DLX2

DLX2
Ідентифікатори
Символи DLX2, TES-1, TES1, AW121999, Dlx-2, distal-less homeobox 2
Зовнішні ІД OMIM: 126255 MGI: 94902 HomoloGene: 3244 GeneCards: DLX2
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
single-stranded RNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding

Клітинна компонента

клітинне ядро

Біологічний процес

cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation
proximal/distal pattern formation
диференціація клітин
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
branching morphogenesis of a nerve
embryonic skeletal system development
multicellular organism development
odontogenesis of dentin-containing tooth
cerebral cortex GABAergic interneuron fate commitment
cartilage development
brain development
negative regulation of oligodendrocyte differentiation
forebrain neuron differentiation
embryonic cranial skeleton morphogenesis
olfactory bulb development
hippocampus development
subpallium development
negative regulation of Notch signaling pathway
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of cell differentiation
negative regulation of photoreceptor cell differentiation
positive regulation of amacrine cell differentiation
transcription, DNA-templated

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1746
13392
Ensembl
ENSG00000115844
ENSMUSG00000023391
UniProt
Q07687
P40764
RefSeq (мРНК)
NM_004405
NM_010054
RefSeq (білок)
NP_004396
NP_004396.1
NP_034184
Локус (UCSC) Хр. 2: 172.1 – 172.1 Mb Хр. 2: 71.37 – 71.38 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DLX2 (англ. Distal-less homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 34 243[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTGVFDSLVADMHSTQIAASSTYHQHQQPPSGGGAGPGGNSSSSSSLHKP
QESPTLPVSTATDSSYYTNQQHPAGGGGGGGSPYAHMGSYQYQASGLNNV
PYSAKSSYDLGYTAAYTSYAPYGTSSSPANNEPEKEDLEPEIRIVNGKPK
KVRKPRTIYSSFQLAALQRRFQKTQYLALPERAELAASLGLTQTQVKIWF
QNRRSKFKKMWKSGEIPSEQHPGASASPPCASPPVSAPASWDFGVPQRMA
GGGGPGSGGSGAGSSGSSPSSAASAFLGNYPWYHQTSGSASHLQATAPLL
HPTQTPQPHHHHHHHGGGGAPVSAGTIF

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Selski D.J., Thomas N.E., Coleman P.D., Rogers K.E. (1993). The human brain homeogene, DLX-2: cDNA sequence and alignment with the murine homologue. Gene. 132: 301—303. PMID 7901126 DOI:10.1016/0378-1119(93)90212-L

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2915 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q07687 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші