NFKB2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A3Q, 2D96, 3DO7, 4OT9

Ідентифікатори

Символи

NFKB2, CVID10, H2TF1, LYT-10, LYT10, NF-kB2, p105, p52, p100, p49/p100, nuclear factor kappa B subunit 2

Зовнішні ІД

OMIM: 164012 MGI: 1099800 HomoloGene: 1873 GeneCards: NFKB2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • Bcl3/NF-kappaB2 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• response to cytokine • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • germinal center formation • GO:0010260 старіння людини • extracellular matrix organization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • spleen development • transcription, DNA-templated • follicular dendritic cell differentiation • response to lipopolysaccharide • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • inflammatory response • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription by RNA polymerase II • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4791


18034

Ensembl


ENSG00000077150


ENSMUSG00000025225

UniProt


Q00653


Q9WTK5

RefSeq (мРНК)

NM_001077494 NM_001261403 NM_001288724 NM_002502 NM_001322934
NM_001322935


NM_001177369 NM_001177370 NM_019408

RefSeq (білок)

NP_001070962 NP_001248332 NP_001275653 NP_001309863 NP_001309864
NP_002493


NP_001170840 NP_001170841 NP_062281

Локус (UCSC)

Хр. 10: 102.39 – 102.4 Mb

Хр. 19: 46.29 – 46.3 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NFKB2 (англ. Nuclear factor kappa B subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 900 амінокислот, а молекулярна маса — 96 749^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESCYNPGLD	GIIEYDDFKL	NSSIVEPKEP	APETADGPYL	VIVEQPKQRG
FRFRYGCEGP	SHGGLPGASS	EKGRKTYPTV	KICNYEGPAK	IEVDLVTHSD
PPRAHAHSLV	GKQCSELGIC	AVSVGPKDMT	AQFNNLGVLH	VTKKNMMGTM
IQKLQRQRLR	SRPQGLTEAE	QRELEQEAKE	LKKVMDLSIV	RLRFSAFLRA
SDGSFSLPLK	PVISQPIHDS	KSPGASNLKI	SRMDKTAGSV	RGGDEVYLLC
DKVQKDDIEV	RFYEDDENGW	QAFGDFSPTD	VHKQYAIVFR	TPPYHKMKIE
RPVTVFLQLK	RKRGGDVSDS	KQFTYYPLVE	DKEEVQRKRR	KALPTFSQPF
GGGSHMGGGS	GGAAGGYGGA	GGGGSLGFFP	SSLAYSPYQS	GAGPMGCYPG
GGGGAQMAAT	VPSRDSGEEA	AEPSAPSRTP	QCEPQAPEML	QRAREYNARL
FGLAQRSARA	LLDYGVTADA	RALLAGQRHL	LTAQDENGDT	PLHLAIIHGQ
TSVIEQIVYV	IHHAQDLGVV	NLTNHLHQTP	LHLAVITGQT	SVVSFLLRVG
ADPALLDRHG	DSAMHLALRA	GAGAPELLRA	LLQSGAPAVP	QLLHMPDFEG
LYPVHLAVRA	RSPECLDLLV	DSGAEVEATE	RQGGRTALHL	ATEMEELGLV
THLVTKLRAN	VNARTFAGNT	PLHLAAGLGY	PTLTRLLLKA	GADIHAENEE
PLCPLPSPPT	SDSDSDSEGP	EKDTRSSFRG	HTPLDLTCST	KVKTLLLNAA
QNTMEPPLTP	PSPAGPGLSL	GDTALQNLEQ	LLDGPEAQGS	WAELAERLGL
RSLVDTYRQT	TSPSGSLLRS	YELAGGDLAG	LLEALSDMGL	EEGVRLLRGP
ETRDKLPSTA	EVKEDSAYGS	QSVEQEAEKL	GPPPEPPGGL	CHGHPQPQVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Schmid R.M., Perkins N.D., Duckett C.S., Andrews P.C., Nabel G.J. (1991). Cloning of an NF-kappa B subunit which stimulates HIV transcription in synergy with p65. Nature. 352: 733—736. PMID 1876189 DOI:10.1038/352733a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Liptay S., Schmid R.M., Nabel E.G., Nabel G.J. (1994). Transcriptional regulation of NF-kappa B2: evidence for kappa B-mediated positive and negative autoregulation. Mol. Cell. Biol. 14: 7695—7703. PMID 7969113 DOI:10.1128/MCB.14.12.7695
Li Z., Nabel G.J. (1997). A new member of the IkappaB protein family, IkappaB epsilon, inhibits RelA (p65)-mediated NF-kappaB transcription. Mol. Cell. Biol. 17: 6184—6190. PMID 9315679 DOI:10.1128/MCB.17.10.6184
Heusch M., Lin L., Geleziunas R., Greene W.C. (1999). The generation of nfkb2 p52: mechanism and efficiency. Oncogene. 18: 6201—6208. PMID 10597218 DOI:10.1038/sj.onc.1203022
Betts J.C., Nabel G.J. (1996). Differential regulation of NF-kappaB2(p100) processing and control by amino-terminal sequences. Mol. Cell. Biol. 16: 6363—6371. PMID 8887665 DOI:10.1128/MCB.16.11.6363

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7795 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q00653 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма