TWIST1

TWIST1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2MJV

Ідентифікатори
Символи TWIST1, twist family bHLH transcription factor 1, ACS3, BPES2, BPES3, CRS, CRS1, SCS, TWIST, bHLHa38, CSO, SWCOS
Зовнішні ІД OMIM: 601622 MGI: 98872 HomoloGene: 402 GeneCards: TWIST1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
protein dimerization activity
protein homodimerization activity
protein domain specific binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
transcription factor binding
bHLH transcription factor binding
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма

Біологічний процес

positive regulation of transcription regulatory region DNA binding
embryonic skeletal system morphogenesis
positive regulation of fatty acid beta-oxidation
roof of mouth development
диференціація клітин
positive regulation of cell motility
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of molecular function
осифікація
ритмічний процес
positive regulation of epithelial cell proliferation
negative regulation of striated muscle tissue development
regulation of bone mineralization
aortic valve morphogenesis
negative regulation of cell differentiation
cardiac neural crest cell migration involved in outflow tract morphogenesis
cellular response to growth factor stimulus
positive regulation of monocyte chemotactic protein-1 production
muscle organ development
embryonic digit morphogenesis
negative regulation of apoptotic process
neuron migration
in utero embryonic development
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
outer ear morphogenesis
eyelid development in camera-type eye
mitral valve morphogenesis
positive regulation of DNA-templated transcription, initiation
positive regulation of epithelial to mesenchymal transition
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
transcription, DNA-templated
negative regulation of osteoblast differentiation
positive regulation of angiogenesis
hindlimb morphogenesis
negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
cranial suture morphogenesis
odontogenesis
endocardial cushion morphogenesis
negative regulation of double-strand break repair
multicellular organism development
cardiac neural crest cell development involved in outflow tract morphogenesis
neural tube closure
GO:1901313 positive regulation of gene expression
negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
negative regulation of skeletal muscle tissue development
embryonic limb morphogenesis
negative regulation of oxidative phosphorylation uncoupler activity
osteoblast differentiation
positive regulation of tumor necrosis factor production
cell proliferation involved in heart valve development
embryonic cranial skeleton morphogenesis
negative regulation of tumor necrosis factor production
negative regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway
positive regulation of endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation
negative regulation of histone acetylation
embryonic camera-type eye formation
bone development
embryonic forelimb morphogenesis
cellular response to hypoxia
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cellular senescence
embryonic hindlimb morphogenesis
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
cytokine-mediated signaling pathway

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
7291
22160
Ensembl
ENSG00000122691
ENSMUSG00000035799
UniProt
Q15672
P26687
RefSeq (мРНК)
NM_000474
NM_011658
RefSeq (білок)
NP_000465
NP_035788
Локус (UCSC) Хр. 7: 19.02 – 19.12 Mb Хр. 12: 34.01 – 34.01 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TWIST1 (англ. Twist family bHLH transcription factor 1) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 202 амінокислот, а молекулярна маса — 20 954.[5] Для нього характерний мотив спіраль-петля-спіраль.[6]

Послідовність амінокислот
1020304050
MMQDVSSSPVSPADDSLSNSEEEPDRQQPPSGKRGGRKRRSSRRSAGGGA
GPGGAAGGGVGGGDEPGSPAQGKRGKKSAGCGGGGGAGGGGGSSSGGGSP
QSYEELQTQRVMANVRERQRTQSLNEAFAALRKIIPTLPSDKLSKIQTLK
LAARYIDFLYQVLQSDELDSKMASCSYVAHERLSYAFSVWRMEGAWSMSA
SH

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція транскрипції, біологічні ритми, диференціація клітин, міогенез. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі. Найвища концентрація мРНК цього фактора спостерігається у плаценті, а у дорослих — у тканинах, що походять з мезодерми.[7] Вважається, що Twist1 регулює остеогенез.[8]

Мутації Twist1 асоційовані з синдромом Сезарі[en][9], Синдромом Саетра — Хоцена[en][10][11], раком молочної залози[12] тощо. Крім того, Twist1 відіграє важливу роль у метастазуванні, і у метастазуючих карциномах експресія Twist1 або метилювання його промотора є поширеним явищем.[13] Також, разом з N-Myc Twist1 відіграє роль онкогена при багатьох онкологічних хворобах, зокрема при нейробластомі.[12][14]

Література

  • Bourgeois P., Stoetzel C., Bolcato-Bellemin A.-L., Mattei M.-G., Perrin-Schmitt F. (1996). The human H-twist gene is located at 7p21 and encodes a B-HLH protein that is 96% similar to its murine M-twist counterpart. Mamm. Genome. 7: 915—917. PMID 8995765 DOI:10.1007/s003359900269
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Sosic D., Richardson J.A., Yu K., Ornitz D.M., Olson E.N. (2003). Twist regulates cytokine gene expression through a negative feedback loop that represses NF-kappaB activity. Cell. 112: 169—180. PMID 12553906 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00002-3
  • Seto M.L., Lee S.J., Sze R.W., Cunningham M.L. (2001). Another TWIST on Baller-Gerold syndrome. Am. J. Med. Genet. 104: 323—330. PMID 11754069 DOI:10.1002/ajmg.10065
  • Kunz J., Hudler M., Fritz B. (1999). Identification of a frameshift mutation in the gene TWIST in a family affected with Robinow-Sorauf syndrome. J. Med. Genet. 36: 650—652. PMID 10465122

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TWIST1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12428 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  5. UniProt, Q15672 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  6. Bourgeois, P.; Stoetzel, C.; Bolcato-Bellemin, A. L.; Mattei, M. G.; Perrin-Schmitt, F. (1996-12-XX). The human H-twist gene is located at 7p21 and encodes a B-HLH protein that is 96% similar to its murine M-twist counterpart. Mammalian Genome: Official Journal of the International Mammalian Genome Society. Т. 7, № 12. с. 915—917. doi:10.1007/s003359900269. ISSN 0938-8990. PMID 8995765. Процитовано 9 квітня 2021.
  7. TWIST1 twist family bHLH transcription factor 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI. www.ncbi.nlm.nih.gov. Процитовано 9 квітня 2021.
  8. Lee, M. S.; Lowe, G. N.; Strong, D. D.; Wergedal, J. E.; Glackin, C. A. (15 грудня 1999). TWIST, a basic helix-loop-helix transcription factor, can regulate the human osteogenic lineage. Journal of Cellular Biochemistry. Т. 75, № 4. с. 566—577. doi:10.1002/(sici)1097-4644(19991215)75:43.0.co;2-0. ISSN 0730-2312. PMID 10572240. Архів оригіналу за 17 серпня 2020. Процитовано 9 квітня 2021.
  9. van Doorn, Remco; Dijkman, Remco; Vermeer, Maarten H.; Out-Luiting, Jacoba J.; van der Raaij-Helmer, Elisabeth M. H.; Willemze, Rein; Tensen, Cornelis P. (15 серпня 2004). Aberrant expression of the tyrosine kinase receptor EphA4 and the transcription factor twist in Sézary syndrome identified by gene expression analysis. Cancer Research. Т. 64, № 16. с. 5578—5586. doi:10.1158/0008-5472.CAN-04-1253. ISSN 0008-5472. PMID 15313894. Архів оригіналу за 28 січня 2022. Процитовано 9 квітня 2021.(англ.)
  10. Kress, Wolfram; Schropp, Christian; Lieb, Gabriele; Petersen, Birgit; Büsse-Ratzka, Maria; Kunz, Jürgen; Reinhart, Edeltraut; Schäfer, Wolf-Dieter; Sold, Johanna (2006-01). Saethre-Chotzen syndrome caused by TWIST 1 gene mutations: functional differentiation from Muenke coronal synostosis syndrome. European journal of human genetics: EJHG. Т. 14, № 1. с. 39—48. doi:10.1038/sj.ejhg.5201507. ISSN 1018-4813. PMID 16251895. Архів оригіналу за 21 січня 2022. Процитовано 9 квітня 2021.(англ.)
  11. Howard, T. D.; Paznekas, W. A.; Green, E. D.; Chiang, L. C.; Ma, N.; Ortiz de Luna, R. I.; Garcia Delgado, C.; Gonzalez-Ramos, M.; Kline, A. D. (1997-01-XX). Mutations in TWIST, a basic helix-loop-helix transcription factor, in Saethre-Chotzen syndrome. Nature Genetics. Т. 15, № 1. с. 36—41. doi:10.1038/ng0197-36. ISSN 1061-4036. PMID 8988166. Архів оригіналу за 9 березня 2021. Процитовано 9 квітня 2021.(англ.)
  12. а б Martin, Tracey A.; Goyal, Amit; Watkins, Gareth; Jiang, Wen G. (2005-06). Expression of the transcription factors snail, slug, and twist and their clinical significance in human breast cancer. Annals of Surgical Oncology. Т. 12, № 6. с. 488—496. doi:10.1245/ASO.2005.04.010. ISSN 1068-9265. PMID 15864483. Архів оригіналу за 25 травня 2021. Процитовано 9 квітня 2021.(англ.)
  13. Khan, Md Asaduzzaman; Chen, Han-chun; Zhang, Dianzheng; Fu, Junjiang (2013-10). Twist: a molecular target in cancer therapeutics. Tumour Biology: The Journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine. Т. 34, № 5. с. 2497—2506. doi:10.1007/s13277-013-1002-x. ISSN 1423-0380. PMID 23873099. Архів оригіналу за 25 жовтня 2021. Процитовано 9 квітня 2021.
  14. Puisieux, A.; Valsesia-Wittmann, S.; Ansieau, S. (16 січня 2006). A twist for survival and cancer progression. British Journal of Cancer. Т. 94, № 1. с. 13—17. doi:10.1038/sj.bjc.6602876. ISSN 0007-0920. PMC 2361066. PMID 16306876. Архів оригіналу за 25 травня 2021. Процитовано 9 квітня 2021.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші