HMGB3

HMGB3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2EQZ, 2YQI

Ідентифікатори
Символи HMGB3, HMG-2a, HMG-4, HMG2A, HMG4, high mobility group box 3
Зовнішні ІД OMIM: 300193 HomoloGene: 84734 GeneCards: HMGB3
Пов'язані генетичні захворювання
X-linked colobomatous microphthalmia-microcephaly-intellectual disability-short stature syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
double-stranded DNA binding
DNA binding, bending
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
four-way junction DNA binding
RNA binding
transcription factor binding

Клітинна компонента

цитоплазма
клітинне ядро
хромосома

Біологічний процес

multicellular organism development
процес імунної системи
DNA recombination
вроджений імунітет
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
DNA geometric change
negative regulation of B cell differentiation
negative regulation of myeloid cell differentiation
ремоделювання хроматину
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of innate immune response
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3149
688583
Ensembl
ENSG00000029993
н/д
UniProt
O15347
B0BN99
RefSeq (мРНК)
NM_005342
NM_001301228
NM_001301229
NM_001301231
XM_017588410
XM_017588411
XM_017599470
XM_017599471
RefSeq (білок)
NP_001288157
NP_001288158
NP_001288160
NP_005333
NP_001166812
NP_001385705
NP_001385706
Локус (UCSC) Хр. X: 150.98 – 150.99 Mb н/д
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HMGB3 (англ. High mobility group box 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 200 амінокислот, а молекулярна маса — 22 980[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKGDPKKPKGKMSAYAFFVQTCREEHKKKNPEVPVNFAEFSKKCSERWK
TMSGKEKSKFDEMAKADKVRYDREMKDYGPAKGGKKKKDPNAPKRPPSGF
FLFCSEFRPKIKSTNPGISIGDVAKKLGEMWNNLNDSEKQPYITKAAKLK
EKYEKDVADYKSKGKFDGAKGPAKVARKKVEEEDEEEEEEEEEEEEEEDE

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

  • Wilke K., Wiemann S., Gaul R., Gong W., Poustka A. (1997). Isolation of human and mouse HMG2a cDNAs: evidence for an HMG2a-specific 3' untranslated region. Gene. 198: 269—274. PMID 9370291 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00324-7
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Antoine D.J., Harris H.E., Andersson U., Tracey K.J., Bianchi M.E. (2014). A systematic nomenclature for the redox states of high mobility group box (HMGB) proteins. Mol. Med. 20: 135—137. PMID 24531895 DOI:10.2119/molmed.2014.00022

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з HMGB3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5004 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, O15347 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші