ATF2

ATF2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1BHI, 1T2K, 4H36

Ідентифікатори
Символи ATF2, CRE-BP1, CREB-2, CREB2, HB16, TREB7, activating transcription factor 2
Зовнішні ІД OMIM: 123811 MGI: 109349 HomoloGene: 31061 GeneCards: ATF2
Онтологія гена
Молекулярна функція

transferase activity
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
cAMP response element binding protein binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001105 transcription coactivator activity
chromatin binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
nucleic acid binding
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
protein kinase binding
cAMP response element binding
histone acetyltransferase activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
protein heterodimerization activity

Клітинна компонента

цитоплазма
мембрана
нуклеоплазма
мітохондріальна зовнішня мембрана
мітохондрія
клітинне ядро
site of double-strand break

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
mitotic intra-S DNA damage checkpoint signaling
outflow tract morphogenesis
response to water deprivation
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of transforming growth factor beta2 production
transcription, DNA-templated
cellular response to DNA damage stimulus
response to osmotic stress
positive regulation of neuron apoptotic process
regulation of DNA-binding transcription factor activity
positive regulation of mitochondrial membrane permeability involved in apoptotic process
negative regulation of epithelial cell proliferation
adipose tissue development
fat cell differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
amelogenesis
histone acetylation
positive regulation of cardiac muscle myoblast proliferation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
negative regulation of angiogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1386
11909
Ensembl
ENSG00000115966
ENSMUSG00000027104
UniProt
P15336
P16951
RefSeq (мРНК)
NM_001256090
NM_001256091
NM_001256092
NM_001256093
NM_001256094
NM_001880
NM_001025093
NM_001284369
NM_001284370
NM_001284371
NM_001284372
NM_001284373
NM_001284374
NM_001284376
NM_009715
RefSeq (білок)
NP_001243019
NP_001243020
NP_001243021
NP_001243022
NP_001243023
NP_001871
NP_001020264
NP_001271298
NP_001271299
NP_001271300
NP_001271301
NP_001271302
NP_001271303
NP_001271305
NP_033845
Локус (UCSC) Хр. 2: 175.07 – 175.17 Mb Хр. 2: 73.82 – 73.89 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ATF2 (англ. Activating transcription factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 505 амінокислот, а молекулярна маса — 54 537[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKFKLHVNSARQYKDLWNMSDDKPFLCTAPGCGQRFTNEDHLAVHKHKHE
MTLKFGPARNDSVIVADQTPTPTRFLKNCEEVGLFNELASPFENEFKKAS
EDDIKKMPLDLSPLATPIIRSKIEEPSVVETTHQDSPLPHPESTTSDEKE
VPLAQTAQPTSAIVRPASLQVPNVLLTSSDSSVIIQQAVPSPTSSTVITQ
APSSNRPIVPVPGPFPLLLHLPNGQTMPVAIPASITSSNVHVPAAVPLVR
PVTMVPSVPGIPGPSSPQPVQSEAKMRLKAALTQQHPPVTNGDTVKGHGS
GLVRTQSEESRPQSLQQPATSTTETPASPAHTTPQTQSTSGRRRRAANED
PDEKRRKFLERNRAAASRCRQKRKVWVQSLEKKAEDLSSLNGQLQSEVTL
LRNEVAQLKQLLLAHKDCPVTAMQKKSGYHTADKDDSSEDISVPSSPHTE
AIQHSSVSTSNGVSSTSKAEAVATSVLTQMADQSTEPALSQIVMAPSSQS
QPSGS

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kara C.J., Liou H.-C., Ivashkiv L.B., Glimcher L.H. (1990). A cDNA for a human cyclic AMP response element-binding protein which is distinct from CREB and expressed preferentially in brain. Mol. Cell. Biol. 10: 1347—1357. PMID 2320002 DOI:10.1128/MCB.10.4.1347
  • Enslen H., Tokumitsu H., Stork P.J., Davis R.J., Soderling T.R. (1996). Regulation of mitogen-activated protein kinases by a calcium/calmodulin-dependent protein kinase cascade. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 10803—10808. PMID 8855261 DOI:10.1073/pnas.93.20.10803
  • Enslen H., Raingeaud J., Davis R.J. (1998). Selective activation of p38 mitogen-activated protein (MAP) kinase isoforms by the MAP kinase kinases MKK3 and MKK6. J. Biol. Chem. 273: 1741—1748. PMID 9430721 DOI:10.1074/jbc.273.3.1741
  • Sevilla A., Santos C.R., Vega F.M., Lazo P.A. (2004). Human vaccinia-related kinase 1 (VRK1) activates the ATF2 transcriptional activity by novel phosphorylation on Thr-73 and Ser-62 and cooperates with JNK. J. Biol. Chem. 279: 27458—27465. PMID 15105425 DOI:10.1074/jbc.M401009200
  • Bhoumik A., Ronai Z. (2008). ATF2: a transcription factor that elicits oncogenic or tumor suppressor activities. Cell Cycle. 7: 2341—2345. PMID 18677098 DOI:10.4161/cc.6388

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:784 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, P15336 (англ.) . Архів оригіналу за 29 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші