRIHSGDLPYVCNE
CGKAFTCSSYLLIHQRIHNGEKPYTCNECGKAFRQRSSLTVHQRTHTGEK
PYECEKCGAAFISNSHLMRHHRTHLVE

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13099 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, P13682 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші