SIX4

SIX4
Ідентифікатори
Символи SIX4, AREC3, SIX homeobox 4
Зовнішні ІД OMIM: 606342 MGI: 106034 HomoloGene: 69089 GeneCards: SIX4
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
transcription regulator complex

Біологічний процес

tongue development
trigeminal ganglion development
sarcomere organization
generation of neurons
regulation of branch elongation involved in ureteric bud branching
negative regulation of apoptotic process
positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
transcription, DNA-templated
multicellular organism development
negative regulation of satellite cell differentiation
pharyngeal system development
anatomical structure morphogenesis
embryonic skeletal system morphogenesis
inner ear morphogenesis
myotome development
fungiform papilla morphogenesis
skeletal muscle fiber differentiation
positive regulation of ureteric bud formation
регуляція експресії генів
embryonic cranial skeleton morphogenesis
GO:1903374 anatomical structure development
regulation of synaptic assembly at neuromuscular junction
olfactory placode formation
myoblast migration
thymus development
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of epithelial cell proliferation
metanephric mesenchyme development
male sex determination
skeletal muscle tissue development
GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
regulation of protein localization
male sex differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
male gonad development
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
protein localization to nucleus

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
51804
20474
Ensembl
ENSG00000100625
ENSMUSG00000034460
UniProt
Q9UIU6
Q61321
RefSeq (мРНК)
NM_017420
NM_011382
NM_001362272
RefSeq (білок)
NP_059116
NP_035512
NP_001349201
Локус (UCSC) Хр. 14: 60.71 – 60.72 Mb Хр. 12: 73.15 – 73.16 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SIX4 (англ. SIX homeobox 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 82 933[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSSSSPTGQIASAADIKQENGMESASEGQEAHREVAGGAAVGLSPPAPAP
FPLEPGDAATAAARVSGEEGAVAAAAAGAAADQVQLHSELLGRHHHAAAA
AAQTPLAFSPDHVACVCEALQQGGNLDRLARFLWSLPQSDLLRGNESLLK
ARALVAFHQGIYPELYSILESHSFESANHPLLQQLWYKARYTEAERARGR
PLGAVDKYRLRRKFPLPRTIWDGEETVYCFKEKSRNALKELYKQNRYPSP
AEKRHLAKITGLSLTQVSNWFKNRRQRDRNPSETQSKSESDGNPSTEDES
SKGHEDLSPHPLSSSSDGITNLSLSSHMEPVYMQQIGNAKISLSSSGVLL
NGSLVPASTSPVFLNGNSFIQGPSGVILNGLNVGNTQAVALNPPKMSSNI
VSNGISMTDILGSTSQDVKEFKVLQSSANSATTTSYSPSVPVSFPGLIPS
TEVKREGIQTVASQDGGSVVTFTTPVQINQYGIVQIPNSGANSQFLNGSI
GFSPLQLPPVSVAASQGNISVSSSTSDGSTFTSESTTVQQGKVFLSSLAP
SAVVYTVPNTGQTIGSVKQEGLERSLVFSQLMPVNQNAQVNANLSSENIS
GSGLHPLASSLVNVSPTHNFSLSPSTLLNPTELNRDIADSQPMSAPVASK
STVTSVSNTNYATLQNCSLITGQDLLSVPMTQAALGEIVPTAEDQVGHPS
PAVHQDFVQEHRLVLQSVANMKENFLSNSESKATSSLMMLDSKSKYVLDG
MVDTVCEDLETDKKELAKLQTVQLDEDMQDL

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10890 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9UIU6 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 14
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші