GTF2I

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2D9B, 2DN4, 2ED2, 2EJE

Ідентифікатори

Символи

GTF2I, BAP135, BTKAP1, DIWS, GTFII-I, IB291, SPIN, TFII-I, WBS, WBSCR6, general transcription factor IIi

Зовнішні ІД

OMIM: 601679 MGI: 1202722 HomoloGene: 7748 GeneCards: GTF2I

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mitogen-activated protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента	• neuronal cell body • cell projection • мембрана • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of angiogenesis • transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cytosolic calcium ion concentration • transition between slow and fast fiber • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2969


14886

Ensembl


ENSG00000263001


ENSMUSG00000060261

UniProt


P78347


Q9ESZ8

RefSeq (мРНК)

NM_001163636 NM_001280800 NM_001518 NM_032999 NM_033000
NM_033001

NM_001080746 NM_001080747 NM_001080748 NM_001080749 NM_010365
NM_001359062 NM_001359063 NM_001359064 NM_001359065 NM_001359066 NM_001359067

RefSeq (білок)

NP_001157108 NP_001267729 NP_001509 NP_127492 NP_127493
NP_127494

NP_001074215 NP_001074216 NP_001074217 NP_001074218 NP_034495
NP_001345991 NP_001345992 NP_001345993 NP_001345994 NP_001345995 NP_001345996

Локус (UCSC)

Хр. 7: 74.65 – 74.76 Mb

Хр. 5: 134.24 – 134.31 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GTF2I (англ. General transcription factor IIi) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 998 амінокислот, а молекулярна маса — 112 416^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAQVAMSTLP	VEDEESSESR	MVVTFLMSAL	ESMCKELAKS	KAEVACIAVY
ETDVFVVGTE	RGRAFVNTRK	DFQKDFVKYC	VEEEEKAAEM	HKMKSTTQAN
RMSVDAVEIE	TLRKTVEDYF	CFCYGKALGK	STVVPVPYEK	MLRDQSAVVV
QGLPEGVAFK	HPENYDLATL	KWILENKAGI	SFIIKRPFLE	PKKHVGGRVM
VTDADRSILS	PGGSCGPIKV	KTEPTEDSGI	SLEMAAVTVK	EESEDPDYYQ
YNIQAGPSET	DDVDEKQPLS	KPLQGSHHSS	EGNEGTEMEV	PAEDSTQHVP
SETSEDPEVE	VTIEDDDYSP	PSKRPKANEL	PQPPVPEPAN	AGKRKVREFN
FEKWNARITD	LRKQVEELFE	RKYAQAIKAK	GPVTIPYPLF	QSHVEDLYVE
GLPEGIPFRR	PSTYGIPRLE	RILLAKERIR	FVIKKHELLN	STREDLQLDK
PASGVKEEWY	ARITKLRKMV	DQLFCKKFAE	ALGSTEAKAV	PYQKFEAHPN
DLYVEGLPEN	IPFRSPSWYG	IPRLEKIIQV	GNRIKFVIKR	PELLTHSTTE
VTQPRTNTPV	KEDWNVRITK	LRKQVEEIFN	LKFAQALGLT	EAVKVPYPVF
ESNPEFLYVE	GLPEGIPFRS	PTWFGIPRLE	RIVRGSNKIK	FVVKKPELVI
SYLPPGMASK	INTKALQSPK	RPRSPGSNSK	VPEIEVTVEG	PNNNNPQTSA
VRTPTQTNGS	NVPFKPRGRE	FSFEAWNAKI	TDLKQKVENL	FNEKCGEALG
LKQAVKVPFA	LFESFPEDFY	VEGLPEGVPF	RRPSTFGIPR	LEKILRNKAK
IKFIIKKPEM	FETAIKESTS	SKSPPRKINS	SPNVNTTASG	VEDLNIIQVT
IPDDDNERLS	KVEKARQLRE	QVNDLFSRKF	GEAIGMGFPV	KVPYRKITIN
PGCVVVDGMP	PGVSFKAPSY	LEISSMRRIL	DSAEFIKFTV	IRPFPGLVIN
NQLVDQSESE	GPVIQESAEP	SQLEVPATEE	IKETDGSSQI	KQEPDPTW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Yang W., Desiderio S. (1997). BAP-135, a target for Bruton's tyrosine kinase in response to B cell receptor engagement. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 604—609. PMID 9012831 DOI:10.1073/pnas.94.2.604
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Egloff A.M., Desiderio S. (2001). Identification of phosphorylation sites for Bruton's tyrosine kinase within the transcriptional regulator BAP/TFII-I. J. Biol. Chem. 276: 27806—27815. PMID 11373296 DOI:10.1074/jbc.M103692200
Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4659 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P78347 (англ.) . Архів оригіналу за 13 січня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма