KLF1

KLF1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2L2I, 2MBH, 2N23

Ідентифікатори
Символи KLF1, CDAN4, EKLF, HBFQTL6, INLU, Kruppel-like factor 1 (erythroid), Kruppel like factor 1, EKLF/KLF1
Зовнішні ІД OMIM: 600599 MGI: 1342771 HomoloGene: 4785 GeneCards: KLF1
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
nucleic acid binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма

Біологічний процес

GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
erythrocyte differentiation
cellular response to peptide
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
maternal process involved in female pregnancy
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10661
16596
Ensembl
ENSG00000105610
ENSMUSG00000054191
UniProt
Q13351
P46099
RefSeq (мРНК)
NM_006563
NM_010635
RefSeq (білок)
NP_006554
NP_034765
Локус (UCSC) Хр. 19: 12.88 – 12.89 Mb Хр. 8: 85.63 – 85.63 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

KLF1 (англ. Kruppel like factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 38 221[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATAETALPSISTLTALGPFPDTQDDFLKWWRSEEAQDMGPGPPDPTEPP
LHVKSEDQPGEEEDDERGADATWDLDLLLTNFSGPEPGGAPQTCALAPSE
ASGAQYPPPPETLGAYAGGPGLVAGLLGSEDHSGWVRPALRARAPDAFVG
PALAPAPAPEPKALALQPVYPGPGAGSSGGYFPRTGLSVPAASGAPYGLL
SGYPAMYPAPQYQGHFQLFRGLQGPAPGPATSPSFLSCLGPGTVGTGLGG
TAEDPGVIAETAPSKRGRRSWARKRQAAHTCAHPGCGKSYTKSSHLKAHL
RTHTGEKPYACTWEGCGWRFARSDELTRHYRKHTGQRPFRCQLCPRAFSR
SDHLALHMKRHL

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Bieker J.J. (1996). Isolation, genomic structure, and expression of human erythroid Kruppel-like factor (EKLF). DNA Cell Biol. 15: 347—352. PMID 8924208 DOI:10.1089/dna.1996.15.347
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhang W., Bieker J.J. (1998). Acetylation and modulation of erythroid Krueppel-like factor (EKLF) activity by interaction with histone acetyltransferases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9855—9860. PMID 9707565 DOI:10.1073/pnas.95.17.9855
  • Singleton B.K., Burton N.M., Green C., Brady R.L., Anstee D.J. (2008). Mutations in EKLF/KLF1 form the molecular basis of the rare blood group In(Lu) phenotype. Blood. 112: 2081—2088. PMID 18487511 DOI:10.1182/blood-2008-03-145672

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6345 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q13351 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші