RBL2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4XI9, 5C1D

Ідентифікатори

Символи

RBL2, P130, Rb2, retinoblastoma-like 2, RB transcriptional corepressor like 2, BRUWAG

Зовнішні ІД

OMIM: 180203 MGI: 105085 HomoloGene: 4098 GeneCards: RBL2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• ядерце • екзосома • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма • гіалоплазма • Хроматин
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cell cycle • клітинний цикл • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of lipid kinase activity • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of gene expression • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • regulation of mitotic cell cycle • диференціація клітин • regulation of cell division • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5934


19651

Ensembl


ENSG00000103479


ENSMUSG00000031666

UniProt


Q08999


Q64700

RefSeq (мРНК)


NM_005611 NM_001323608 NM_001323609 NM_001323610 NM_001323611


NM_001282000 NM_001282001 NM_011250

RefSeq (білок)


NP_001310537 NP_001310538 NP_001310539 NP_001310540 NP_005602


NP_001268929 NP_001268930 NP_035380

Локус (UCSC)

Хр. 16: 53.43 – 53.49 Mb

Хр. 8: 91.8 – 91.85 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBL2 (англ. RB transcriptional corepressor like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 139 амінокислот, а молекулярна маса — 128 367^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPSGGDQSPP	PPPPPPAAAA	SDEEEEDDGE	AEDAAPPAES	PTPQIQQRFD
ELCSRLNMDE	AARAEAWDSY	RSMSESYTLE	GNDLHWLACA	LYVACRKSVP
TVSKGTVEGN	YVSLTRILKC	SEQSLIEFFN	KMKKWEDMAN	LPPHFRERTE
RLERNFTVSA	VIFKKYEPIF	QDIFKYPQEE	QPRQQRGRKQ	RRQPCTVSEI
FHFCWVLFIY	AKGNFPMISD	DLVNSYHLLL	CALDLVYGNA	LQCSNRKELV
NPNFKGLSED	FHAKDSKPSS	DPPCIIEKLC	SLHDGLVLEA	KGIKEHFWKP
YIRKLYEKKL	LKGKEENLTG	FLEPGNFGES	FKAINKAYEE	YVLSVGNLDE
RIFLGEDAEE	EIGTLSRCLN	AGSGTETAER	VQMKNILQQH	FDKSKALRIS
TPLTGVRYIK	ENSPCVTPVS	TATHSLSRLH	TMLTGLRNAP	SEKLEQILRT
CSRDPTQAIA	NRLKEMFEIY	SQHFQPDEDF	SNCAKEIASK	HFRFAEMLYY
KVLESVIEQE	QKRLGDMDLS	GILEQDAFHR	SLLACCLEVV	TFSYKPPGNF
PFITEIFDVP	LYHFYKVIEV	FIRAEDGLCR	EVVKHLNQIE	EQILDHLAWK
PESPLWEKIR	DNENRVPTCE	EVMPPQNLER	ADEICIAGSP	LTPRRVTEVR
ADTGGLGRSI	TSPTTLYDRY	SSPPASTTRR	RLFVENDSPS	DGGTPGRMPP
QPLVNAVPVQ	NVSGETVSVT	PVPGQTLVTM	ATATVTANNG	QTVTIPVQGI
ANENGGITFF	PVQVNVGGQA	QAVTGSIQPL	SAQALAGSLS	SQQVTGTTLQ
VPGQVAIQQI	SPGGQQQKQG	QSVTSSSNRP	RKTSSLSLFF	RKVYHLAAVR
LRDLCAKLDI	SDELRKKIWT	CFEFSIIQCP	ELMMDRHLDQ	LLMCAIYVMA
KVTKEDKSFQ	NIMRCYRTQP	QARSQVYRSV	LIKGKRKRRN	SGSSDSRSHQ
NSPTELNKDR	TSRDSSPVMR	SSSTLPVPQP	SSAPPTPTRL	TGANSDMEEE
ERGDLIQFYN	NIYIKQIKTF	AMKYSQANMD	APPLSPYPFV	RTGSPRRIQL
SQNHPVYISP	HKNETMLSPR	EKIFYYFSNS	PSKRLREINS	MIRTGETPTK
KRGILLEDGS	ESPAKRICPE	NHSALLRRLQ	DVANDRGSH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Li Y., Graham C., Lacy S., Duncan A.M.V., Whyte P. (1993). The adenovirus E1A-associated 130-kD protein is encoded by a member of the retinoblastoma gene family and physically interacts with cyclins A and E. Genes Dev. 7: 2366—2377. PMID 8253383 DOI:10.1101/gad.7.12a.2366
Hannon G.J., Demetrick D., Beach D. (1993). Isolation of the Rb-related p130 through its interaction with CDK2 and cyclins. Genes Dev. 7: 2378—2391. PMID 8253384 DOI:10.1101/gad.7.12a.2378
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Baldi A., Boccia V., Claudio P.P., de Luca A., Giordano A. (1996). Genomic structure of the human retinoblastoma-related Rb2/p130 gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 4629—4632. PMID 8643454 DOI:10.1073/pnas.93.10.4629
Canhoto A.J., Chestukhin A., Litovchick L., DeCaprio J.A. (2000). Phosphorylation of the retinoblastoma-related protein p130 in growth-arrested cells. Oncogene. 19: 5116—5122. PMID 11042701 DOI:10.1038/sj.onc.1203893
Tedesco D., Lukas J., Reed S.I. (2002). The pRb-related protein p130 is regulated by phosphorylation-dependent proteolysis via the protein-ubiquitin ligase SCF(Skp2). Genes Dev. 16: 2946—2957. PMID 12435635 DOI:10.1101/gad.1011202

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9894 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q08999 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма