TAF3 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF3, TAF140, TAFII-140, TAFII140, TATA-box binding protein associated factor 3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 606576 MGI: 2388097 HomoloGene: 35415 GeneCards: TAF3 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма • Ядерна мембрана • transcription factor TFIID complex |
---|
Біологічний процес | • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • maintenance of protein location in nucleus • transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 7.82 – 8.02 Mb | Хр. 2: 9.92 – 10.05 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF3 (англ. TATA-box binding protein associated factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 929 амінокислот, а молекулярна маса — 103 582[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MCESYSRSLL | | RVSVAQICQA | | LGWDSVQLSA | | CHLLTDVLQR | | YLQQLGRGCH |
RYSELYGRTD | | PILDDVGEAF | | QLMGVSLHEL | | EDYIHNIEPV | | TFPHQIPSFP |
VSKNNVLQFP | | QPGSKDAEER | | KEYIPDYLPP | | IVSSQEEEEE | | EQVPTDGGTS |
AEAMQVPLEE | | DDELEEEEII | | NDENFLGKRP | | LDSPEAEELP | | AMKRPRLLST |
KGDTLDVVLL | | EAREPLSSIN | | TQKIPPMLSP | | VHVQDSTDLA | | PPSPEPPMLA |
PVAKSQMPTA | | KPLETKSFTP | | KTKTKTSSPG | | QKTKSPKTAQ | | SPAMVGSPIR |
SPKTVSKEKK | | SPGRSKSPKS | | PKSPKVTTHI | | PQTPVRPETP | | NRTPSATLSE |
KISKETIQVK | | QIQTPPDAGK | | LNSENQPKKA | | VVADKTIEAS | | IDAVIARACA |
EREPDPFEFS | | SGSESEGDIF | | TSPKRISGPE | | CTTPKASTSA | | NNFTKSGSTP |
LPLSGGTSSS | | DNSWTMDASI | | DEVVRKAKLG | | TPSNMPPNFP | | YISSPSVSPP |
TPEPLHKVYE | | EKTKLPSSVE | | VKKKLKKELK | | TKMKKKEKQR | | DREREKDKNK |
DKSKEKDKVK | | EKEKDKETGR | | ETKYPWKEFL | | KEEEADPYKF | | KIKEFEDVDP |
KVKLKDGLVR | | KEKEKHKDKK | | KDREKGKKDK | | DKREKEKVKD | | KGREDKMKAP |
APPLVLPPKE | | LALPLFSPAT | | ASRVPAMLPS | | LLPVLPEKLF | | EEKEKVKEKE |
KKKDKKEKKK | | KKEKEKEKKE | | KEREKEKRER | | EKREKEKEKH | | KHEKIKVEPV |
ALAPSPVIPR | | LTLRVGAGQD | | KIVISKVVPA | | PEAKPAPSQN | | RPKTPPPAPA |
PAPGPMLVSP | | APVPLPLLAQ | | AAAGPALLPS | | PGPAASGASA | | KAPVRSVVTE |
TVSTYVIRDE | | WGNQIWICPG | | CNKPDDGSPM | | IGCDDCDDWY | | HWPCVGIMTA |
PPEEMQWFCP | | KCANKKKDKK | | HKKRKHRAH |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17303 (англ.) . Архів оригіналу за 22 квітня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5VWG9 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|