POU4F2

POU4F2
Ідентифікатори
Символи POU4F2, BRN3.2, BRN3B, Brn-3b, POU class 4 homeobox 2
Зовнішні ІД OMIM: 113725 MGI: 102524 HomoloGene: 20959 GeneCards: POU4F2
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001105 transcription coactivator activity
GO:0001106 transcription corepressor activity
promoter-specific chromatin binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
p53 binding

Клітинна компонента

нуклеоплазма
клітинне ядро
nuclear speck
цитоплазма
клітинна мембрана
мембрана
transcription regulator complex

Біологічний процес

GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
аксоноґенеза
neuromuscular process controlling balance
слух
transcription, DNA-templated
MAPK cascade
axon guidance
retina development in camera-type eye
positive regulation of cell differentiation
Сперматогенез
neuron differentiation
axon extension
intracellular estrogen receptor signaling pathway
retinal ganglion cell axon guidance
regulation of signal transduction by p53 class mediator
transcription by RNA polymerase II
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of programmed cell death
negative regulation of cell differentiation
positive regulation of osteoclast differentiation
positive regulation of axon extension
regulation of DNA-binding transcription factor activity
cellular response to cytokine stimulus
cellular response to estradiol stimulus
intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
regulation of retinal ganglion cell axon guidance
negative regulation of amacrine cell differentiation
dorsal root ganglion development
positive regulation of transcription regulatory region DNA binding
GO:0097285 апоптоз
multicellular organism development
диференціація клітин
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
heart development
регуляція експресії генів
positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
cellular response to insulin stimulus
positive regulation of glucose import
cellular response to oxygen levels
negative regulation of adipose tissue development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5458
18997
Ensembl
ENSG00000151615
ENSMUSG00000031688
UniProt
Q12837
Q63934
RefSeq (мРНК)
NM_004575
NM_138944
RefSeq (білок)
NP_004566
NP_620394
Локус (UCSC) Хр. 4: 146.64 – 146.64 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

POU4F2 (англ. POU class 4 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 409 амінокислот, а молекулярна маса — 43 087[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MMMMSLNSKQAFSMPHGGSLHVEPKYSALHSTSPGSSAPIAPSASSPSSS
SNAGGGGGGGGGGGGGGGRSSSSSSSGSSGGGGSEAMRRACLPTPPSNIF
GGLDESLLARAEALAAVDIVSQSKSHHHHPPHHSPFKPDATYHTMNTIPC
TSAASSSSVPISHPSALAGTHHHHHHHHHHHHQPHQALEGELLEHLSPGL
ALGAMAGPDGAVVSTPAHAPHMATMNPMHQAALSMAHAHGLPSHMGCMSD
VDADPRDLEAFAERFKQRRIKLGVTQADVGSALANLKIPGVGSLSQSTIC
RFESLTLSHNNMIALKPILQAWLEEAEKSHREKLTKPELFNGAEKKRKRT
SIAAPEKRSLEAYFAIQPRPSSEKIAAIAEKLDLKKNVVRVWFCNQRQKQ
KRMKYSAGI

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

  • Ring C.J.A., Latchman D.S. (1993). The human Brn-3b POU transcription factor shows only limited homology to the Brn-3a/RDC-1 factor outside the conserved POU domain. Nucleic Acids Res. 21: 2946—2946. PMID 8332509 DOI:10.1093/nar/21.12.2946
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Salichs E., Ledda A., Mularoni L., Alba M.M., de la Luna S. (2009). Genome-wide analysis of histidine repeats reveals their role in the localization of human proteins to the nuclear speckles compartment. PLoS Genet. 5: E1000397—E1000397. PMID 19266028 DOI:10.1371/journal.pgen.1000397
  • Bhargava A.K., Li Z., Weissman S.M. (1993). Differential expression of four members of the POU family of proteins in activated and phorbol 12-myristate 13-acetate-treated Jurkat T cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 10260—10264. PMID 8234287 DOI:10.1073/pnas.90.21.10260
  • Dennis J.H., Budhram-Mahadeo V., Latchman D.S. (2001). The Brn-3b POU family transcription factor regulates the cellular growth, proliferation, and anchorage dependence of MCF7 human breast cancer cells. Oncogene. 20: 4961—4971. PMID 11526481 DOI:10.1038/sj.onc.1204491

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9219 (англ.) . Архів оригіналу за 6 жовтня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q12837 (англ.) . Архів оригіналу за 5 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 4
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші