ESR1

ESR1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1A52, 1ERE, 1ERR, 1G50, 1GWQ, 1GWR, 1HCP, 1HCQ, 1L2I, 1PCG, 1QKT, 1QKU, 1R5K, 1SJ0, 1UOM, 1X7E, 1X7R, 1XP1, 1XP6, 1XP9, 1XPC, 1XQC, 1YIM, 1YIN, 1ZKY, 2AYR, 2B1V, 2B1Z, 2B23, 2BJ4, 2FAI, 2G44, 2G5O, 2I0J, 2IOG, 2IOK, 2JF9, 2JFA, 2LLO, 2LLQ, 2OCF, 2OUZ, 2P15, 2POG, 2Q6J, 2Q70, 2QA6, 2QA8, 2QAB, 2QE4, 2QGT, 2QGW, 2QH6, 2QR9, 2QSE, 2QXM, 2QXS, 2QZO, 2R6W, 2R6Y, 2YAT, 2YJA, 3CBM, 3CBO, 3CBP, 3DT3, 3ERD, 3ERT, 3HLV, 3HM1, 3L03, 3OS8, 3OS9, 3OSA, 3Q95, 3Q97, 3UU7, 3UUA, 3UUC, 3UUD, 4AA6, 4DMA, 4IU7, 4IUI, 4IV2, 4IV4, 4IVW, 4IVY, 4IW6, 4IW8, 4IWC, 4IWF, 4JC3, 4JDD, 4MG5, 4MG6, 4MG7, 4MG8, 4MG9, 4MGA, 4MGB, 4MGC, 4MGD, 4O6F, 4PP6, 4PPP, 4PPS, 4PXM, 4Q13, 4Q50, 4TUZ, 4TV1, 5AK2, 5AAV, 5ACC, 5AAU, 4XI3, 4ZN9, 5FQS, 5FQR, 5FQP, 5FQT, 5FQV, 4ZN7, 5E0W, 5DUG, 4ZUC, 5DXK, 5E19, 5DXQ, 5EI1, 5DXR, 5DVS, 5DZ1, 5E0X, 5DKB, 5DWI, 5E14, 5DXB, 5BPR, 5EIT, 5E15, 4ZNS, 5EGV, 5DL4, 5DWE, 4ZNT, 5EHJ, 5DYD, 5DWG, 4ZNV, 5DWJ, 5DID, 4ZUB, 5BNU, 5DMC, 5DK9, 5DIG, 5DUH, 5DKS, 5DMF, 5DU5, 5DY8, 4ZWH, 5DVV, 5DLR, 4ZWK, 5DRM, 5DP0, 5DKE, 5DZI, 5DZ3, 4ZNU, 5DIE, 5DZ0, 5E1C, 5HYR, 5BQ4, 4ZNW, 5DUE, 5DTV, 5DRJ, 5DKG, 4ZNH, 5BP6, 5DXG, 5DI7, 5DX3, 5DYB, 5DXP, 5DZH, 5DXM

Ідентифікатори
Символи ESR1, ER, ESR, ESRA, ESTRR, Era, NR3A1, estrogen receptor 1
Зовнішні ІД OMIM: 133430 MGI: 1352467 HomoloGene: 47906 GeneCards: ESR1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, рак молочної залози, alcohol dependence, breast carcinoma[1]
Реагує на сполуку
Естрадіол, діетилстільбестрол, estriol, estrone, ethinylestradiol, raloxifene, тамоксифен, lasofoxifene, bazedoxifene, hexestrol, fosfestrol, acolbifene, tamoxifen citrate, droloxifene[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
nitric-oxide synthase regulator activity
GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
estrogen response element binding
transcription factor binding
зв'язування з іоном металу
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
steroid hormone receptor activity
steroid binding
beta-catenin binding
zinc ion binding
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
ATPase binding
identical protein binding
lipid binding
core promoter sequence-specific DNA binding
enzyme binding
protein kinase binding
TFIIB-class transcription factor binding
TBP-class protein binding
estrogen receptor activity
estrogen receptor binding
transcription coactivator binding
phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
мембрана
клітинне ядро
integral component of membrane
комплекс Ґольджі
клітинна мембрана
нуклеоплазма
transcription preinitiation complex
гіалоплазма
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

epithelial cell development
positive regulation of phospholipase C activity
mammary gland alveolus development
transcription by RNA polymerase II
phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway
epithelial cell proliferation involved in mammary gland duct elongation
prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis
protein localization to chromatin
steroid hormone mediated signaling pathway
regulation of apoptotic process
ремоделювання хроматину
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
androgen metabolic process
positive regulation of fibroblast proliferation
mammary gland branching involved in pregnancy
negative regulation of gene expression
transcription, DNA-templated
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
cellular response to estrogen stimulus
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of nitric-oxide synthase activity
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis
male gonad development
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
response to estrogen
uterus development
prostate epithelial cord elongation
antral ovarian follicle growth
vagina development
positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
positive regulation of nitric oxide biosynthetic process
GO:0072468 сигнальна трансдукція
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
intracellular steroid hormone receptor signaling pathway
regulation of inflammatory response
response to estradiol
regulation of toll-like receptor signaling pathway
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
protein deubiquitination
cellular response to estradiol stimulus
intracellular estrogen receptor signaling pathway
positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly
stem cell differentiation
regulation of Wnt signaling pathway
regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway
phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process
positive regulation of protein kinase B signaling

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2099
13982
Ensembl
ENSG00000091831
ENSMUSG00000019768
UniProt
P03372
P19785
RefSeq (мРНК)
NM_000125
NM_001122740
NM_001122741
NM_001122742
NM_001291230
NM_001291241
NM_001328100
NM_001385568
NM_001385569
NM_001385570
NM_001385571
NM_001385572
NM_007956
NM_001302531
NM_001302532
NM_001302533
RefSeq (білок)
NP_000116
NP_001116212
NP_001116213
NP_001116214
NP_001278159
NP_001278170
NP_001315029
NP_001289460
NP_001289461
NP_001289462
NP_031982
Локус (UCSC) Хр. 6: 151.66 – 152.13 Mb Хр. 10: 4.56 – 4.96 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ESR1 (англ. Estrogen receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 66 216[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTMTLHTKASGMALLHQIQGNELEPLNRPQLKIPLERPLGEVYLDSSKPA
VYNYPEGAAYEFNAAAAANAQVYGQTGLPYGPGSEAAAFGSNGLGGFPPL
NSVSPSPLMLLHPPPQLSPFLQPHGQQVPYYLENEPSGYTVREAGPPAFY
RPNSDNRRQGGRERLASTNDKGSMAMESAKETRYCAVCNDYASGYHYGVW
SCEGCKAFFKRSIQGHNDYMCPATNQCTIDKNRRKSCQACRLRKCYEVGM
MKGGIRKDRRGGRMLKHKRQRDDGEGRGEVGSAGDMRAANLWPSPLMIKR
SKKNSLALSLTADQMVSALLDAEPPILYSEYDPTRPFSEASMMGLLTNLA
DRELVHMINWAKRVPGFVDLTLHDQVHLLECAWLEILMIGLVWRSMEHPG
KLLFAPNLLLDRNQGKCVEGMVEIFDMLLATSSRFRMMNLQGEEFVCLKS
IILLNSGVYTFLSSTLKSLEEKDHIHRVLDKITDTLIHLMAKAGLTLQQQ
HQRLAQLLLILSHIRHMSNKGMEHLYSMKCKNVVPLYDLLLEMLDAHRLH
APTSRGGASVEETDQSHLATAGSTSSHSLQKYYITGEAEGFPATV

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку, ДНК, стероїдами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, апараті гольджі.

Література

  • Pink J.J., Wu S.Q., Wolf D.M., Bilimoria M.M., Jordan V.C. (1996). A novel 80 kDa human estrogen receptor containing a duplication of exons 6 and 7. Nucleic Acids Res. 24: 962—969. PMID 8600466 DOI:10.1093/nar/24.5.962
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Joel P.B., Traish A.M., Lannigan D.A. (1995). Estradiol and phorbol ester cause phosphorylation of serine 118 in the human estrogen receptor. Mol. Endocrinol. 9: 1041—1052. PMID 7476978 DOI:10.1210/mend.9.8.7476978
  • Schubert E.L., Lee M.K., Newman B., King M.C. (1999). Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the estrogen receptor gene and breast cancer susceptibility. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 71: 21—27. PMID 10619354 DOI:10.1016/S0960-0760(99)00126-0
  • Arnold S.F., Obourn J.D., Jaffe H., Notides A.C. (1995). Phosphorylation of the human estrogen receptor on tyrosine 537 in vivo and by src family tyrosine kinases in vitro. Mol. Endocrinol. 9: 24—33. PMID 7539106 DOI:10.1210/mend.9.1.7539106
  • Arnold S.F., Obourn J.D., Jaffe H., Notides A.C. (1994). Serine 167 is the major estradiol-induced phosphorylation site on the human estrogen receptor. Mol. Endocrinol. 8: 1208—1214. PMID 7838153 DOI:10.1210/mend.8.9.7838153

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ESR1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з estrogen receptor 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3467 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
  6. UniProt, P03372 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші