IKZF2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | IKZF2, ANF1A2, HELIOS, ZNF1A2, ZNFN1A2, IKAROS family zinc finger 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606234 MGI: 1342541 HomoloGene: 22659 GeneCards: IKZF2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • nucleic acid binding • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0022610 життєдіяльність |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_001079526 NM_016260 NM_001371274 NM_001371275 NM_001371276
| NM_001371277 NM_001387220 |
| |
---|
RefSeq (білок) | NP_001072994 NP_057344 NP_001358203 NP_001358204 NP_001358205
| NP_001358206 |
| NP_035900 NP_001389779 NP_001389781 NP_001389782 NP_001389783
| NP_001389784 NP_001389785 NP_001389786 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 213 – 213.15 Mb | Хр. 1: 69.57 – 69.73 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
IKZF2 (англ. IKAROS family zinc finger 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 526 амінокислот, а молекулярна маса — 59 574[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
METEAIDGYI | | TCDNELSPER | | EHSNMAIDLT | | SSTPNGQHAS | | PSHMTSTNSV |
KLEMQSDEEC | | DRKPLSREDE | | IRGHDEGSSL | | EEPLIESSEV | | ADNRKVQELQ |
GEGGIRLPNG | | KLKCDVCGMV | | CIGPNVLMVH | | KRSHTGERPF | | HCNQCGASFT |
QKGNLLRHIK | | LHSGEKPFKC | | PFCSYACRRR | | DALTGHLRTH | | SVGKPHKCNY |
CGRSYKQRSS | | LEEHKERCHN | | YLQNVSMEAA | | GQVMSHHVPP | | MEDCKEQEPI |
MDNNISLVPF | | ERPAVIEKLT | | GNMGKRKSST | | PQKFVGEKLM | | RFSYPDIHFD |
MNLTYEKEAE | | LMQSHMMDQA | | INNAITYLGA | | EALHPLMQHP | | PSTIAEVAPV |
ISSAYSQVYH | | PNRIERPISR | | ETADSHENNM | | DGPISLIRPK | | SRPQEREASP |
SNSCLDSTDS | | ESSHDDHQSY | | QGHPALNPKR | | KQSPAYMKED | | VKALDTTKAP |
KGSLKDIYKV | | FNGEGEQIRA | | FKCEHCRVLF | | LDHVMYTIHM | | GCHGYRDPLE |
CNICGYRSQD | | RYEFSSHIVR | | GEHTFH |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Hosokawa Y., Maeda Y., Seto M. (1999). Human Helios, an Ikaros-related zinc finger DNA binding protein: cDNA cloning and tissue expression pattern. Immunogenetics. 50: 106—108. PMID 10541817 DOI:10.1007/s002510050696
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Perdomo J., Holmes M., Chong B., Crossley M. (2000). Eos and pegasus, two members of the Ikaros family of proteins with distinct DNA binding activities. J. Biol. Chem. 275: 38347—38354. PMID 10978333 DOI:10.1074/jbc.M005457200
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13177 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q9UKS7 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|